MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-2 DNA

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020821	AAC	2	6	29	34	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020821	AGG	2	6	42	47	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020821	TAG	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279619
4	NC_020821	ACT	2	6	156	161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279619
5	NC_020821	TCA	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279619
6	NC_020821	CGC	2	6	455	460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279619
7	NC_020821	CTA	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279619
8	NC_020821	ATT	2	6	503	508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279619
9	NC_020821	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279619
10	NC_020821	CAA	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279620
11	NC_020821	ACA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020821	TAT	2	6	1271	1276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020821	TAC	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020821	AAC	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279621
15	NC_020821	TGT	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279621
16	NC_020821	TAA	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279621
17	NC_020821	TTG	2	6	1755	1760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279621
18	NC_020821	ATA	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279621
19	NC_020821	AAC	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279621
20	NC_020821	TTA	2	6	1809	1814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279621
21	NC_020821	GTC	2	6	1841	1846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279621
22	NC_020821	TAT	2	6	1856	1861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279621
23	NC_020821	TTG	2	6	1912	1917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279621
24	NC_020821	ACC	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279621
25	NC_020821	ATG	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020821	TGA	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279622
27	NC_020821	TGC	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279622
28	NC_020821	TCA	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279622
29	NC_020821	GAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279622
30	NC_020821	GTT	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279622
31	NC_020821	GTT	2	6	2742	2747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279622
32	NC_020821	TGC	2	6	2953	2958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279622
33	NC_020821	CTA	2	6	3206	3211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020821	TGC	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279623
35	NC_020821	ACG	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279623
36	NC_020821	CTA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020821	CTA	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279624
38	NC_020821	TCC	2	6	3813	3818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279624
39	NC_020821	ATG	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279624
40	NC_020821	TTA	2	6	3999	4004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279624
41	NC_020821	GAC	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279624
42	NC_020821	GTA	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279624
43	NC_020821	ACG	3	9	4311	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279624
44	NC_020821	AGA	2	6	4484	4489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020821	CTT	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020821	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020821	ATT	2	6	4831	4836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
48	NC_020821	TGT	2	6	4851	4856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279625
49	NC_020821	ACA	2	6	4874	4879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279625
50	NC_020821	TGG	2	6	4956	4961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279625
51	NC_020821	GTT	2	6	5095	5100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279625
52	NC_020821	TAT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
53	NC_020821	TGA	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279625
54	NC_020821	TAT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
55	NC_020821	AAG	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279625
56	NC_020821	TTA	2	6	5645	5650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
57	NC_020821	TAA	2	6	5711	5716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279625
58	NC_020821	ACT	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279625
59	NC_020821	TAT	2	6	5967	5972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
60	NC_020821	CTT	2	6	6037	6042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279625
61	NC_020821	GTA	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279625
62	NC_020821	TGT	2	6	6276	6281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279625
63	NC_020821	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279625
64	NC_020821	TTA	2	6	6437	6442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
65	NC_020821	AAC	2	6	6449	6454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279625
66	NC_020821	AGA	2	6	6582	6587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279625
67	NC_020821	ATC	2	6	6647	6652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279625
68	NC_020821	AAT	2	6	6664	6669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279625
69	NC_020821	TAG	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020821	AGT	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020821	ATA	2	6	6778	6783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020821	ACT	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279626
73	NC_020821	GTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279626
74	NC_020821	GTT	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279626
75	NC_020821	TGA	2	6	7494	7499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279626
76	NC_020821	GAT	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279626
77	NC_020821	TTA	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020821	TGT	2	6	7725	7730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020821	TAC	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020821	TAG	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020821	CAA	2	6	8039	8044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279627
82	NC_020821	CTT	2	6	8105	8110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020821	CGC	2	6	8130	8135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_020821	GAC	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020821	TCA	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020821	TCG	2	6	8310	8315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020821	TCT	2	6	8343	8348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279628
88	NC_020821	ATG	2	6	8375	8380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279628
