MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw58

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020817	CTCA	2	8	334	341	25 %	25 %	0 %	50 %	471265494
2	NC_020817	GTCG	2	8	619	626	0 %	25 %	50 %	25 %	471265494
3	NC_020817	ACAA	2	8	708	715	75 %	0 %	0 %	25 %	471265494
4	NC_020817	TCGA	2	8	842	849	25 %	25 %	25 %	25 %	471265494
5	NC_020817	TGCG	2	8	1294	1301	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020817	CTAT	2	8	2261	2268	25 %	50 %	0 %	25 %	471265496
7	NC_020817	GGCG	2	8	2450	2457	0 %	0 %	75 %	25 %	471265496
8	NC_020817	CTGG	2	8	2679	2686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020817	TGCC	2	8	2741	2748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020817	CGCC	2	8	3391	3398	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_020817	GGCG	2	8	3568	3575	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020817	GACG	2	8	3710	3717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020817	GGTC	2	8	5187	5194	0 %	25 %	50 %	25 %	471265500
14	NC_020817	GCCT	2	8	5531	5538	0 %	25 %	25 %	50 %	471265500
15	NC_020817	CAAG	2	8	5585	5592	50 %	0 %	25 %	25 %	471265500
16	NC_020817	TCGA	2	8	6167	6174	25 %	25 %	25 %	25 %	471265502
17	NC_020817	CGTG	2	8	6592	6599	0 %	25 %	50 %	25 %	471265502
18	NC_020817	CGCT	2	8	7370	7377	0 %	25 %	25 %	50 %	471265502
19	NC_020817	GAAC	2	8	7409	7416	50 %	0 %	25 %	25 %	471265502
20	NC_020817	TTGG	2	8	7426	7433	0 %	50 %	50 %	0 %	471265502
21	NC_020817	ACCG	2	8	7981	7988	25 %	0 %	25 %	50 %	471265502
22	NC_020817	TCGT	2	8	8084	8091	0 %	50 %	25 %	25 %	471265502
23	NC_020817	TACG	2	8	8305	8312	25 %	25 %	25 %	25 %	471265502
24	NC_020817	TGAT	2	8	9063	9070	25 %	50 %	25 %	0 %	471265502
25	NC_020817	AGCG	2	8	9898	9905	25 %	0 %	50 %	25 %	471265504
26	NC_020817	TGAG	2	8	9926	9933	25 %	25 %	50 %	0 %	471265504
27	NC_020817	CCCG	2	8	10434	10441	0 %	0 %	25 %	75 %	471265505
28	NC_020817	TGCC	2	8	11796	11803	0 %	25 %	25 %	50 %	471265508
29	NC_020817	CGCC	2	8	11871	11878	0 %	0 %	25 %	75 %	471265508
30	NC_020817	GAAG	2	8	12017	12024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020817	AGCC	2	8	12140	12147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020817	TTCG	2	8	12749	12756	0 %	50 %	25 %	25 %	471265510
33	NC_020817	GCCG	2	8	13182	13189	0 %	0 %	50 %	50 %	471265510
34	NC_020817	ACGC	2	8	13203	13210	25 %	0 %	25 %	50 %	471265510
35	NC_020817	CAGC	2	8	13218	13225	25 %	0 %	25 %	50 %	471265510
36	NC_020817	GTTC	2	8	13252	13259	0 %	50 %	25 %	25 %	471265510
37	NC_020817	GCCA	2	8	14035	14042	25 %	0 %	25 %	50 %	471265510
38	NC_020817	GCCA	2	8	14239	14246	25 %	0 %	25 %	50 %	471265510
39	NC_020817	GCCA	2	8	14341	14348	25 %	0 %	25 %	50 %	471265510
40	NC_020817	GCCA	2	8	14443	14450	25 %	0 %	25 %	50 %	471265510
41	NC_020817	GCCA	2	8	14644	14651	25 %	0 %	25 %	50 %	471265510
