MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-5 DNA

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020823	ATT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279680
2	NC_020823	TGT	2	6	154	159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279680
3	NC_020823	TTC	2	6	170	175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279680
4	NC_020823	AAT	2	6	203	208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279680
5	NC_020823	GAA	2	6	232	237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279680
6	NC_020823	GCA	2	6	359	364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279680
7	NC_020823	TCA	2	6	480	485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279680
8	NC_020823	CAG	3	9	526	534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279680
9	NC_020823	GTA	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279680
10	NC_020823	ACC	2	6	770	775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279680
11	NC_020823	TCC	2	6	813	818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279680
12	NC_020823	ATT	2	6	1786	1791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279681
13	NC_020823	GTG	2	6	1794	1799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279681
14	NC_020823	GAG	2	6	1824	1829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279681
15	NC_020823	GCG	2	6	2237	2242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279682
16	NC_020823	TGA	3	9	2318	2326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279682
17	NC_020823	AAG	2	6	2378	2383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279682
18	NC_020823	TGG	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279682
19	NC_020823	GAA	3	9	2496	2504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279682
20	NC_020823	TAC	2	6	2535	2540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279682
21	NC_020823	GAT	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279683
22	NC_020823	TTG	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279683
23	NC_020823	GAA	3	9	2961	2969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279683
24	NC_020823	TCG	2	6	3141	3146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279684
25	NC_020823	AAG	2	6	3196	3201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279684
26	NC_020823	CAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279684
27	NC_020823	TAT	2	6	3223	3228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279684
28	NC_020823	GAA	2	6	3258	3263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279684
29	NC_020823	AGA	2	6	3394	3399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279684
30	NC_020823	TTA	2	6	3564	3569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279684
31	NC_020823	TTC	2	6	3635	3640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279685
32	NC_020823	TTG	2	6	3803	3808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279685
33	NC_020823	TGA	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279686
34	NC_020823	GTT	2	6	3982	3987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279686
35	NC_020823	CTT	2	6	4039	4044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279686
36	NC_020823	AAT	2	6	4094	4099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279686
37	NC_020823	TGA	2	6	4509	4514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279687
38	NC_020823	TTG	2	6	4601	4606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279687
39	NC_020823	ATC	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279687
40	NC_020823	AAC	2	6	4977	4982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279688
41	NC_020823	TAA	2	6	5027	5032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279688
42	NC_020823	CTT	2	6	5248	5253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279688
43	NC_020823	TTG	2	6	5288	5293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279688
44	NC_020823	GGT	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279689
45	NC_020823	AAG	2	6	5539	5544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279689
46	NC_020823	TTG	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279689
47	NC_020823	GAT	3	9	5622	5630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279689
48	NC_020823	TAT	2	6	5725	5730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279690
49	NC_020823	TGA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279690
50	NC_020823	CAA	3	9	5768	5776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279690
51	NC_020823	ACC	2	6	5779	5784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279690
52	NC_020823	GTT	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279690
53	NC_020823	ATC	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279691
54	NC_020823	CTG	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279691
55	NC_020823	CAG	2	6	6263	6268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279691
56	NC_020823	GAT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279691
57	NC_020823	ATC	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279691
58	NC_020823	AAT	2	6	6374	6379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279691
59	NC_020823	GTT	2	6	6478	6483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279691
60	NC_020823	TTA	2	6	6484	6489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279691
61	NC_020823	AGT	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279691
62	NC_020823	CAA	2	6	6557	6562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279691
63	NC_020823	TAA	2	6	6695	6700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279691
64	NC_020823	TCA	2	6	6820	6825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279691
65	NC_020823	TGA	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279691
66	NC_020823	GCA	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279691
67	NC_020823	ACA	2	6	6911	6916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279691
68	NC_020823	CAG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279691
69	NC_020823	ATT	2	6	7089	7094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279691
70	NC_020823	CAA	2	6	7115	7120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279691
71	NC_020823	ATG	2	6	7121	7126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279691
72	NC_020823	ATT	2	6	7176	7181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279691
73	NC_020823	TGC	2	6	7293	7298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279691
74	NC_020823	CAA	2	6	7364	7369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279691
75	NC_020823	AAC	2	6	7437	7442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279691
76	NC_020823	TCT	3	9	7486	7494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279692
77	NC_020823	CAG	2	6	7549	7554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279692
78	NC_020823	CAT	2	6	7555	7560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279692