89	NC_020821	ATC	2	6	8383	8388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279628
90	NC_020821	TTA	2	6	8403	8408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279628
91	NC_020821	TGC	3	9	8472	8480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279628
92	NC_020821	CGG	2	6	8591	8596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279628
93	NC_020821	GCC	2	6	8678	8683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279628
94	NC_020821	GTG	2	6	8816	8821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279628
95	NC_020821	CAC	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279628
96	NC_020821	AGC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279628
97	NC_020821	GCA	2	6	8976	8981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279628
98	NC_020821	GCA	2	6	9015	9020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279628
99	NC_020821	ATA	2	6	9032	9037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020821	AAT	2	6	9061	9066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020821	CCT	2	6	9131	9136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020821	ATG	2	6	9294	9299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020821	TGA	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020821	CTT	2	6	9368	9373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279629
105	NC_020821	ATC	2	6	9395	9400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
106	NC_020821	CAT	2	6	9433	9438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
107	NC_020821	CAG	2	6	9733	9738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279629
108	NC_020821	CAC	2	6	9784	9789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279629
109	NC_020821	AAC	2	6	9805	9810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279629
110	NC_020821	CAA	2	6	9850	9855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279629
111	NC_020821	TCA	2	6	9946	9951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
112	NC_020821	ATC	2	6	10041	10046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
113	NC_020821	CCA	3	9	10101	10109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279629
114	NC_020821	TCA	2	6	10383	10388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
115	NC_020821	AAT	2	6	10448	10453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279629
116	NC_020821	CCA	2	6	10518	10523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279629
117	NC_020821	AAT	3	9	10674	10682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020821	ATA	2	6	10759	10764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020821	AAT	2	6	10786	10791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020821	ATT	2	6	10821	10826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279630
121	NC_020821	TAT	2	6	10853	10858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279630
122	NC_020821	TCA	2	6	10951	10956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279630
123	NC_020821	TGA	2	6	11005	11010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279630
124	NC_020821	ATT	2	6	11015	11020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279630
125	NC_020821	TTG	2	6	11073	11078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279630
126	NC_020821	TGA	2	6	11095	11100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279630
127	NC_020821	ACT	2	6	11163	11168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020821	GTT	2	6	11199	11204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020821	CAA	3	9	11251	11259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020821	TTG	2	6	11276	11281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020821	AGG	2	6	11314	11319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020821	TTA	2	6	11328	11333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020821	ATA	2	6	11342	11347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020821	CAA	2	6	11450	11455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279631
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137	NC_020821	ATT	2	6	11642	11647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279631
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139	NC_020821	TTA	2	6	11804	11809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279631
140	NC_020821	GAT	2	6	11863	11868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279631
141	NC_020821	CAA	2	6	11987	11992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279631
142	NC_020821	TTG	2	6	12132	12137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279631
143	NC_020821	CAT	2	6	12145	12150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279631
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154	NC_020821	TAT	2	6	12815	12820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020821	AAG	2	6	12836	12841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020821	AAT	2	6	12851	12856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020821	ACC	2	6	12864	12869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_020821	GGT	2	6	12892	12897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020821	CAA	2	6	13110	13115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279632
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163	NC_020821	ATG	2	6	13445	13450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279632
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241	NC_020821	GGA	2	6	19494	19499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_020821	ATT	2	6	20572	20577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279638
260	NC_020821	TTG	3	9	20736	20744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279638
261	NC_020821	TTA	2	6	20747	20752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279638
262	NC_020821	AAG	2	6	20901	20906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279638
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264	NC_020821	AAG	2	6	20937	20942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279638
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267	NC_020821	TAA	2	6	21355	21360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_020821	ATT	2	6	21524	21529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_020821	TAT	2	6	21599	21604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_020821	AAG	2	6	31156	31161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
389	NC_020821	TGA	2	6	31215	31220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279648
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398	NC_020821	ACG	2	6	32303	32308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_020821	ACC	2	6	34681	34686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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429	NC_020821	CAC	2	6	34845	34850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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431	NC_020821	ATA	2	6	34976	34981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279652
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435	NC_020821	AAC	2	6	35336	35341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.