MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw58

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020817	CGCTGC	2	12	1262	1273	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020817	GGCGCT	2	12	2879	2890	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020817	GCCAAC	2	12	5988	5999	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	471265501
4	NC_020817	CTGACG	2	12	6296	6307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471265502
5	NC_020817	ACCTAC	2	12	11692	11703	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	471265508
6	NC_020817	TGATCC	2	12	21698	21709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020817	CGAGCG	2	12	30590	30601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471265525
8	NC_020817	AGGCCG	2	12	35905	35916	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471265533
9	NC_020817	AGGCCA	2	12	36231	36242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265534
10	NC_020817	TACCTG	2	12	36320	36331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	471265534
11	NC_020817	GAGTTG	2	12	36386	36397	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	471265534
12	NC_020817	GCCGTC	2	12	38054	38065	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471265537
13	NC_020817	TGCGCT	2	12	38658	38669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265537
14	NC_020817	GGCTCG	2	12	39514	39525	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	471265538
15	NC_020817	CGAAGG	2	12	40538	40549	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	471265540
16	NC_020817	GCTTCG	2	12	45681	45692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265548
17	NC_020817	GCGAAC	2	12	46640	46651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265549
18	NC_020817	TCACGT	2	12	51448	51459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	471265555
19	NC_020817	GGATCA	2	12	54107	54118	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	471265558

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.