MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-2 DNA

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020821	TGTCT	2	10	1732	1741	0 %	60 %	20 %	20 %	472279621
2	NC_020821	TGCAA	2	10	4860	4869	40 %	20 %	20 %	20 %	472279625
3	NC_020821	TAATC	2	10	5208	5217	40 %	40 %	0 %	20 %	472279625
4	NC_020821	ACAAT	2	10	6077	6086	60 %	20 %	0 %	20 %	472279625
5	NC_020821	TATTC	2	10	6160	6169	20 %	60 %	0 %	20 %	472279625
6	NC_020821	ATGGT	2	10	6552	6561	20 %	40 %	40 %	0 %	472279625
7	NC_020821	CAGAT	2	10	7501	7510	40 %	20 %	20 %	20 %	472279626
8	NC_020821	ATCCC	2	10	12070	12079	20 %	20 %	0 %	60 %	472279631
9	NC_020821	TAAGC	2	10	14061	14070	40 %	20 %	20 %	20 %	472279633
10	NC_020821	GATTG	2	10	15814	15823	20 %	40 %	40 %	0 %	472279633
11	NC_020821	TATTG	2	10	19613	19622	20 %	60 %	20 %	0 %	472279638
12	NC_020821	TGGTT	2	10	20082	20091	0 %	60 %	40 %	0 %	472279638
13	NC_020821	CTAAG	2	10	25510	25519	40 %	20 %	20 %	20 %	472279641
14	NC_020821	TTCTT	2	10	26456	26465	0 %	80 %	0 %	20 %	472279641
15	NC_020821	GTTGG	2	10	26494	26503	0 %	40 %	60 %	0 %	472279641
16	NC_020821	TCTTT	2	10	26955	26964	0 %	80 %	0 %	20 %	472279641
17	NC_020821	TAAAA	2	10	27023	27032	80 %	20 %	0 %	0 %	472279641
18	NC_020821	CATGC	2	10	29565	29574	20 %	20 %	20 %	40 %	472279646
19	NC_020821	AATCA	2	10	32407	32416	60 %	20 %	0 %	20 %	472279649
20	NC_020821	CTTTT	2	10	32962	32971	0 %	80 %	0 %	20 %	472279650
21	NC_020821	TTGAC	2	10	34498	34507	20 %	40 %	20 %	20 %	472279651

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.