MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw58

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020817	GC	3	6	146	151	0 %	0 %	50 %	50 %	471265494
2	NC_020817	CG	3	6	159	164	0 %	0 %	50 %	50 %	471265494
3	NC_020817	CG	3	6	250	255	0 %	0 %	50 %	50 %	471265494
4	NC_020817	CG	3	6	517	522	0 %	0 %	50 %	50 %	471265494
5	NC_020817	AG	3	6	1012	1017	50 %	0 %	50 %	0 %	471265494
6	NC_020817	CG	3	6	1141	1146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020817	GC	3	6	1540	1545	0 %	0 %	50 %	50 %	471265495
8	NC_020817	AT	4	8	1984	1991	50 %	50 %	0 %	0 %	471265496
9	NC_020817	GC	3	6	2070	2075	0 %	0 %	50 %	50 %	471265496
10	NC_020817	GC	3	6	2926	2931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020817	GC	3	6	3732	3737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020817	GC	3	6	4109	4114	0 %	0 %	50 %	50 %	471265497
13	NC_020817	CG	3	6	4876	4881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020817	CG	3	6	4984	4989	0 %	0 %	50 %	50 %	471265500
15	NC_020817	GT	3	6	5319	5324	0 %	50 %	50 %	0 %	471265500
16	NC_020817	GC	3	6	6390	6395	0 %	0 %	50 %	50 %	471265502
17	NC_020817	CG	3	6	6521	6526	0 %	0 %	50 %	50 %	471265502
18	NC_020817	CG	3	6	7011	7016	0 %	0 %	50 %	50 %	471265502
19	NC_020817	GC	3	6	7094	7099	0 %	0 %	50 %	50 %	471265502
20	NC_020817	TG	3	6	7538	7543	0 %	50 %	50 %	0 %	471265502
21	NC_020817	GC	3	6	9330	9335	0 %	0 %	50 %	50 %	471265503
22	NC_020817	GC	3	6	9817	9822	0 %	0 %	50 %	50 %	471265504
23	NC_020817	AG	3	6	9958	9963	50 %	0 %	50 %	0 %	471265504
24	NC_020817	AC	3	6	10154	10159	50 %	0 %	0 %	50 %	471265504
25	NC_020817	TA	3	6	10355	10360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020817	GC	5	10	10895	10904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020817	CG	3	6	11774	11779	0 %	0 %	50 %	50 %	471265508
28	NC_020817	CG	3	6	13119	13124	0 %	0 %	50 %	50 %	471265510
29	NC_020817	GC	3	6	13131	13136	0 %	0 %	50 %	50 %	471265510
30	NC_020817	AC	3	6	13303	13308	50 %	0 %	0 %	50 %	471265510
31	NC_020817	AC	3	6	13399	13404	50 %	0 %	0 %	50 %	471265510
32	NC_020817	CT	3	6	16482	16487	0 %	50 %	0 %	50 %	471265511
33	NC_020817	CG	3	6	16977	16982	0 %	0 %	50 %	50 %	471265511
34	NC_020817	GC	3	6	17243	17248	0 %	0 %	50 %	50 %	471265511
35	NC_020817	CG	3	6	17335	17340	0 %	0 %	50 %	50 %	471265511
36	NC_020817	CG	3	6	17347	17352	0 %	0 %	50 %	50 %	471265511
37	NC_020817	GA	3	6	17572	17577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020817	GC	3	6	17705	17710	0 %	0 %	50 %	50 %	471265512
39	NC_020817	GC	3	6	18034	18039	0 %	0 %	50 %	50 %	471265513
40	NC_020817	CA	3	6	18269	18274	50 %	0 %	0 %	50 %	471265514
41	NC_020817	GC	3	6	18324	18329	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
42	NC_020817	GC	3	6	19117	19122	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
43	NC_020817	GC	3	6	19615	19620	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
44	NC_020817	CG	3	6	19795	19800	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
45	NC_020817	GC	3	6	19830	19835	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
46	NC_020817	GC	3	6	19956	19961	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
47	NC_020817	CG	3	6	19966	19971	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
48	NC_020817	CG	5	10	20051	20060	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
49	NC_020817	GC	3	6	20919	20924	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
50	NC_020817	GC	3	6	20992	20997	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
51	NC_020817	CG	4	8	21176	21183	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
52	NC_020817	GC	3	6	21990	21995	0 %	0 %	50 %	50 %	471265516
53	NC_020817	GT	3	6	25334	25339	0 %	50 %	50 %	0 %	471265518
54	NC_020817	GT	3	6	25430	25435	0 %	50 %	50 %	0 %	471265518
55	NC_020817	GC	3	6	25602	25607	0 %	0 %	50 %	50 %	471265518
56	NC_020817	CG	3	6	25614	25619	0 %	0 %	50 %	50 %	471265518
57	NC_020817	CG	3	6	26291	26296	0 %	0 %	50 %	50 %	471265519
58	NC_020817	GC	3	6	26811	26816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020817	GC	3	6	27269	27274	0 %	0 %	50 %	50 %	471265520
60	NC_020817	GC	3	6	28412	28417	0 %	0 %	50 %	50 %	471265522
61	NC_020817	GC	3	6	28505	28510	0 %	0 %	50 %	50 %	471265522
62	NC_020817	AT	3	6	28875	28880	50 %	50 %	0 %	0 %	471265522
