MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-3 DNA

Total Repeats: 423

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020826	TGA	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020826	TTA	3	9	216	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020826	CAA	2	6	295	300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279728
4	NC_020826	ACC	2	6	424	429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279728
5	NC_020826	GGC	2	6	483	488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279728
6	NC_020826	TTC	2	6	550	555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279728
7	NC_020826	CGC	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279728
8	NC_020826	TGA	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279728
9	NC_020826	CGC	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279728
10	NC_020826	GTC	2	6	1441	1446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279729
11	NC_020826	ATC	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279729
12	NC_020826	CTG	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279729
13	NC_020826	TTG	2	6	1593	1598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279729
14	NC_020826	AAT	2	6	1653	1658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279729
15	NC_020826	GTT	2	6	1779	1784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279729
16	NC_020826	AAT	2	6	1897	1902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279729
17	NC_020826	TAA	3	9	2094	2102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020826	GAT	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020826	CTA	2	6	2196	2201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020826	ATT	2	6	2404	2409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
21	NC_020826	AAT	2	6	2458	2463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279730
22	NC_020826	CAT	2	6	2535	2540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
23	NC_020826	GGA	2	6	2660	2665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279730
24	NC_020826	TAA	2	6	2769	2774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279730
25	NC_020826	TCA	2	6	2813	2818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
26	NC_020826	ATT	2	6	2822	2827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
27	NC_020826	TAA	2	6	2972	2977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279730
28	NC_020826	TTC	2	6	2983	2988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279730
29	NC_020826	AAC	2	6	3016	3021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279730
30	NC_020826	CAT	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
31	NC_020826	TTA	2	6	3305	3310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
32	NC_020826	TCT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279730
33	NC_020826	ATA	2	6	3438	3443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279730
34	NC_020826	ATC	2	6	3466	3471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
35	NC_020826	CAA	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279730
36	NC_020826	TCA	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
37	NC_020826	TTC	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279730
38	NC_020826	ATT	2	6	3739	3744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
39	NC_020826	CTT	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279730
40	NC_020826	TTA	2	6	3947	3952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
41	NC_020826	GTC	2	6	3956	3961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279730
42	NC_020826	TAT	2	6	4032	4037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
43	NC_020826	CTG	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279730
44	NC_020826	CCG	3	9	4056	4064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279730
45	NC_020826	TCA	2	6	4097	4102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
46	NC_020826	GCT	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279731
47	NC_020826	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279731
48	NC_020826	ATC	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279731
49	NC_020826	ATT	2	6	4747	4752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279731
50	NC_020826	AAT	2	6	4796	4801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279731
51	NC_020826	AAG	2	6	4818	4823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279731
52	NC_020826	CAA	2	6	5156	5161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279732
53	NC_020826	TAA	2	6	5171	5176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279732
54	NC_020826	GTC	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279732
55	NC_020826	CAT	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279732
56	NC_020826	AGT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279732
57	NC_020826	TCA	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279732
58	NC_020826	TGT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279732
59	NC_020826	TTC	2	6	5457	5462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279732
60	NC_020826	TAT	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279732
61	NC_020826	TTA	2	6	5644	5649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279732
62	NC_020826	ATT	2	6	5739	5744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279732
63	NC_020826	AAT	2	6	5871	5876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279732
64	NC_020826	AAG	2	6	5894	5899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279732
65	NC_020826	GGT	2	6	6099	6104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020826	ATT	2	6	6291	6296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020826	TTA	2	6	6676	6681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279734
68	NC_020826	CAG	2	6	6705	6710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279734
69	NC_020826	TGC	2	6	6724	6729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279734
70	NC_020826	GTT	2	6	6772	6777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279734
71	NC_020826	CAA	2	6	6798	6803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279734
72	NC_020826	TGC	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279734
73	NC_020826	GAA	2	6	6941	6946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279734
74	NC_020826	ATT	2	6	6949	6954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279734
75	NC_020826	AAT	2	6	7007	7012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279734
76	NC_020826	GAA	2	6	7043	7048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279734
77	NC_020826	ACA	2	6	7061	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279734
78	NC_020826	GCT	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
79	NC_020826	TCA	2	6	7389	7394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279735
80	NC_020826	ATT	2	6	7426	7431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279735
81	NC_020826	TGG	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279735
82	NC_020826	TGC	2	6	7585	7590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
83	NC_020826	ATT	2	6	7783	7788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279735
84	NC_020826	TTA	2	6	7790	7795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279735
85	NC_020826	AAT	2	6	7843	7848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279735
86	NC_020826	CAT	2	6	7956	7961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279735
87	NC_020826	TAT	2	6	8068	8073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279735
88	NC_020826	GAA	2	6	8312	8317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279735
89	NC_020826	TGC	2	6	8347	8352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
90	NC_020826	ACA	2	6	8403	8408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279735
91	NC_020826	CAG	2	6	8494	8499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279735
92	NC_020826	CAA	2	6	8550	8555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279735
93	NC_020826	TTG	2	6	8571	8576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279735
94	NC_020826	TGC	2	6	8578	8583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
95	NC_020826	GGC	2	6	8663	8668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279735
96	NC_020826	GCT	2	6	8720	8725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
97	NC_020826	CAA	2	6	8735	8740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279735
98	NC_020826	TGC	2	6	8794	8799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
99	NC_020826	ACT	2	6	8867	8872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279735
100	NC_020826	ATG	2	6	8931	8936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279735
101	NC_020826	GTA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279735
102	NC_020826	TAA	2	6	9067	9072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279735
103	NC_020826	ACA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279735
104	NC_020826	CAT	2	6	9220	9225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279736
105	NC_020826	AAT	2	6	9296	9301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279736
106	NC_020826	TCA	2	6	9513	9518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279736
107	NC_020826	GAA	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279736