79	NC_020823	TAT	2	6	7561	7566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279692
80	NC_020823	TCC	2	6	7614	7619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279693
81	NC_020823	TCT	3	9	7626	7634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279693
82	NC_020823	CAC	2	6	7678	7683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279693
83	NC_020823	TTA	2	6	7695	7700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279693
84	NC_020823	GCA	2	6	7719	7724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279693
85	NC_020823	TTG	2	6	7736	7741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279693
86	NC_020823	TGA	2	6	7770	7775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279693
87	NC_020823	CAT	2	6	7849	7854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279693
88	NC_020823	TAA	2	6	7951	7956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279693
89	NC_020823	TAC	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279693
90	NC_020823	ACC	2	6	8351	8356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279694
91	NC_020823	TTG	2	6	8428	8433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279694
92	NC_020823	ATT	2	6	8486	8491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279695
93	NC_020823	ATC	2	6	8555	8560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279695
94	NC_020823	TCA	2	6	8604	8609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279695
95	NC_020823	CGA	2	6	8706	8711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279695
96	NC_020823	CAC	2	6	8773	8778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279695
97	NC_020823	TTC	2	6	8861	8866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279695
98	NC_020823	ATT	2	6	8888	8893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279695
99	NC_020823	AAT	2	6	8906	8911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279695
100	NC_020823	CTA	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279695
101	NC_020823	ATC	2	6	8966	8971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279695
102	NC_020823	TTG	2	6	9064	9069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279695
103	NC_020823	GTT	2	6	9101	9106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279695
104	NC_020823	CCA	2	6	9114	9119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279695
105	NC_020823	TGC	2	6	9161	9166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279695
106	NC_020823	CCA	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279695
107	NC_020823	ACT	2	6	9207	9212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279695
108	NC_020823	CAT	2	6	9214	9219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279695
109	NC_020823	AAT	2	6	9316	9321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279696
110	NC_020823	TTC	2	6	9441	9446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279696
111	NC_020823	CTT	3	9	9480	9488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279697
112	NC_020823	TCA	2	6	9596	9601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279697
113	NC_020823	TGA	2	6	9612	9617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279697
114	NC_020823	AAG	2	6	9687	9692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279697
115	NC_020823	TTC	2	6	9719	9724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279697
116	NC_020823	GTT	2	6	9762	9767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279697
117	NC_020823	ACT	2	6	9859	9864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279698
118	NC_020823	GTT	2	6	9986	9991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279698
119	NC_020823	AAT	2	6	9993	9998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279698
120	NC_020823	GGA	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279698
121	NC_020823	GTT	2	6	10142	10147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279699
122	NC_020823	GCA	2	6	10200	10205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279699
123	NC_020823	ATT	2	6	10354	10359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279699
124	NC_020823	TAG	2	6	10392	10397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279699
125	NC_020823	AAT	2	6	10547	10552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279700
126	NC_020823	CTG	2	6	10733	10738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279700
127	NC_020823	TCA	2	6	10744	10749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279700
128	NC_020823	TTC	2	6	10785	10790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279700
129	NC_020823	ATA	2	6	10936	10941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279700
130	NC_020823	TCG	2	6	11088	11093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279700
131	NC_020823	TTC	2	6	11127	11132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279700
132	NC_020823	GAA	2	6	11880	11885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279701
133	NC_020823	AAC	2	6	12008	12013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279701
134	NC_020823	GAA	2	6	12149	12154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279701
135	NC_020823	GAT	2	6	12161	12166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279701
136	NC_020823	TGA	2	6	12197	12202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279701
137	NC_020823	TTA	2	6	12445	12450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279702
138	NC_020823	TCA	2	6	12500	12505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279702
139	NC_020823	ACC	2	6	12585	12590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279702
140	NC_020823	TGA	2	6	12760	12765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279702
141	NC_020823	ATT	2	6	12914	12919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279702
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144	NC_020823	ATG	2	6	13267	13272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279703
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146	NC_020823	TCA	2	6	13326	13331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279703
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152	NC_020823	CTG	2	6	13700	13705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279703
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156	NC_020823	ACT	2	6	13915	13920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279703
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161	NC_020823	TTA	3	9	14095	14103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279703
162	NC_020823	TTG	2	6	14186	14191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279703
163	NC_020823	CAT	2	6	14262	14267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279703
164	NC_020823	TGT	2	6	14301	14306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279703
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.