MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-1 DNA

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020820	GTGCT	2	10	5797	5806	0 %	40 %	40 %	20 %	472279585
2	NC_020820	TTGTT	2	10	7463	7472	0 %	80 %	20 %	0 %	472279586
3	NC_020820	ACGCT	2	10	8868	8877	20 %	20 %	20 %	40 %	472279588
4	NC_020820	TTGCC	2	10	9020	9029	0 %	40 %	20 %	40 %	472279589
5	NC_020820	GCGTA	2	10	12597	12606	20 %	20 %	40 %	20 %	472279591
6	NC_020820	ATTAG	2	10	18321	18330	40 %	40 %	20 %	0 %	472279597
7	NC_020820	TACAA	2	10	20702	20711	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020820	CTGTT	2	10	21713	21722	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020820	TTGTG	2	10	22050	22059	0 %	60 %	40 %	0 %	472279604
10	NC_020820	ATTTG	2	10	24386	24395	20 %	60 %	20 %	0 %	472279606
11	NC_020820	CAAAA	2	10	24747	24756	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020820	TTGAT	2	10	26519	26528	20 %	60 %	20 %	0 %	472279608
13	NC_020820	TTAAT	2	10	27989	27998	40 %	60 %	0 %	0 %	472279608
14	NC_020820	CATGG	2	10	28276	28285	20 %	20 %	40 %	20 %	472279609
15	NC_020820	CGATT	2	10	28678	28687	20 %	40 %	20 %	20 %	472279609
16	NC_020820	ATTCA	2	10	28688	28697	40 %	40 %	0 %	20 %	472279609
17	NC_020820	GAATC	2	10	31456	31465	40 %	20 %	20 %	20 %	472279610
18	NC_020820	CAAAA	2	10	34195	34204	80 %	0 %	0 %	20 %	472279611
19	NC_020820	AGGAA	2	10	38082	38091	60 %	0 %	40 %	0 %	472279613
20	NC_020820	ATACT	2	10	38856	38865	40 %	40 %	0 %	20 %	472279614
21	NC_020820	TGAGG	2	10	40781	40790	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020820	AAATC	2	10	42048	42057	60 %	20 %	0 %	20 %	472279616

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.