42	NC_020817	GCCA	2	8	14950	14957	25 %	0 %	25 %	50 %	471265510
43	NC_020817	GCCT	2	8	15562	15569	0 %	25 %	25 %	50 %	471265510
44	NC_020817	CCCA	2	8	15725	15732	25 %	0 %	0 %	75 %	471265510
45	NC_020817	TGCA	2	8	15944	15951	25 %	25 %	25 %	25 %	471265510
46	NC_020817	GTAA	2	8	16367	16374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020817	TCGA	2	8	16650	16657	25 %	25 %	25 %	25 %	471265511
48	NC_020817	TTGT	2	8	16784	16791	0 %	75 %	25 %	0 %	471265511
49	NC_020817	CGAC	2	8	16873	16880	25 %	0 %	25 %	50 %	471265511
50	NC_020817	TGAG	2	8	17158	17165	25 %	25 %	50 %	0 %	471265511
51	NC_020817	GCCG	2	8	17291	17298	0 %	0 %	50 %	50 %	471265511
52	NC_020817	GTCC	2	8	17630	17637	0 %	25 %	25 %	50 %	471265512
53	NC_020817	CGAG	2	8	18562	18569	25 %	0 %	50 %	25 %	471265514
54	NC_020817	GGCT	2	8	18696	18703	0 %	25 %	50 %	25 %	471265514
55	NC_020817	CGTG	2	8	18953	18960	0 %	25 %	50 %	25 %	471265514
56	NC_020817	GCCC	2	8	19369	19376	0 %	0 %	25 %	75 %	471265514
57	NC_020817	CGCT	2	8	19746	19753	0 %	25 %	25 %	50 %	471265514
58	NC_020817	CTGA	2	8	20037	20044	25 %	25 %	25 %	25 %	471265514
59	NC_020817	GCTC	2	8	20716	20723	0 %	25 %	25 %	50 %	471265514
60	NC_020817	TTAC	2	8	22457	22464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020817	ATGC	2	8	22879	22886	25 %	25 %	25 %	25 %	471265518
62	NC_020817	TGGG	2	8	23099	23106	0 %	25 %	75 %	0 %	471265518
63	NC_020817	AGGC	2	8	23262	23269	25 %	0 %	50 %	25 %	471265518
64	NC_020817	TGGC	2	8	23571	23578	0 %	25 %	50 %	25 %	471265518
65	NC_020817	TGGC	2	8	23673	23680	0 %	25 %	50 %	25 %	471265518
66	NC_020817	TGGC	2	8	24285	24292	0 %	25 %	50 %	25 %	471265518
67	NC_020817	TGGC	2	8	24489	24496	0 %	25 %	50 %	25 %	471265518
68	NC_020817	TGGC	2	8	24591	24598	0 %	25 %	50 %	25 %	471265518
69	NC_020817	CATG	2	8	25167	25174	25 %	25 %	25 %	25 %	471265518
70	NC_020817	CGAA	2	8	25478	25485	50 %	0 %	25 %	25 %	471265518
71	NC_020817	GCGT	2	8	25528	25535	0 %	25 %	50 %	25 %	471265518
72	NC_020817	CGGC	2	8	25549	25556	0 %	0 %	50 %	50 %	471265518
73	NC_020817	CGAA	2	8	25982	25989	50 %	0 %	25 %	25 %	471265518
74	NC_020817	CCAT	2	8	26276	26283	25 %	25 %	0 %	50 %	471265519
75	NC_020817	AAAG	2	8	26362	26369	75 %	0 %	25 %	0 %	471265519
76	NC_020817	CGGT	2	8	26507	26514	0 %	25 %	50 %	25 %	471265519
77	NC_020817	GCCG	2	8	26973	26980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020817	TGGC	2	8	27151	27158	0 %	25 %	50 %	25 %	471265520
79	NC_020817	GCGA	2	8	27662	27669	25 %	0 %	50 %	25 %	471265521
80	NC_020817	GATC	2	8	27718	27725	25 %	25 %	25 %	25 %	471265521
81	NC_020817	CAGG	2	8	27733	27740	25 %	0 %	50 %	25 %	471265521
82	NC_020817	GTCT	2	8	27856	27863	0 %	50 %	25 %	25 %	471265521
83	NC_020817	CGAA	2	8	28476	28483	50 %	0 %	25 %	25 %	471265522
