MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-4 DNA

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020822	CGGT	2	8	1012	1019	0 %	25 %	50 %	25 %	472279655
2	NC_020822	ATTC	2	8	1486	1493	25 %	50 %	0 %	25 %	472279655
3	NC_020822	ATGT	2	8	1794	1801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020822	TTTA	2	8	2121	2128	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
5	NC_020822	TGAT	2	8	2409	2416	25 %	50 %	25 %	0 %	472279656
6	NC_020822	TCTA	2	8	2640	2647	25 %	50 %	0 %	25 %	472279656
7	NC_020822	ATTT	2	8	2657	2664	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
8	NC_020822	TATT	2	8	2727	2734	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
9	NC_020822	TTTC	2	8	3607	3614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020822	ATGG	2	8	3861	3868	25 %	25 %	50 %	0 %	472279658
11	NC_020822	CTCG	2	8	4044	4051	0 %	25 %	25 %	50 %	472279658
12	NC_020822	AATC	2	8	4521	4528	50 %	25 %	0 %	25 %	472279658
13	NC_020822	TAAG	2	8	4793	4800	50 %	25 %	25 %	0 %	472279659
14	NC_020822	GAGC	2	8	4841	4848	25 %	0 %	50 %	25 %	472279659
15	NC_020822	TCAA	2	8	4903	4910	50 %	25 %	0 %	25 %	472279659
16	NC_020822	TTGA	2	8	5051	5058	25 %	50 %	25 %	0 %	472279659
17	NC_020822	TCAA	2	8	5307	5314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020822	TAGC	2	8	7087	7094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020822	CCAC	2	8	7233	7240	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_020822	ATTG	2	8	7286	7293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020822	TGTA	2	8	7348	7355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020822	TTTG	2	8	7711	7718	0 %	75 %	25 %	0 %	472279661
23	NC_020822	TTTC	2	8	7969	7976	0 %	75 %	0 %	25 %	472279662
24	NC_020822	GCAA	2	8	8421	8428	50 %	0 %	25 %	25 %	472279662
25	NC_020822	CACC	2	8	8919	8926	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_020822	AACA	2	8	9187	9194	75 %	0 %	0 %	25 %	472279663
27	NC_020822	CGAC	2	8	9313	9320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020822	AAAG	2	8	10602	10609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020822	TAAG	2	8	11169	11176	50 %	25 %	25 %	0 %	472279667
30	NC_020822	AAAG	2	8	11279	11286	75 %	0 %	25 %	0 %	472279667
31	NC_020822	AAAG	2	8	12390	12397	75 %	0 %	25 %	0 %	472279670
32	NC_020822	AGAA	2	8	12470	12477	75 %	0 %	25 %	0 %	472279670
33	NC_020822	GCAA	2	8	12656	12663	50 %	0 %	25 %	25 %	472279670
34	NC_020822	TGGT	2	8	12703	12710	0 %	50 %	50 %	0 %	472279670
35	NC_020822	AACA	2	8	13310	13317	75 %	0 %	0 %	25 %	472279670
36	NC_020822	AGTT	2	8	13421	13428	25 %	50 %	25 %	0 %	472279670
37	NC_020822	ATTA	2	8	14029	14036	50 %	50 %	0 %	0 %	472279670
38	NC_020822	AGCA	2	8	15377	15384	50 %	0 %	25 %	25 %	472279671
39	NC_020822	GAGT	2	8	16825	16832	25 %	25 %	50 %	0 %	472279672
40	NC_020822	ATTT	2	8	16835	16842	25 %	75 %	0 %	0 %	472279672
41	NC_020822	CTGT	2	8	17068	17075	0 %	50 %	25 %	25 %	472279672
42	NC_020822	CTGA	2	8	17247	17254	25 %	25 %	25 %	25 %	472279673
43	NC_020822	CCTT	2	8	17644	17651	0 %	50 %	0 %	50 %	472279673
44	NC_020822	GGGT	2	8	17832	17839	0 %	25 %	75 %	0 %	472279673
45	NC_020822	TAAG	2	8	17859	17866	50 %	25 %	25 %	0 %	472279673
46	NC_020822	ATAG	2	8	18072	18079	50 %	25 %	25 %	0 %	472279673
47	NC_020822	AGAT	2	8	18375	18382	50 %	25 %	25 %	0 %	472279673
48	NC_020822	AATT	2	8	19180	19187	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
49	NC_020822	AATT	2	8	19324	19331	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
50	NC_020822	AATT	2	8	19947	19954	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
51	NC_020822	CTTG	2	8	20448	20455	0 %	50 %	25 %	25 %	472279674
52	NC_020822	CAAA	2	8	21107	21114	75 %	0 %	0 %	25 %	472279674
53	NC_020822	ATTA	2	8	21517	21524	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
54	NC_020822	ATTG	2	8	21900	21907	25 %	50 %	25 %	0 %	472279674
55	NC_020822	TTCC	2	8	21968	21975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020822	CTTG	2	8	22189	22196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020822	AATG	2	8	22809	22816	50 %	25 %	25 %	0 %	472279675
58	NC_020822	AAAT	2	8	24206	24213	75 %	25 %	0 %	0 %	472279678
59	NC_020822	TGAT	2	8	25038	25045	25 %	50 %	25 %	0 %	472279678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.