MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-1 DNA

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020820	TTTA	2	8	307	314	25 %	75 %	0 %	0 %	472279581
2	NC_020820	TGGC	2	8	1310	1317	0 %	25 %	50 %	25 %	472279581
3	NC_020820	ACTA	2	8	2533	2540	50 %	25 %	0 %	25 %	472279582
4	NC_020820	AGAA	2	8	2777	2784	75 %	0 %	25 %	0 %	472279583
5	NC_020820	TCCA	2	8	3364	3371	25 %	25 %	0 %	50 %	472279583
6	NC_020820	AGCC	2	8	3476	3483	25 %	0 %	25 %	50 %	472279583
7	NC_020820	TGGC	2	8	4188	4195	0 %	25 %	50 %	25 %	472279583
8	NC_020820	ACTA	2	8	4256	4263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020820	CTGG	2	8	5854	5861	0 %	25 %	50 %	25 %	472279585
10	NC_020820	CTCC	2	8	7335	7342	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_020820	TGCT	2	8	7623	7630	0 %	50 %	25 %	25 %	472279586
12	NC_020820	AAAT	2	8	7647	7654	75 %	25 %	0 %	0 %	472279586
13	NC_020820	TAAT	2	8	7684	7691	50 %	50 %	0 %	0 %	472279586
14	NC_020820	TTAA	2	8	8264	8271	50 %	50 %	0 %	0 %	472279587
15	NC_020820	CCGT	2	8	8567	8574	0 %	25 %	25 %	50 %	472279588
16	NC_020820	GTTG	2	8	8713	8720	0 %	50 %	50 %	0 %	472279588
17	NC_020820	TTGA	2	8	9079	9086	25 %	50 %	25 %	0 %	472279589
18	NC_020820	GGGT	2	8	9302	9309	0 %	25 %	75 %	0 %	472279589
19	NC_020820	GTTT	2	8	9669	9676	0 %	75 %	25 %	0 %	472279589
20	NC_020820	CCAC	2	8	9986	9993	25 %	0 %	0 %	75 %	472279589
21	NC_020820	CAAT	2	8	10002	10009	50 %	25 %	0 %	25 %	472279589
22	NC_020820	TTGG	2	8	10507	10514	0 %	50 %	50 %	0 %	472279590
23	NC_020820	GCTT	2	8	10565	10572	0 %	50 %	25 %	25 %	472279590
24	NC_020820	TCGT	2	8	10747	10754	0 %	50 %	25 %	25 %	472279590
25	NC_020820	CTCA	2	8	11356	11363	25 %	25 %	0 %	50 %	472279590
26	NC_020820	ATTG	2	8	11379	11386	25 %	50 %	25 %	0 %	472279590
27	NC_020820	TCCT	2	8	11480	11487	0 %	50 %	0 %	50 %	472279591
28	NC_020820	ACAA	2	8	11967	11974	75 %	0 %	0 %	25 %	472279591
29	NC_020820	CCCA	2	8	12524	12531	25 %	0 %	0 %	75 %	472279591
30	NC_020820	CTTT	2	8	12816	12823	0 %	75 %	0 %	25 %	472279591
31	NC_020820	ATCA	2	8	13355	13362	50 %	25 %	0 %	25 %	472279591
32	NC_020820	CTTT	2	8	13425	13432	0 %	75 %	0 %	25 %	472279591
33	NC_020820	TTGG	2	8	13434	13441	0 %	50 %	50 %	0 %	472279591
34	NC_020820	TGAC	2	8	13622	13629	25 %	25 %	25 %	25 %	472279592
35	NC_020820	CATA	2	8	14025	14032	50 %	25 %	0 %	25 %	472279592
36	NC_020820	TAAA	2	8	14174	14181	75 %	25 %	0 %	0 %	472279593
37	NC_020820	TAAA	2	8	14780	14787	75 %	25 %	0 %	0 %	472279594
38	NC_020820	CTGA	2	8	15014	15021	25 %	25 %	25 %	25 %	472279595
39	NC_020820	TTGC	2	8	15293	15300	0 %	50 %	25 %	25 %	472279595
40	NC_020820	GTTT	2	8	15621	15628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020820	AATT	2	8	15656	15663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020820	GATC	2	8	15738	15745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020820	GCCT	2	8	16113	16120	0 %	25 %	25 %	50 %	472279596
44	NC_020820	TTTG	2	8	16174	16181	0 %	75 %	25 %	0 %	472279596
45	NC_020820	TAAC	2	8	16690	16697	50 %	25 %	0 %	25 %	472279596
46	NC_020820	CGTT	2	8	16773	16780	0 %	50 %	25 %	25 %	472279596
47	NC_020820	CAAC	2	8	17407	17414	50 %	0 %	0 %	50 %	472279596
48	NC_020820	TTGC	2	8	17456	17463	0 %	50 %	25 %	25 %	472279596
49	NC_020820	TTCT	2	8	17642	17649	0 %	75 %	0 %	25 %	472279596
50	NC_020820	TCTT	2	8	17721	17728	0 %	75 %	0 %	25 %	472279596
51	NC_020820	GCCA	2	8	18926	18933	25 %	0 %	25 %	50 %	472279599
52	NC_020820	GAGT	2	8	19079	19086	25 %	25 %	50 %	0 %	472279600
53	NC_020820	CTCA	2	8	19165	19172	25 %	25 %	0 %	50 %	472279600
54	NC_020820	TCTT	2	8	20023	20030	0 %	75 %	0 %	25 %	472279602
55	NC_020820	GATT	2	8	20344	20351	25 %	50 %	25 %	0 %	472279602
56	NC_020820	TGAC	2	8	20650	20657	25 %	25 %	25 %	25 %	472279602
