MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-9 DNA

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020825	AAG	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279721
2	NC_020825	CTC	2	6	807	812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279722
3	NC_020825	TCA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279722
4	NC_020825	AAT	2	6	974	979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279722
5	NC_020825	TCT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279722
6	NC_020825	CTT	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279722
7	NC_020825	TCA	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279722
8	NC_020825	GAA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279723
9	NC_020825	AAT	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279723
10	NC_020825	CTA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279723
11	NC_020825	TTG	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279723
12	NC_020825	GTA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279723
13	NC_020825	TCG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
14	NC_020825	TTC	2	6	1902	1907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279724
15	NC_020825	TTG	2	6	1923	1928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279724
16	NC_020825	CGT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
17	NC_020825	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
18	NC_020825	GCT	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
19	NC_020825	GTT	2	6	2129	2134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279724
20	NC_020825	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279724
21	NC_020825	GAT	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279724
22	NC_020825	ATT	2	6	2367	2372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279724
23	NC_020825	CTG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
24	NC_020825	CTT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279724
25	NC_020825	ATT	2	6	2929	2934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279724
26	NC_020825	TGA	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279724
27	NC_020825	GCC	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279725
28	NC_020825	ACG	2	6	3630	3635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279725
29	NC_020825	ACC	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279725
30	NC_020825	TTA	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279725
31	NC_020825	GAC	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279725
32	NC_020825	AAG	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279726
33	NC_020825	AAT	2	6	5150	5155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279726
34	NC_020825	GTA	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279726
35	NC_020825	CAC	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279726
36	NC_020825	TCC	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279726
37	NC_020825	TAA	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279726
38	NC_020825	CCT	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279726

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.