108	NC_020826	ACT	2	6	9543	9548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279736
109	NC_020826	ATT	2	6	9550	9555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279736
110	NC_020826	TTA	2	6	9784	9789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279736
111	NC_020826	AAC	2	6	10129	10134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279737
112	NC_020826	GCG	2	6	10304	10309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279737
113	NC_020826	GTT	2	6	10315	10320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279737
114	NC_020826	CCA	2	6	10331	10336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279737
115	NC_020826	GTA	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020826	CAT	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020826	CAG	2	6	10521	10526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020826	TAA	2	6	10560	10565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279738
119	NC_020826	GTA	2	6	10677	10682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279738
120	NC_020826	AGA	2	6	10766	10771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279738
121	NC_020826	TAA	2	6	10898	10903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020826	ATC	2	6	11169	11174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020826	GAG	2	6	11259	11264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020826	ATG	2	6	11344	11349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020826	CAA	2	6	11380	11385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020826	GTT	2	6	11459	11464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020826	CTT	2	6	11505	11510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020826	ATT	2	6	11512	11517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020826	ATT	2	6	11708	11713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020826	TTG	2	6	11728	11733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020826	CTT	2	6	11828	11833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279739
132	NC_020826	TAT	2	6	11912	11917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279739
133	NC_020826	AAC	2	6	12029	12034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279740
134	NC_020826	AAT	2	6	12053	12058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
135	NC_020826	AGC	2	6	12127	12132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279740
136	NC_020826	TAA	2	6	12188	12193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
137	NC_020826	TAC	2	6	12224	12229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279740
138	NC_020826	TAA	2	6	12292	12297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
139	NC_020826	ACA	2	6	12351	12356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279740
140	NC_020826	GAT	2	6	12393	12398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279740
141	NC_020826	AGC	2	6	12413	12418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279740
142	NC_020826	CAA	2	6	12653	12658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279740
143	NC_020826	AAT	2	6	12659	12664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
144	NC_020826	CCA	2	6	12727	12732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279740
145	NC_020826	TAT	2	6	12755	12760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279740
146	NC_020826	TAA	2	6	13066	13071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
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149	NC_020826	ATC	2	6	13630	13635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279741
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153	NC_020826	AAT	2	6	13825	13830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279741
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157	NC_020826	ATG	2	6	14308	14313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279741
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161	NC_020826	GAA	2	6	14558	14563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279741
162	NC_020826	TCA	2	6	14648	14653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279741
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164	NC_020826	ATT	2	6	14728	14733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279741
165	NC_020826	AGT	2	6	14855	14860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279741
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234	NC_020826	ACC	2	6	19510	19515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279744
235	NC_020826	ATA	2	6	19525	19530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279744
236	NC_020826	TCA	2	6	19664	19669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279744
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238	NC_020826	TAA	2	6	19788	19793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279744
239	NC_020826	AAT	3	9	19871	19879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279744
240	NC_020826	ATC	2	6	19915	19920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279744
241	NC_020826	AGC	2	6	19951	19956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279744
242	NC_020826	CTT	2	6	20004	20009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279744
243	NC_020826	TCT	2	6	20072	20077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279744
244	NC_020826	TCA	2	6	20079	20084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279744
245	NC_020826	TGG	2	6	20178	20183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
246	NC_020826	ACC	2	6	20197	20202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
247	NC_020826	AAT	2	6	20292	20297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_020826	GTT	2	6	20367	20372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_020826	ATT	2	6	20424	20429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_020826	CTT	2	6	20458	20463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_020826	ATC	2	6	20473	20478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_020826	TTA	2	6	20544	20549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_020826	CAA	2	6	20645	20650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_020826	TAA	2	6	20918	20923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279745
255	NC_020826	GCA	2	6	20955	20960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279745
256	NC_020826	TTA	2	6	20976	20981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279745
257	NC_020826	ACA	2	6	21085	21090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279745
258	NC_020826	CAT	2	6	21175	21180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279745
259	NC_020826	ATC	2	6	21221	21226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279745
260	NC_020826	CTG	2	6	21271	21276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279745
261	NC_020826	ATT	2	6	21291	21296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279745
262	NC_020826	ACT	2	6	21536	21541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279745
263	NC_020826	AAG	2	6	21825	21830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_020826	AAT	2	6	21886	21891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279746
265	NC_020826	TGT	3	9	21942	21950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279746
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269	NC_020826	CAT	2	6	22272	22277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279747
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271	NC_020826	CTT	2	6	22410	22415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279747
272	NC_020826	TTG	2	6	22460	22465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279747
273	NC_020826	CCA	2	6	22718	22723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279747
274	NC_020826	AAT	2	6	22821	22826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279747
275	NC_020826	TGA	2	6	22859	22864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279747
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277	NC_020826	CTT	2	6	23011	23016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279747
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281	NC_020826	GTT	2	6	23539	23544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020826	GCG	2	6	23857	23862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279749
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287	NC_020826	CTT	2	6	24241	24246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279749
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290	NC_020826	GCG	2	6	24331	24336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279749
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385	NC_020826	TGT	2	6	32683	32688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_020826	GTA	2	6	32779	32784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
388	NC_020826	GTG	2	6	32816	32821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
389	NC_020826	GTT	2	6	32867	32872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279759
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422	NC_020826	CCT	2	6	35237	35242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_020826	ATT	2	6	35277	35282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.