57	NC_020820	AATT	2	8	21093	21100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020820	GCAA	2	8	21477	21484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020820	TGCG	2	8	21616	21623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020820	TTCT	2	8	22149	22156	0 %	75 %	0 %	25 %	472279604
61	NC_020820	AATA	2	8	22531	22538	75 %	25 %	0 %	0 %	472279604
62	NC_020820	TAAG	2	8	22661	22668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020820	CGAA	2	8	22905	22912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020820	AATC	2	8	23284	23291	50 %	25 %	0 %	25 %	472279605
65	NC_020820	ATCG	2	8	23413	23420	25 %	25 %	25 %	25 %	472279605
66	NC_020820	ACTA	2	8	23484	23491	50 %	25 %	0 %	25 %	472279605
67	NC_020820	GCGT	2	8	23913	23920	0 %	25 %	50 %	25 %	472279606
68	NC_020820	CTTA	2	8	24453	24460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020820	ATTA	2	8	24551	24558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020820	TAAT	2	8	24582	24589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020820	CTTG	2	8	24956	24963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020820	CGTT	2	8	26071	26078	0 %	50 %	25 %	25 %	472279607
73	NC_020820	ACGT	2	8	26287	26294	25 %	25 %	25 %	25 %	472279608
74	NC_020820	ATTT	2	8	26317	26324	25 %	75 %	0 %	0 %	472279608
75	NC_020820	TCAC	2	8	26534	26541	25 %	25 %	0 %	50 %	472279608
76	NC_020820	GTTC	2	8	26883	26890	0 %	50 %	25 %	25 %	472279608
77	NC_020820	CGAA	2	8	26957	26964	50 %	0 %	25 %	25 %	472279608
78	NC_020820	CCAA	2	8	27079	27086	50 %	0 %	0 %	50 %	472279608
79	NC_020820	AACG	2	8	27487	27494	50 %	0 %	25 %	25 %	472279608
80	NC_020820	GCAC	2	8	29409	29416	25 %	0 %	25 %	50 %	472279609
81	NC_020820	GATG	2	8	29608	29615	25 %	25 %	50 %	0 %	472279609
82	NC_020820	GTTG	2	8	30133	30140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020820	TAGA	2	8	30153	30160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020820	CATT	2	8	30189	30196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020820	TGCT	2	8	30287	30294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020820	TAGG	2	8	30502	30509	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020820	TTTG	2	8	30651	30658	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020820	CAAT	2	8	31510	31517	50 %	25 %	0 %	25 %	472279610
89	NC_020820	TCAA	2	8	32480	32487	50 %	25 %	0 %	25 %	472279610
90	NC_020820	TAAT	2	8	32849	32856	50 %	50 %	0 %	0 %	472279610
91	NC_020820	GCTG	2	8	33134	33141	0 %	25 %	50 %	25 %	472279611
92	NC_020820	CTAT	2	8	33682	33689	25 %	50 %	0 %	25 %	472279611
93	NC_020820	TTTC	2	8	33851	33858	0 %	75 %	0 %	25 %	472279611
94	NC_020820	GAAT	2	8	34336	34343	50 %	25 %	25 %	0 %	472279611
95	NC_020820	ATCG	2	8	34399	34406	25 %	25 %	25 %	25 %	472279611
96	NC_020820	GACC	2	8	34503	34510	25 %	0 %	25 %	50 %	472279611
97	NC_020820	TAAA	2	8	34699	34706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020820	GCAA	2	8	34758	34765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020820	ATTC	2	8	34902	34909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020820	TTGT	2	8	35081	35088	0 %	75 %	25 %	0 %	472279612
101	NC_020820	CCTT	2	8	36604	36611	0 %	50 %	0 %	50 %	472279613
102	NC_020820	AGAA	2	8	36653	36660	75 %	0 %	25 %	0 %	472279613
103	NC_020820	GAAG	2	8	37116	37123	50 %	0 %	50 %	0 %	472279613
104	NC_020820	ACTC	2	8	38176	38183	25 %	25 %	0 %	50 %	472279613
105	NC_020820	TATG	2	8	38348	38355	25 %	50 %	25 %	0 %	472279613
106	NC_020820	TAAG	2	8	38725	38732	50 %	25 %	25 %	0 %	472279613
107	NC_020820	TGAA	2	8	38900	38907	50 %	25 %	25 %	0 %	472279614
108	NC_020820	ATTT	2	8	39113	39120	25 %	75 %	0 %	0 %	472279614
109	NC_020820	AAAT	2	8	39222	39229	75 %	25 %	0 %	0 %	472279614
110	NC_020820	AAAT	2	8	39920	39927	75 %	25 %	0 %	0 %	472279614
111	NC_020820	ATTA	2	8	40405	40412	50 %	50 %	0 %	0 %	472279614
112	NC_020820	GAGT	2	8	41455	41462	25 %	25 %	50 %	0 %	472279616

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.