MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-2 DNA

Total Repeats: 327

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020821	TAG	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279619
2	NC_020821	ACT	2	6	156	161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279619
3	NC_020821	TCA	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279619
4	NC_020821	CGC	2	6	455	460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279619
5	NC_020821	CTA	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279619
6	NC_020821	ATT	2	6	503	508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279619
7	NC_020821	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279619
8	NC_020821	CAA	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279620
9	NC_020821	AAC	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279621
10	NC_020821	TGT	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279621
11	NC_020821	TAA	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279621
12	NC_020821	TTG	2	6	1755	1760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279621
13	NC_020821	ATA	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279621
14	NC_020821	AAC	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279621
15	NC_020821	TTA	2	6	1809	1814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279621
16	NC_020821	GTC	2	6	1841	1846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279621
17	NC_020821	TAT	2	6	1856	1861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279621
18	NC_020821	TTG	2	6	1912	1917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279621
19	NC_020821	ACC	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279621
20	NC_020821	TGA	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279622
21	NC_020821	TGC	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279622
22	NC_020821	TCA	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279622
23	NC_020821	GAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279622
24	NC_020821	GTT	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279622
25	NC_020821	GTT	2	6	2742	2747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279622
26	NC_020821	TGC	2	6	2953	2958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279622
27	NC_020821	TGC	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279623
28	NC_020821	ACG	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279623
29	NC_020821	CTA	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279624
30	NC_020821	TCC	2	6	3813	3818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279624
31	NC_020821	ATG	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279624
32	NC_020821	TTA	2	6	3999	4004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279624
33	NC_020821	GAC	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279624
34	NC_020821	GTA	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279624
35	NC_020821	ACG	3	9	4311	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279624
36	NC_020821	ATT	2	6	4831	4836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
37	NC_020821	TGT	2	6	4851	4856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279625
38	NC_020821	ACA	2	6	4874	4879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279625
39	NC_020821	TGG	2	6	4956	4961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279625
40	NC_020821	GTT	2	6	5095	5100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279625
41	NC_020821	TAT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
42	NC_020821	TGA	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279625
43	NC_020821	TAT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
44	NC_020821	AAG	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279625
45	NC_020821	TTA	2	6	5645	5650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
46	NC_020821	TAA	2	6	5711	5716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279625
47	NC_020821	ACT	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279625
48	NC_020821	TAT	2	6	5967	5972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
49	NC_020821	CTT	2	6	6037	6042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279625
50	NC_020821	GTA	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279625
51	NC_020821	TGT	2	6	6276	6281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279625
52	NC_020821	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279625
53	NC_020821	TTA	2	6	6437	6442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
54	NC_020821	AAC	2	6	6449	6454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279625
55	NC_020821	AGA	2	6	6582	6587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279625
56	NC_020821	ATC	2	6	6647	6652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279625
57	NC_020821	AAT	2	6	6664	6669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279625
58	NC_020821	ACT	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279626
59	NC_020821	GTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279626
60	NC_020821	GTT	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279626
61	NC_020821	TGA	2	6	7494	7499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279626
62	NC_020821	GAT	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279626
63	NC_020821	CAA	2	6	8039	8044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279627
64	NC_020821	TCT	2	6	8343	8348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279628
65	NC_020821	ATG	2	6	8375	8380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279628
66	NC_020821	ATC	2	6	8383	8388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279628
67	NC_020821	TTA	2	6	8403	8408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279628
68	NC_020821	TGC	3	9	8472	8480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279628
69	NC_020821	CGG	2	6	8591	8596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279628
70	NC_020821	GCC	2	6	8678	8683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279628
71	NC_020821	GTG	2	6	8816	8821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279628
72	NC_020821	CAC	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279628
73	NC_020821	AGC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279628
74	NC_020821	GCA	2	6	8976	8981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279628
75	NC_020821	GCA	2	6	9015	9020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279628
76	NC_020821	CTT	2	6	9368	9373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279629
77	NC_020821	ATC	2	6	9395	9400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
78	NC_020821	CAT	2	6	9433	9438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
79	NC_020821	CAG	2	6	9733	9738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279629