84	NC_020817	TCCG	2	8	28769	28776	0 %	25 %	25 %	50 %	471265522
85	NC_020817	CGAC	2	8	28834	28841	25 %	0 %	25 %	50 %	471265522
86	NC_020817	TGCC	2	8	28988	28995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020817	TATG	2	8	29290	29297	25 %	50 %	25 %	0 %	471265523
88	NC_020817	GCCG	2	8	29975	29982	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
89	NC_020817	GACC	2	8	30164	30171	25 %	0 %	25 %	50 %	471265525
90	NC_020817	AACG	2	8	30333	30340	50 %	0 %	25 %	25 %	471265525
91	NC_020817	GCCG	2	8	30752	30759	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
92	NC_020817	CGGC	2	8	30779	30786	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
93	NC_020817	CAGT	2	8	30867	30874	25 %	25 %	25 %	25 %	471265525
94	NC_020817	GCCG	2	8	30882	30889	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
95	NC_020817	ACGA	2	8	30907	30914	50 %	0 %	25 %	25 %	471265525
96	NC_020817	AGAT	2	8	31071	31078	50 %	25 %	25 %	0 %	471265525
97	NC_020817	CCGG	2	8	31241	31248	0 %	0 %	50 %	50 %	471265526
98	NC_020817	AGGA	2	8	31340	31347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020817	GCCG	2	8	32374	32381	0 %	0 %	50 %	50 %	471265527
100	NC_020817	CCGT	2	8	32877	32884	0 %	25 %	25 %	50 %	471265528
101	NC_020817	CACT	2	8	33278	33285	25 %	25 %	0 %	50 %	471265529
102	NC_020817	AGCC	2	8	33487	33494	25 %	0 %	25 %	50 %	471265529
103	NC_020817	CCCA	2	8	33673	33680	25 %	0 %	0 %	75 %	471265529
104	NC_020817	CAAC	2	8	34003	34010	50 %	0 %	0 %	50 %	471265529
105	NC_020817	GCCG	2	8	34295	34302	0 %	0 %	50 %	50 %	471265530
106	NC_020817	ACGG	2	8	34605	34612	25 %	0 %	50 %	25 %	471265530
107	NC_020817	AGCC	2	8	34786	34793	25 %	0 %	25 %	50 %	471265530
108	NC_020817	CAAG	2	8	34952	34959	50 %	0 %	25 %	25 %	471265530
109	NC_020817	CAGA	2	8	35064	35071	50 %	0 %	25 %	25 %	471265530
110	NC_020817	TTAT	2	8	35166	35173	25 %	75 %	0 %	0 %	471265531
111	NC_020817	AGCA	2	8	35328	35335	50 %	0 %	25 %	25 %	471265531
112	NC_020817	CTGG	2	8	36268	36275	0 %	25 %	50 %	25 %	471265534
113	NC_020817	CGTC	2	8	37120	37127	0 %	25 %	25 %	50 %	471265535
114	NC_020817	AAGA	2	8	37675	37682	75 %	0 %	25 %	0 %	471265536
115	NC_020817	ACCC	2	8	37972	37979	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_020817	GCTC	2	8	38685	38692	0 %	25 %	25 %	50 %	471265537
117	NC_020817	CGGC	2	8	38975	38982	0 %	0 %	50 %	50 %	471265538
118	NC_020817	GCTG	2	8	39557	39564	0 %	25 %	50 %	25 %	471265538
119	NC_020817	CTGC	2	8	39821	39828	0 %	25 %	25 %	50 %	471265538
120	NC_020817	ACAA	2	8	39934	39941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020817	TCGA	2	8	40068	40075	25 %	25 %	25 %	25 %	471265539
122	NC_020817	GCCG	2	8	40370	40377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020817	CAGC	2	8	40838	40845	25 %	0 %	25 %	50 %	471265540
