MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-7 DNA

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020824	CCT	2	6	3	8	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020824	TAC	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020824	ATA	2	6	33	38	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020824	CAA	2	6	100	105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020824	AAG	2	6	172	177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020824	AAT	2	6	204	209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020824	TAC	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020824	GAT	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020824	ACC	2	6	596	601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279710
10	NC_020824	ACC	2	6	614	619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279710
11	NC_020824	AGT	2	6	824	829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279710
12	NC_020824	TGT	2	6	895	900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279710
13	NC_020824	CCT	2	6	926	931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020824	AGA	2	6	1000	1005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020824	TTG	2	6	1079	1084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020824	ATG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020824	AGT	2	6	1148	1153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020824	ATT	2	6	1161	1166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020824	CTT	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020824	GCT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279711
21	NC_020824	TGT	2	6	1724	1729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020824	GTT	2	6	1869	1874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020824	AAC	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020824	AAT	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020824	TGA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279712
26	NC_020824	TGA	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279712
27	NC_020824	AAG	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279712
28	NC_020824	ATT	2	6	2255	2260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279712
29	NC_020824	CTG	2	6	2353	2358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020824	TTA	2	6	2404	2409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020824	GTG	2	6	2749	2754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020824	ACT	2	6	2951	2956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020824	AGG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020824	ATT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279713
35	NC_020824	AGA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
36	NC_020824	AGT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279713
37	NC_020824	AGA	2	6	3495	3500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
38	NC_020824	AGA	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
39	NC_020824	AAG	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
40	NC_020824	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279714
41	NC_020824	CAA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
42	NC_020824	TCA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279714
43	NC_020824	CAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
44	NC_020824	GAT	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279714
45	NC_020824	GAC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279714
46	NC_020824	CAA	2	6	4256	4261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
47	NC_020824	GAA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279714
48	NC_020824	ATA	2	6	4347	4352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279714
49	NC_020824	AAG	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279714
50	NC_020824	GTG	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279714
51	NC_020824	AGA	2	6	4469	4474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020824	ATT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020824	TGG	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020824	ATT	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020824	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279715
56	NC_020824	ATC	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279715
57	NC_020824	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279715
58	NC_020824	GTT	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279715
59	NC_020824	TTC	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279715
60	NC_020824	TTA	2	6	5287	5292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020824	TAA	3	9	5794	5802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279716
62	NC_020824	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279716
63	NC_020824	CTG	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279716
64	NC_020824	CAA	2	6	6067	6072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279716
65	NC_020824	TTA	2	6	6073	6078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279716
66	NC_020824	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279716
67	NC_020824	TTA	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020824	GCG	2	6	6448	6453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279717
69	NC_020824	AAG	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279717
70	NC_020824	ACC	2	6	6552	6557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279717
71	NC_020824	TCA	3	9	6598	6606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
72	NC_020824	TAA	2	6	6658	6663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
73	NC_020824	TAA	2	6	6668	6673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
74	NC_020824	GTT	2	6	6690	6695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
75	NC_020824	TTA	2	6	6769	6774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279717
76	NC_020824	TCT	2	6	6835	6840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279717
77	NC_020824	CAT	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
78	NC_020824	AGT	2	6	6966	6971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279717
79	NC_020824	GAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279717
80	NC_020824	GTT	2	6	7118	7123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
81	NC_020824	CAG	2	6	7124	7129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
82	NC_020824	TCT	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279717
83	NC_020824	TTG	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
84	NC_020824	CAA	2	6	7382	7387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279717
85	NC_020824	TAC	2	6	7505	7510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
86	NC_020824	TTC	2	6	7641	7646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279717
87	NC_020824	GCT	2	6	7792	7797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279717
88	NC_020824	AGC	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
89	NC_020824	TAA	2	6	7884	7889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
90	NC_020824	CAG	2	6	7910	7915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
91	NC_020824	AGG	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279717
92	NC_020824	AAT	2	6	8037	8042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
93	NC_020824	ATA	2	6	8106	8111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
94	NC_020824	TGT	2	6	8242	8247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
95	NC_020824	CCA	2	6	8272	8277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279717
96	NC_020824	CAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279717
97	NC_020824	ATA	2	6	8317	8322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
98	NC_020824	CAG	3	9	8381	8389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
99	NC_020824	TAG	2	6	8396	8401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279717
100	NC_020824	ATT	2	6	8458	8463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279717
101	NC_020824	AAC	2	6	8466	8471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279717
102	NC_020824	TTA	2	6	8497	8502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279717
103	NC_020824	TTG	2	6	8668	8673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
104	NC_020824	TGT	2	6	8728	8733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
105	NC_020824	CCT	2	6	8796	8801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_020824	ATT	2	6	8807	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020824	ATT	2	6	8890	8895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020824	TCA	2	6	9125	9130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279718
109	NC_020824	CAA	2	6	9273	9278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279718
110	NC_020824	CTT	2	6	9442	9447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279719
111	NC_020824	ATT	2	6	9500	9505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279719
112	NC_020824	TAA	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279719
113	NC_020824	CCT	2	6	9653	9658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020824	TAC	2	6	9674	9679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020824	ATA	2	6	9683	9688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020824	CAA	2	6	9750	9755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020824	AAG	2	6	9822	9827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020824	AAT	2	6	9854	9859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020824	TAC	2	6	10042	10047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020824	GAT	2	6	10110	10115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020824	ACC	2	6	10246	10251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020824	ACC	2	6	10264	10269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.