MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-2 DNA

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020821	ACTTA	2	10	1385	1394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020821	TGTCT	2	10	1732	1741	0 %	60 %	20 %	20 %	472279621
3	NC_020821	TGCAA	2	10	4860	4869	40 %	20 %	20 %	20 %	472279625
4	NC_020821	TAATC	2	10	5208	5217	40 %	40 %	0 %	20 %	472279625
5	NC_020821	ACAAT	2	10	6077	6086	60 %	20 %	0 %	20 %	472279625
6	NC_020821	TATTC	2	10	6160	6169	20 %	60 %	0 %	20 %	472279625
7	NC_020821	ATGGT	2	10	6552	6561	20 %	40 %	40 %	0 %	472279625
8	NC_020821	CAGAT	2	10	7501	7510	40 %	20 %	20 %	20 %	472279626
9	NC_020821	ACTTT	2	10	10583	10592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020821	ATCCC	2	10	12070	12079	20 %	20 %	0 %	60 %	472279631
11	NC_020821	TTAAA	2	10	12805	12814	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020821	TAAGC	2	10	14061	14070	40 %	20 %	20 %	20 %	472279633
13	NC_020821	GATTG	2	10	15814	15823	20 %	40 %	40 %	0 %	472279633
14	NC_020821	TATTG	2	10	19613	19622	20 %	60 %	20 %	0 %	472279638
15	NC_020821	TGGTT	2	10	20082	20091	0 %	60 %	40 %	0 %	472279638
16	NC_020821	CCTCA	2	10	21545	21554	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_020821	TTCTG	2	10	25058	25067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020821	CTAAG	2	10	25510	25519	40 %	20 %	20 %	20 %	472279641
19	NC_020821	TTCTT	2	10	26456	26465	0 %	80 %	0 %	20 %	472279641
20	NC_020821	GTTGG	2	10	26494	26503	0 %	40 %	60 %	0 %	472279641
21	NC_020821	TCTTT	2	10	26955	26964	0 %	80 %	0 %	20 %	472279641
22	NC_020821	TAAAA	2	10	27023	27032	80 %	20 %	0 %	0 %	472279641
23	NC_020821	CCCTA	2	10	28632	28641	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_020821	CATTC	2	10	28782	28791	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020821	CATGC	2	10	29565	29574	20 %	20 %	20 %	40 %	472279646
26	NC_020821	AAAAG	2	10	31090	31099	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020821	AATCA	2	10	32407	32416	60 %	20 %	0 %	20 %	472279649
28	NC_020821	CTTTT	2	10	32962	32971	0 %	80 %	0 %	20 %	472279650
29	NC_020821	TTGAC	2	10	34498	34507	20 %	40 %	20 %	20 %	472279651

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.