MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw58

Total Repeats: 715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020817	GGC	2	6	199	204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265494
2	NC_020817	GCG	2	6	237	242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265494
3	NC_020817	CTG	2	6	272	277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265494
4	NC_020817	GGC	2	6	290	295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265494
5	NC_020817	TGG	2	6	357	362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265494
6	NC_020817	GCT	2	6	388	393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265494
7	NC_020817	ACC	2	6	416	421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265494
8	NC_020817	CGC	2	6	561	566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265494
9	NC_020817	GGC	2	6	586	591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265494
10	NC_020817	CCA	2	6	780	785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265494
11	NC_020817	CTG	2	6	788	793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265494
12	NC_020817	AAG	2	6	833	838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265494
13	NC_020817	CGG	2	6	890	895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265494
14	NC_020817	CCG	2	6	1502	1507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265495
15	NC_020817	GCC	2	6	1594	1599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265495
16	NC_020817	CGC	2	6	1605	1610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265495
17	NC_020817	GGC	2	6	1625	1630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265495
18	NC_020817	ATC	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265495
19	NC_020817	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265496
20	NC_020817	TCC	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471265496
21	NC_020817	GCA	2	6	2022	2027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265496
22	NC_020817	TAA	2	6	2096	2101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471265496
23	NC_020817	GAT	2	6	2433	2438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265496
24	NC_020817	GCT	2	6	2492	2497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265496
25	NC_020817	TGA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265496
26	NC_020817	GAT	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265497
27	NC_020817	GCC	2	6	4010	4015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265497
28	NC_020817	CGC	2	6	4042	4047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265497
29	NC_020817	GGT	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265497
30	NC_020817	GCC	2	6	4121	4126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265497
31	NC_020817	GCA	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265497
32	NC_020817	CGT	2	6	4221	4226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265497
33	NC_020817	CTG	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265498
34	NC_020817	CGA	2	6	4434	4439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265498
35	NC_020817	TGG	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265498
36	NC_020817	ATC	2	6	4593	4598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265499
37	NC_020817	CGG	2	6	4697	4702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265499
38	NC_020817	GCG	2	6	4721	4726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265499
39	NC_020817	AGC	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265500
40	NC_020817	CGC	2	6	5111	5116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265500
41	NC_020817	GAC	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265500
42	NC_020817	GTG	2	6	5246	5251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265500
43	NC_020817	GGT	2	6	5359	5364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265500
44	NC_020817	CGA	2	6	5539	5544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265500
45	NC_020817	GCC	2	6	5555	5560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265500
46	NC_020817	TGG	2	6	5564	5569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265500
47	NC_020817	CGG	2	6	5608	5613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265500
48	NC_020817	CAA	2	6	5635	5640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265500
49	NC_020817	CAC	2	6	5741	5746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265501
50	NC_020817	CCA	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265501
51	NC_020817	GCC	2	6	5811	5816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265501
52	NC_020817	GCC	2	6	5865	5870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265501
53	NC_020817	CGG	2	6	5907	5912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265501
54	NC_020817	CGA	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265501
55	NC_020817	GTC	2	6	6209	6214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265502
56	NC_020817	CGG	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265502
57	NC_020817	CTA	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265502
58	NC_020817	CGG	2	6	6499	6504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265502
59	NC_020817	CGA	2	6	6706	6711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265502
60	NC_020817	AGA	2	6	6756	6761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265502
61	NC_020817	GCA	2	6	6805	6810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265502
62	NC_020817	CGC	2	6	6907	6912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265502
63	NC_020817	GCC	2	6	6956	6961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265502
64	NC_020817	TCA	2	6	7035	7040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265502
65	NC_020817	AGA	2	6	7107	7112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265502
66	NC_020817	CGA	2	6	7128	7133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265502
67	NC_020817	CAT	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265502
68	NC_020817	CGC	2	6	7196	7201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265502
69	NC_020817	TGG	2	6	7216	7221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265502
70	NC_020817	GCG	2	6	7256	7261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265502
71	NC_020817	GCT	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265502
72	NC_020817	CCA	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265502
73	NC_020817	GGA	2	6	7363	7368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265502
74	NC_020817	CAC	2	6	7456	7461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265502
75	NC_020817	CAT	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265502
76	NC_020817	TGC	2	6	7626	7631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265502
77	NC_020817	GGA	2	6	7657	7662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265502
78	NC_020817	GCA	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265502
79	NC_020817	CCG	2	6	7860	7865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265502
80	NC_020817	CCG	2	6	8095	8100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265502