80	NC_020821	CAC	2	6	9784	9789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279629
81	NC_020821	AAC	2	6	9805	9810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279629
82	NC_020821	CAA	2	6	9850	9855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279629
83	NC_020821	TCA	2	6	9946	9951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
84	NC_020821	ATC	2	6	10041	10046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
85	NC_020821	CCA	3	9	10101	10109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279629
86	NC_020821	TCA	2	6	10383	10388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279629
87	NC_020821	AAT	2	6	10448	10453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279629
88	NC_020821	CCA	2	6	10518	10523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279629
89	NC_020821	ATT	2	6	10821	10826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279630
90	NC_020821	TAT	2	6	10853	10858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279630
91	NC_020821	TCA	2	6	10951	10956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279630
92	NC_020821	TGA	2	6	11005	11010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279630
93	NC_020821	ATT	2	6	11015	11020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279630
94	NC_020821	TTG	2	6	11073	11078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279630
95	NC_020821	TGA	2	6	11095	11100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279630
96	NC_020821	CAA	2	6	11450	11455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279631
97	NC_020821	TTC	2	6	11591	11596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279631
98	NC_020821	TTG	2	6	11608	11613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279631
99	NC_020821	ATT	2	6	11642	11647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279631
100	NC_020821	TGG	2	6	11770	11775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279631
101	NC_020821	TTA	2	6	11804	11809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279631
102	NC_020821	GAT	2	6	11863	11868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279631
103	NC_020821	CAA	2	6	11987	11992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279631
104	NC_020821	TTG	2	6	12132	12137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279631
105	NC_020821	CAT	2	6	12145	12150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279631
106	NC_020821	TAT	2	6	12155	12160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279631
107	NC_020821	AGC	2	6	12199	12204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279631
108	NC_020821	CGG	2	6	12249	12254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279631
109	NC_020821	ATT	2	6	12350	12355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279631
110	NC_020821	CTT	2	6	12418	12423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279631
111	NC_020821	ATG	2	6	12560	12565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279631
112	NC_020821	GTG	2	6	12576	12581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279631
113	NC_020821	CTT	2	6	12595	12600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279631
114	NC_020821	CAT	2	6	12716	12721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279631
115	NC_020821	CAC	3	9	12722	12730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279631
116	NC_020821	CAA	2	6	13110	13115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279632
117	NC_020821	CCA	2	6	13262	13267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279632
118	NC_020821	CTA	2	6	13296	13301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279632
119	NC_020821	TCC	2	6	13340	13345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279632
120	NC_020821	ATG	2	6	13445	13450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279632
121	NC_020821	TTA	2	6	13526	13531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279632
122	NC_020821	GAC	2	6	13585	13590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279632
123	NC_020821	GTA	2	6	13755	13760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279632
124	NC_020821	ACG	3	9	13838	13846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279632
125	NC_020821	TGT	2	6	14165	14170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279633
126	NC_020821	TCA	2	6	14207	14212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279633
127	NC_020821	CAC	2	6	14436	14441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279633
128	NC_020821	ATA	2	6	14480	14485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279633
129	NC_020821	CAT	2	6	14535	14540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279633
130	NC_020821	TAA	2	6	14596	14601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279633
131	NC_020821	AAT	2	6	14737	14742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279633
132	NC_020821	CAT	2	6	15021	15026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279633
133	NC_020821	CTT	2	6	15094	15099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279633
134	NC_020821	TCC	2	6	15122	15127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279633
135	NC_020821	CGG	2	6	15135	15140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279633
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138	NC_020821	GCC	2	6	15299	15304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279633
139	NC_020821	CAT	2	6	15312	15317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279633
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142	NC_020821	CAT	2	6	15411	15416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279633
143	NC_020821	CAC	2	6	15498	15503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279633
144	NC_020821	CAC	2	6	15552	15557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279633
145	NC_020821	TGA	2	6	15581	15586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279633
146	NC_020821	GAA	2	6	15595	15600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279633
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161	NC_020821	ATT	2	6	17519	17524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279635
162	NC_020821	TGG	2	6	17540	17545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279635
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250	NC_020821	CAA	2	6	24706	24711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279640
251	NC_020821	TCA	2	6	25236	25241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279641
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253	NC_020821	ATC	2	6	25419	25424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279641
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270	NC_020821	ATC	2	6	26507	26512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279641
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.