63	NC_020817	AG	3	6	28924	28929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020817	TC	3	6	29254	29259	0 %	50 %	0 %	50 %	471265523
65	NC_020817	GC	3	6	30714	30719	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
66	NC_020817	GC	3	6	30800	30805	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
67	NC_020817	CG	4	8	31703	31710	0 %	0 %	50 %	50 %	471265527
68	NC_020817	GC	3	6	32210	32215	0 %	0 %	50 %	50 %	471265527
69	NC_020817	GC	3	6	32291	32296	0 %	0 %	50 %	50 %	471265527
70	NC_020817	TA	4	8	32815	32822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020817	GC	3	6	33074	33079	0 %	0 %	50 %	50 %	471265528
72	NC_020817	CG	3	6	33380	33385	0 %	0 %	50 %	50 %	471265529
73	NC_020817	CG	3	6	33941	33946	0 %	0 %	50 %	50 %	471265529
74	NC_020817	GC	3	6	33973	33978	0 %	0 %	50 %	50 %	471265529
75	NC_020817	GC	3	6	35026	35031	0 %	0 %	50 %	50 %	471265530
76	NC_020817	AT	3	6	35372	35377	50 %	50 %	0 %	0 %	471265531
77	NC_020817	GT	3	6	35418	35423	0 %	50 %	50 %	0 %	471265531
78	NC_020817	CG	3	6	36014	36019	0 %	0 %	50 %	50 %	471265533
79	NC_020817	CA	3	6	37882	37887	50 %	0 %	0 %	50 %	471265536
80	NC_020817	CT	3	6	38114	38119	0 %	50 %	0 %	50 %	471265537
81	NC_020817	CG	3	6	38353	38358	0 %	0 %	50 %	50 %	471265537
82	NC_020817	GC	3	6	38459	38464	0 %	0 %	50 %	50 %	471265537
83	NC_020817	CG	4	8	38733	38740	0 %	0 %	50 %	50 %	471265537
84	NC_020817	CG	3	6	39695	39700	0 %	0 %	50 %	50 %	471265538
85	NC_020817	AG	3	6	40238	40243	50 %	0 %	50 %	0 %	471265539
86	NC_020817	GC	3	6	40628	40633	0 %	0 %	50 %	50 %	471265540
87	NC_020817	CG	3	6	42145	42150	0 %	0 %	50 %	50 %	471265541
88	NC_020817	GC	3	6	43484	43489	0 %	0 %	50 %	50 %	471265544
89	NC_020817	CG	3	6	43615	43620	0 %	0 %	50 %	50 %	471265544
90	NC_020817	GC	3	6	44565	44570	0 %	0 %	50 %	50 %	471265545
91	NC_020817	GC	3	6	44761	44766	0 %	0 %	50 %	50 %	471265546
92	NC_020817	CG	3	6	45251	45256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020817	TC	3	6	45277	45282	0 %	50 %	0 %	50 %	471265547
94	NC_020817	GC	3	6	45834	45839	0 %	0 %	50 %	50 %	471265548
95	NC_020817	CG	3	6	47568	47573	0 %	0 %	50 %	50 %	471265550
96	NC_020817	GC	3	6	47735	47740	0 %	0 %	50 %	50 %	471265550
97	NC_020817	CG	3	6	48380	48385	0 %	0 %	50 %	50 %	471265550
98	NC_020817	CA	3	6	48454	48459	50 %	0 %	0 %	50 %	471265550
99	NC_020817	GC	3	6	49325	49330	0 %	0 %	50 %	50 %	471265552
100	NC_020817	CG	3	6	49696	49701	0 %	0 %	50 %	50 %	471265552
101	NC_020817	GC	3	6	50170	50175	0 %	0 %	50 %	50 %	471265553
102	NC_020817	AC	3	6	50811	50816	50 %	0 %	0 %	50 %	471265554
103	NC_020817	GC	3	6	51265	51270	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
104	NC_020817	GA	3	6	51540	51545	50 %	0 %	50 %	0 %	471265555
105	NC_020817	CG	3	6	52373	52378	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
106	NC_020817	GC	3	6	52463	52468	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
107	NC_020817	CG	3	6	52686	52691	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
108	NC_020817	GC	3	6	52763	52768	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
109	NC_020817	GC	3	6	53060	53065	0 %	0 %	50 %	50 %	471265556
110	NC_020817	GC	3	6	54634	54639	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
111	NC_020817	GC	3	6	54819	54824	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
112	NC_020817	CG	3	6	54891	54896	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
113	NC_020817	CG	5	10	55756	55765	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
114	NC_020817	CG	3	6	55845	55850	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
115	NC_020817	GC	3	6	55855	55860	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
116	NC_020817	GC	3	6	55981	55986	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
117	NC_020817	CG	3	6	56016	56021	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
118	NC_020817	GC	3	6	56196	56201	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
119	NC_020817	GC	3	6	56694	56699	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
120	NC_020817	GC	3	6	57487	57492	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
121	NC_020817	TG	3	6	57542	57547	0 %	50 %	50 %	0 %	471265559
122	NC_020817	GC	3	6	57777	57782	0 %	0 %	50 %	50 %	471265560
123	NC_020817	GC	3	6	58106	58111	0 %	0 %	50 %	50 %	471265561
124	NC_020817	CT	3	6	58238	58243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.