MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-7 DNA

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020824	AGTA	2	8	860	867	50 %	25 %	25 %	0 %	472279710
2	NC_020824	GAGT	2	8	1253	1260	25 %	25 %	50 %	0 %	472279711
3	NC_020824	TTCA	2	8	1324	1331	25 %	50 %	0 %	25 %	472279711
4	NC_020824	TTCC	2	8	1442	1449	0 %	50 %	0 %	50 %	472279711
5	NC_020824	AATT	2	8	1524	1531	50 %	50 %	0 %	0 %	472279711
6	NC_020824	CAAG	2	8	1666	1673	50 %	0 %	25 %	25 %	472279711
7	NC_020824	CAAA	2	8	1959	1966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020824	TTTC	2	8	1991	1998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020824	TAAC	2	8	2022	2029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020824	TGCT	2	8	2127	2134	0 %	50 %	25 %	25 %	472279712
11	NC_020824	AACG	2	8	2645	2652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020824	AATT	2	8	2974	2981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020824	ATTT	2	8	3080	3087	25 %	75 %	0 %	0 %	472279713
14	NC_020824	CAAG	2	8	3883	3890	50 %	0 %	25 %	25 %	472279713
15	NC_020824	AAAG	2	8	4225	4232	75 %	0 %	25 %	0 %	472279714
16	NC_020824	ACAA	2	8	4278	4285	75 %	0 %	0 %	25 %	472279714
17	NC_020824	ACAA	2	8	4374	4381	75 %	0 %	0 %	25 %	472279714
18	NC_020824	CGAA	2	8	4684	4691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020824	CATC	2	8	5130	5137	25 %	25 %	0 %	50 %	472279715
20	NC_020824	TTAT	2	8	5341	5348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020824	TAAA	2	8	5408	5415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020824	TTTA	2	8	5429	5436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020824	TATT	2	8	5718	5725	25 %	75 %	0 %	0 %	472279716
24	NC_020824	GAAT	2	8	6089	6096	50 %	25 %	25 %	0 %	472279716
25	NC_020824	CTTT	2	8	6997	7004	0 %	75 %	0 %	25 %	472279717
26	NC_020824	AAAG	2	8	7194	7201	75 %	0 %	25 %	0 %	472279717
27	NC_020824	TCCA	2	8	7361	7368	25 %	25 %	0 %	50 %	472279717
28	NC_020824	CTTG	2	8	7619	7626	0 %	50 %	25 %	25 %	472279717
29	NC_020824	ACTG	2	8	8143	8150	25 %	25 %	25 %	25 %	472279717
30	NC_020824	AAAC	2	8	8285	8292	75 %	0 %	0 %	25 %	472279717
31	NC_020824	CATA	2	8	8706	8713	50 %	25 %	0 %	25 %	472279717
32	NC_020824	ATTT	2	8	9040	9047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020824	ATAA	2	8	9142	9149	75 %	25 %	0 %	0 %	472279718
34	NC_020824	AGTC	2	8	9400	9407	25 %	25 %	25 %	25 %	472279719
35	NC_020824	TAAC	2	8	9514	9521	50 %	25 %	0 %	25 %	472279719

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.