MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-4 DNA

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020822	ACG	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279654
2	NC_020822	ACT	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279654
3	NC_020822	ATG	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279654
4	NC_020822	ATG	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279655
5	NC_020822	CGG	2	6	1034	1039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279655
6	NC_020822	CCG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279655
7	NC_020822	TCC	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279655
8	NC_020822	CGA	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279655
9	NC_020822	TAA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279655
10	NC_020822	TGA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279655
11	NC_020822	CAT	2	6	1417	1422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
12	NC_020822	TAC	2	6	1457	1462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
13	NC_020822	TCA	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
14	NC_020822	AGC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279655
15	NC_020822	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279655
16	NC_020822	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279656
17	NC_020822	GAA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279656
18	NC_020822	ATT	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279656
19	NC_020822	AAT	2	6	2450	2455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
20	NC_020822	TGA	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
21	NC_020822	GAT	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
22	NC_020822	ATA	2	6	2538	2543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
23	NC_020822	TCA	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279656
24	NC_020822	CTC	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279656
25	NC_020822	GAT	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
26	NC_020822	TAA	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
27	NC_020822	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279657
28	NC_020822	AAC	2	6	3175	3180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279657
29	NC_020822	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279657
30	NC_020822	CAA	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279657
31	NC_020822	CAG	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279657
32	NC_020822	GAT	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279657
33	NC_020822	GAC	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279657
34	NC_020822	AGC	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279658
35	NC_020822	ATC	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279658
36	NC_020822	GCG	2	6	4219	4224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279658
37	NC_020822	GAA	2	6	4405	4410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279658
38	NC_020822	GCC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279658
39	NC_020822	GGT	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279658
40	NC_020822	GTT	2	6	4659	4664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279658
41	NC_020822	ACT	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279659
42	NC_020822	TTC	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279659
43	NC_020822	GAA	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279659
44	NC_020822	GCT	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279659
45	NC_020822	ATA	2	6	5044	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279659
46	NC_020822	ACC	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279659
47	NC_020822	GTA	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279660
48	NC_020822	GAA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279660
49	NC_020822	CAA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279660
50	NC_020822	GTC	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279660
51	NC_020822	GAT	2	6	6400	6405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279660
52	NC_020822	TCA	2	6	6449	6454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279660
53	NC_020822	TCT	2	6	6552	6557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279660
54	NC_020822	GCG	2	6	6595	6600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279660
55	NC_020822	CTT	2	6	6607	6612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279660
56	NC_020822	TGT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279660
57	NC_020822	AGC	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279660
58	NC_020822	GAA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279660
59	NC_020822	ATT	2	6	7473	7478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279661
60	NC_020822	GAT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279661
61	NC_020822	GTA	2	6	7670	7675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279661
62	NC_020822	AGA	2	6	7729	7734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279661
63	NC_020822	ATT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279661
64	NC_020822	CCA	2	6	7818	7823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279661
65	NC_020822	AAT	2	6	7841	7846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279661
66	NC_020822	ATT	2	6	7875	7880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279662
67	NC_020822	TTC	3	9	7982	7990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279662
68	NC_020822	ATT	2	6	8297	8302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279662
69	NC_020822	CTT	2	6	8407	8412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279662
70	NC_020822	ATC	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279662
71	NC_020822	TGT	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279662
72	NC_020822	CAA	2	6	9080	9085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279663
73	NC_020822	GTG	2	6	9104	9109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279663
74	NC_020822	GGT	2	6	9138	9143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279663
75	NC_020822	GTG	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279663
76	NC_020822	ATT	2	6	9617	9622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279664
77	NC_020822	GTG	2	6	9625	9630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279664
78	NC_020822	GAG	2	6	9655	9660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279664
79	NC_020822	GCG	2	6	10068	10073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279665
80	NC_020822	TGA	3	9	10149	10157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279665
81	NC_020822	AAG	2	6	10209	10214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279665
82	NC_020822	TGG	2	6	10282	10287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279665
83	NC_020822	GAA	3	9	10327	10335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279665
84	NC_020822	TAC	2	6	10366	10371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279665
85	NC_020822	GAT	2	6	10678	10683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279666
86	NC_020822	TTG	2	6	10751	10756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279666
87	NC_020822	GAA	3	9	10792	10800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279666
88	NC_020822	TCG	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279667
89	NC_020822	AAG	2	6	11027	11032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279667
90	NC_020822	CAA	2	6	11048	11053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279667