81	NC_020817	CAA	2	6	8113	8118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265502
82	NC_020817	GGC	3	9	8122	8130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265502
83	NC_020817	CAT	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265502
84	NC_020817	GCC	2	6	8201	8206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265502
85	NC_020817	GGC	2	6	8267	8272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265502
86	NC_020817	CGG	2	6	8275	8280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265502
87	NC_020817	ACC	2	6	8289	8294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265502
88	NC_020817	CAT	2	6	8362	8367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265502
89	NC_020817	CTG	2	6	8375	8380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265502
90	NC_020817	CTG	2	6	8462	8467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265502
91	NC_020817	TTC	2	6	8513	8518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265502
92	NC_020817	CCG	2	6	8727	8732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265502
93	NC_020817	CTG	2	6	8747	8752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265502
94	NC_020817	CAA	2	6	8800	8805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265502
95	NC_020817	TCT	2	6	8838	8843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265502
96	NC_020817	CGG	2	6	8845	8850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265502
97	NC_020817	TCT	2	6	8931	8936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265502
98	NC_020817	GGA	2	6	9001	9006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265502
99	NC_020817	CTG	2	6	9348	9353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265503
100	NC_020817	TCG	2	6	9513	9518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265503
101	NC_020817	AGC	2	6	9570	9575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265503
102	NC_020817	TTG	2	6	9582	9587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265503
103	NC_020817	GGT	2	6	9645	9650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265504
104	NC_020817	CCG	2	6	9694	9699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265504
105	NC_020817	GCA	2	6	9706	9711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265504
106	NC_020817	ATG	2	6	9712	9717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265504
107	NC_020817	CGA	2	6	9734	9739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265504
108	NC_020817	CGC	2	6	9769	9774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265504
109	NC_020817	CGA	2	6	9794	9799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265504
110	NC_020817	ACC	2	6	9988	9993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265504
111	NC_020817	CAG	2	6	10097	10102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265504
112	NC_020817	TGC	2	6	10454	10459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265505
113	NC_020817	TAC	2	6	10534	10539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265505
114	NC_020817	GCT	2	6	10551	10556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265505
115	NC_020817	CCG	2	6	10574	10579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265505
116	NC_020817	GCT	2	6	10632	10637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265505
117	NC_020817	AAC	2	6	10693	10698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265506
118	NC_020817	TGC	2	6	10765	10770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265506
119	NC_020817	TCT	2	6	11260	11265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265507
120	NC_020817	CGG	2	6	11411	11416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265507
121	NC_020817	ATC	2	6	11436	11441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265507
122	NC_020817	ACT	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265508
123	NC_020817	GCA	2	6	11721	11726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265508
124	NC_020817	TCG	2	6	11888	11893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265508
125	NC_020817	GGA	2	6	11934	11939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265508
126	NC_020817	CGT	2	6	11964	11969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265508
127	NC_020817	CGG	2	6	12846	12851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265510
128	NC_020817	CGG	2	6	12874	12879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265510
129	NC_020817	CGG	2	6	12932	12937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265510
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249	NC_020817	GGA	2	6	22053	22058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265516
250	NC_020817	GCC	2	6	22078	22083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265516
251	NC_020817	GAA	2	6	22137	22142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265517
252	NC_020817	TAC	2	6	22191	22196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265517
253	NC_020817	CTG	2	6	22245	22250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265517
254	NC_020817	CAC	2	6	22263	22268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265517
255	NC_020817	CTC	2	6	22538	22543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471265518
256	NC_020817	ATC	2	6	22562	22567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265518
257	NC_020817	GCC	2	6	22661	22666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265518
258	NC_020817	GCT	2	6	22805	22810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265518
259	NC_020817	GGA	2	6	22954	22959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265518
260	NC_020817	AAC	2	6	23043	23048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265518
261	NC_020817	TCA	2	6	23082	23087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265518
262	NC_020817	CCG	2	6	23256	23261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265518
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270	NC_020817	CCA	2	6	23584	23589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265518
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274	NC_020817	CCA	2	6	23890	23895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265518
275	NC_020817	CCA	2	6	24094	24099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265518
276	NC_020817	GCC	2	6	24275	24280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265518
277	NC_020817	CCA	2	6	24400	24405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265518
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285	NC_020817	CCA	2	6	25114	25119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265518
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293	NC_020817	TGG	2	6	25639	25644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265518
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365	NC_020817	CCG	2	6	32908	32913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265528
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377	NC_020817	GCA	3	9	34013	34021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265529
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