MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-7 DNA

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020824	ACC	2	6	596	601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279710
2	NC_020824	ACC	2	6	614	619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279710
3	NC_020824	AGT	2	6	824	829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279710
4	NC_020824	TGT	2	6	895	900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279710
5	NC_020824	GCT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279711
6	NC_020824	TGA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279712
7	NC_020824	TGA	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279712
8	NC_020824	AAG	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279712
9	NC_020824	ATT	2	6	2255	2260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279712
10	NC_020824	ATT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279713
11	NC_020824	AGA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
12	NC_020824	AGT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279713
13	NC_020824	AGA	2	6	3495	3500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
14	NC_020824	AGA	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
15	NC_020824	AAG	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
16	NC_020824	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279714
17	NC_020824	CAA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
18	NC_020824	TCA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279714
19	NC_020824	CAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
20	NC_020824	GAT	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279714
21	NC_020824	GAC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279714
22	NC_020824	CAA	2	6	4256	4261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
23	NC_020824	GAA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279714
24	NC_020824	ATA	2	6	4347	4352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279714
25	NC_020824	AAG	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279714
26	NC_020824	GTG	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279714
27	NC_020824	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279715
28	NC_020824	ATC	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279715
29	NC_020824	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279715
30	NC_020824	GTT	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279715
31	NC_020824	TTC	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279715
32	NC_020824	TAA	3	9	5794	5802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279716
33	NC_020824	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279716
34	NC_020824	CTG	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279716
35	NC_020824	CAA	2	6	6067	6072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279716
36	NC_020824	TTA	2	6	6073	6078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279716
37	NC_020824	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279716
38	NC_020824	GCG	2	6	6448	6453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279717
39	NC_020824	AAG	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279717
40	NC_020824	ACC	2	6	6552	6557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279717
41	NC_020824	TCA	3	9	6598	6606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
42	NC_020824	TAA	2	6	6658	6663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
43	NC_020824	TAA	2	6	6668	6673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
44	NC_020824	GTT	2	6	6690	6695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
45	NC_020824	TTA	2	6	6769	6774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279717
46	NC_020824	TCT	2	6	6835	6840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279717
47	NC_020824	CAT	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
48	NC_020824	AGT	2	6	6966	6971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279717
49	NC_020824	GAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279717
50	NC_020824	GTT	2	6	7118	7123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
51	NC_020824	CAG	2	6	7124	7129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
52	NC_020824	TCT	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279717
53	NC_020824	TTG	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
54	NC_020824	CAA	2	6	7382	7387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279717
55	NC_020824	TAC	2	6	7505	7510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
56	NC_020824	TTC	2	6	7641	7646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279717
57	NC_020824	GCT	2	6	7792	7797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279717
58	NC_020824	AGC	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
59	NC_020824	TAA	2	6	7884	7889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
60	NC_020824	CAG	2	6	7910	7915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
61	NC_020824	AGG	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279717
62	NC_020824	AAT	2	6	8037	8042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
63	NC_020824	ATA	2	6	8106	8111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
64	NC_020824	TGT	2	6	8242	8247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
65	NC_020824	CCA	2	6	8272	8277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279717
66	NC_020824	CAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279717
67	NC_020824	ATA	2	6	8317	8322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
68	NC_020824	CAG	3	9	8381	8389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
69	NC_020824	TAG	2	6	8396	8401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279717
70	NC_020824	ATT	2	6	8458	8463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279717
71	NC_020824	AAC	2	6	8466	8471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279717
72	NC_020824	TTA	2	6	8497	8502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279717
73	NC_020824	TTG	2	6	8668	8673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
74	NC_020824	TGT	2	6	8728	8733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
75	NC_020824	TCA	2	6	9125	9130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279718
76	NC_020824	CAA	2	6	9273	9278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279718
77	NC_020824	CTT	2	6	9442	9447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279719
78	NC_020824	ATT	2	6	9500	9505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279719
79	NC_020824	TAA	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279719

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.