124	NC_020817	TGCC	2	8	41121	41128	0 %	25 %	25 %	50 %	471265540
125	NC_020817	CCGG	2	8	41174	41181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020817	CGGC	2	8	41196	41203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020817	ATTC	2	8	41379	41386	25 %	50 %	0 %	25 %	471265541
128	NC_020817	CAGC	2	8	41741	41748	25 %	0 %	25 %	50 %	471265541
129	NC_020817	CGAC	2	8	41824	41831	25 %	0 %	25 %	50 %	471265541
130	NC_020817	TGGC	2	8	41925	41932	0 %	25 %	50 %	25 %	471265541
131	NC_020817	CGGC	2	8	42521	42528	0 %	0 %	50 %	50 %	471265542
132	NC_020817	CTTT	2	8	42810	42817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020817	CCGC	2	8	43027	43034	0 %	0 %	25 %	75 %	471265543
134	NC_020817	CGGC	2	8	43360	43367	0 %	0 %	50 %	50 %	471265543
135	NC_020817	TCGG	2	8	43826	43833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020817	ACCG	2	8	44882	44889	25 %	0 %	25 %	50 %	471265546
137	NC_020817	CCGC	2	8	45173	45180	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_020817	CCGG	2	8	46484	46491	0 %	0 %	50 %	50 %	471265549
139	NC_020817	AGGC	2	8	46535	46542	25 %	0 %	50 %	25 %	471265549
140	NC_020817	GGCC	2	8	46731	46738	0 %	0 %	50 %	50 %	471265549
141	NC_020817	TTCG	2	8	47157	47164	0 %	50 %	25 %	25 %	471265550
142	NC_020817	CACC	2	8	48651	48658	25 %	0 %	0 %	75 %	471265551
143	NC_020817	GCCC	2	8	48854	48861	0 %	0 %	25 %	75 %	471265551
144	NC_020817	GCCT	2	8	48952	48959	0 %	25 %	25 %	50 %	471265551
145	NC_020817	AGAA	2	8	49237	49244	75 %	0 %	25 %	0 %	471265551
146	NC_020817	AGAA	2	8	49660	49667	75 %	0 %	25 %	0 %	471265552
147	NC_020817	CGCC	2	8	49761	49768	0 %	0 %	25 %	75 %	471265552
148	NC_020817	TTTC	2	8	50181	50188	0 %	75 %	0 %	25 %	471265553
149	NC_020817	GGAA	2	8	51564	51571	50 %	0 %	50 %	0 %	471265555
150	NC_020817	AGCG	2	8	51892	51899	25 %	0 %	50 %	25 %	471265555
151	NC_020817	GAAC	2	8	52477	52484	50 %	0 %	25 %	25 %	471265555
152	NC_020817	AACA	2	8	52583	52590	75 %	0 %	0 %	25 %	471265555
153	NC_020817	GGCG	2	8	52967	52974	0 %	0 %	75 %	25 %	471265555
154	NC_020817	CGAA	2	8	53039	53046	50 %	0 %	25 %	25 %	471265556
155	NC_020817	GCGG	2	8	53160	53167	0 %	0 %	75 %	25 %	471265556
156	NC_020817	CGAT	2	8	53471	53478	25 %	25 %	25 %	25 %	471265557
157	NC_020817	GGCG	2	8	54092	54099	0 %	0 %	75 %	25 %	471265558
158	NC_020817	GAGC	2	8	55093	55100	25 %	0 %	50 %	25 %	471265559
159	NC_020817	TCAG	2	8	55772	55779	25 %	25 %	25 %	25 %	471265559
160	NC_020817	AGCG	2	8	56063	56070	25 %	0 %	50 %	25 %	471265559
161	NC_020817	GGGC	2	8	56440	56447	0 %	0 %	75 %	25 %	471265559
162	NC_020817	CACG	2	8	56856	56863	25 %	0 %	25 %	50 %	471265559
163	NC_020817	CCAG	2	8	57111	57118	25 %	0 %	25 %	50 %	471265559
164	NC_020817	CGGA	2	8	58178	58185	25 %	0 %	50 %	25 %	471265561

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.