MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-5 DNA

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020823	CACC	2	8	1087	1094	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_020823	AACA	2	8	1356	1363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020823	CGAC	2	8	1482	1489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020823	AAAG	2	8	2771	2778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020823	TAAG	2	8	3338	3345	50 %	25 %	25 %	0 %	472279684
6	NC_020823	AAAG	2	8	3448	3455	75 %	0 %	25 %	0 %	472279684
7	NC_020823	AATC	2	8	4339	4346	50 %	25 %	0 %	25 %	472279687
8	NC_020823	AGCC	2	8	4699	4706	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020823	TAAT	2	8	4887	4894	50 %	50 %	0 %	0 %	472279688
10	NC_020823	TTAA	2	8	5577	5584	50 %	50 %	0 %	0 %	472279689
11	NC_020823	ATAA	2	8	6033	6040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020823	CGTG	2	8	6310	6317	0 %	25 %	50 %	25 %	472279691
13	NC_020823	GTAA	2	8	6490	6497	50 %	25 %	25 %	0 %	472279691
14	NC_020823	AGTA	2	8	7002	7009	50 %	25 %	25 %	0 %	472279691
15	NC_020823	CATA	2	8	7160	7167	50 %	25 %	0 %	25 %	472279691
16	NC_020823	TTTC	2	8	7377	7384	0 %	75 %	0 %	25 %	472279691
17	NC_020823	ATTT	2	8	7473	7480	25 %	75 %	0 %	0 %	472279692
18	NC_020823	GCAA	2	8	8234	8241	50 %	0 %	25 %	25 %	472279693
19	NC_020823	GTTA	2	8	8447	8454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020823	ATCT	2	8	8645	8652	25 %	50 %	0 %	25 %	472279695
21	NC_020823	AAAG	2	8	8807	8814	75 %	0 %	25 %	0 %	472279695
22	NC_020823	TTTC	2	8	10067	10074	0 %	75 %	0 %	25 %	472279698
23	NC_020823	TGAT	2	8	10153	10160	25 %	50 %	25 %	0 %	472279699
24	NC_020823	TTAT	2	8	10313	10320	25 %	75 %	0 %	0 %	472279699
25	NC_020823	ATTA	2	8	10366	10373	50 %	50 %	0 %	0 %	472279699
26	NC_020823	AACT	2	8	10568	10575	50 %	25 %	0 %	25 %	472279700
27	NC_020823	AATA	2	8	10643	10650	75 %	25 %	0 %	0 %	472279700
28	NC_020823	GCTT	2	8	10795	10802	0 %	50 %	25 %	25 %	472279700
29	NC_020823	TTTC	2	8	11172	11179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020823	TAAA	2	8	11565	11572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020823	ATTT	2	8	11585	11592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020823	GATG	2	8	11864	11871	25 %	25 %	50 %	0 %	472279701
33	NC_020823	TTAA	2	8	12266	12273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020823	TTTG	2	8	12306	12313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020823	AGTG	2	8	12347	12354	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020823	AGTG	2	8	12410	12417	25 %	25 %	50 %	0 %	472279702
37	NC_020823	AGCA	2	8	12486	12493	50 %	0 %	25 %	25 %	472279702
38	NC_020823	GATT	2	8	12521	12528	25 %	50 %	25 %	0 %	472279702
39	NC_020823	TGAT	2	8	12793	12800	25 %	50 %	25 %	0 %	472279702
40	NC_020823	ACCG	2	8	12932	12939	25 %	0 %	25 %	50 %	472279702
41	NC_020823	CCAA	2	8	13489	13496	50 %	0 %	0 %	50 %	472279703
42	NC_020823	TTAA	2	8	13504	13511	50 %	50 %	0 %	0 %	472279703
43	NC_020823	TCAG	2	8	13758	13765	25 %	25 %	25 %	25 %	472279703
44	NC_020823	TGAA	2	8	13904	13911	50 %	25 %	25 %	0 %	472279703
45	NC_020823	GGTT	2	8	14213	14220	0 %	50 %	50 %	0 %	472279703
46	NC_020823	GTTG	2	8	14240	14247	0 %	50 %	50 %	0 %	472279703
47	NC_020823	TTTG	2	8	14524	14531	0 %	75 %	25 %	0 %	472279704
48	NC_020823	ATCG	2	8	15717	15724	25 %	25 %	25 %	25 %	472279705
49	NC_020823	AAGC	2	8	16728	16735	50 %	0 %	25 %	25 %	472279707
50	NC_020823	TTAG	2	8	17083	17090	25 %	50 %	25 %	0 %	472279708
51	NC_020823	CGAT	2	8	17155	17162	25 %	25 %	25 %	25 %	472279708
52	NC_020823	GATT	2	8	17284	17291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020823	TGCT	2	8	17787	17794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.