91	NC_020822	TAT	2	6	11054	11059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279667
92	NC_020822	GAA	2	6	11089	11094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279667
93	NC_020822	AGA	2	6	11225	11230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279667
94	NC_020822	TTA	2	6	11395	11400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279667
95	NC_020822	TTC	2	6	11466	11471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279668
96	NC_020822	TTA	2	6	11491	11496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279668
97	NC_020822	TAA	2	6	11514	11519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279668
98	NC_020822	TGC	2	6	11635	11640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279668
99	NC_020822	TGA	2	6	11793	11798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279669
100	NC_020822	GTT	2	6	11814	11819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279669
101	NC_020822	CTT	2	6	11871	11876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279669
102	NC_020822	AAT	2	6	11926	11931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279669
103	NC_020822	GTG	2	6	12251	12256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279670
104	NC_020822	ATT	2	6	12261	12266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279670
105	NC_020822	AAG	2	6	12275	12280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279670
106	NC_020822	GCC	2	6	12281	12286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279670
107	NC_020822	GGC	2	6	12743	12748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279670
108	NC_020822	CAA	2	6	12758	12763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279670
109	NC_020822	CAA	2	6	12901	12906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279670
110	NC_020822	GAT	2	6	13072	13077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279670
111	NC_020822	TTA	2	6	13111	13116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279670
112	NC_020822	ACT	2	6	13152	13157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279670
113	NC_020822	GTT	2	6	13200	13205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279670
114	NC_020822	GTG	2	6	13213	13218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279670
115	NC_020822	CCG	2	6	13268	13273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279670
116	NC_020822	ACG	2	6	13278	13283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279670
117	NC_020822	ATT	2	6	13383	13388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279670
118	NC_020822	CAG	2	6	13432	13437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279670
119	NC_020822	ACA	2	6	13622	13627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279670
120	NC_020822	GAT	2	6	13744	13749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279670
121	NC_020822	ACA	2	6	13761	13766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279670
122	NC_020822	ATC	2	6	13853	13858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279670
123	NC_020822	ATG	2	6	13880	13885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279670
124	NC_020822	CAA	2	6	13939	13944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279670
125	NC_020822	ACA	2	6	13971	13976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279670
126	NC_020822	GAA	2	6	14106	14111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279670
127	NC_020822	CTG	2	6	14699	14704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279671
128	NC_020822	TAC	2	6	14721	14726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279671
129	NC_020822	CGA	2	6	14727	14732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279671
130	NC_020822	TTG	2	6	14741	14746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279671
131	NC_020822	GTG	2	6	14786	14791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279671
132	NC_020822	ATC	2	6	14837	14842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279671
133	NC_020822	ATT	2	6	14876	14881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279671
134	NC_020822	TGG	2	6	14979	14984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279671
135	NC_020822	ACT	2	6	15155	15160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279671
136	NC_020822	CAA	2	6	15237	15242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279671
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139	NC_020822	CAA	3	9	15364	15372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279671
140	NC_020822	CAA	2	6	15394	15399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279671
141	NC_020822	AAC	2	6	15500	15505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279671
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146	NC_020822	AGT	2	6	16372	16377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279672
147	NC_020822	AAT	2	6	16437	16442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279672
148	NC_020822	TGA	2	6	16617	16622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279672
149	NC_020822	GAA	2	6	16649	16654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279672
150	NC_020822	CTT	2	6	16675	16680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279672
151	NC_020822	TGC	2	6	16748	16753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279672
152	NC_020822	TTC	2	6	16758	16763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279672
153	NC_020822	AAT	2	6	17032	17037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279672
154	NC_020822	TTG	2	6	17050	17055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279672
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158	NC_020822	GTC	2	6	17425	17430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279673
159	NC_020822	TCA	2	6	17515	17520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279673
160	NC_020822	TGG	2	6	17564	17569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279673
161	NC_020822	AAT	2	6	17595	17600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279673
162	NC_020822	CAG	2	6	17619	17624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279673
163	NC_020822	GTA	2	6	17726	17731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279673
164	NC_020822	TAT	2	6	17810	17815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279673
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246	NC_020822	TCA	2	6	24153	24158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279678
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250	NC_020822	AAT	2	6	24514	24519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279678
251	NC_020822	GCT	2	6	24552	24557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279678
252	NC_020822	AAT	2	6	24612	24617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279678
253	NC_020822	GCT	2	6	24637	24642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279678
254	NC_020822	TGT	2	6	24682	24687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279678
255	NC_020822	GGT	2	6	24875	24880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279678
256	NC_020822	GCC	2	6	24952	24957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279678
257	NC_020822	TCA	2	6	24984	24989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279678
258	NC_020822	TGA	2	6	25026	25031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279678
259	NC_020822	CCA	2	6	25188	25193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279678
260	NC_020822	AAG	2	6	25296	25301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279678
261	NC_020822	TCA	3	9	25317	25325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.