MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw19

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020816	GGGTG	2	10	170	179	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020816	AGCGA	2	10	303	312	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020816	TCGCC	2	10	1325	1334	0 %	20 %	20 %	60 %	471265476
4	NC_020816	GCCAT	2	10	1409	1418	20 %	20 %	20 %	40 %	471265476
5	NC_020816	TCGCG	2	10	2011	2020	0 %	20 %	40 %	40 %	471265477
6	NC_020816	GGCGT	2	10	3004	3013	0 %	20 %	60 %	20 %	471265479
7	NC_020816	CCGCA	2	10	6654	6663	20 %	0 %	20 %	60 %	471265482
8	NC_020816	GGATG	2	10	8099	8108	20 %	20 %	60 %	0 %	471265483
9	NC_020816	GGCTT	2	10	9786	9795	0 %	40 %	40 %	20 %	471265483
10	NC_020816	CCGAT	2	10	10173	10182	20 %	20 %	20 %	40 %	471265483
11	NC_020816	AGCGA	2	10	10706	10715	40 %	0 %	40 %	20 %	471265483
12	NC_020816	CAGCG	2	10	10806	10815	20 %	0 %	40 %	40 %	471265483
13	NC_020816	GTTGC	2	10	11502	11511	0 %	40 %	40 %	20 %	471265484
14	NC_020816	CACGG	2	10	12462	12471	20 %	0 %	40 %	40 %	471265485
15	NC_020816	GCTTG	2	10	13351	13360	0 %	40 %	40 %	20 %	471265485
16	NC_020816	ACCCG	2	10	13496	13505	20 %	0 %	20 %	60 %	471265485
17	NC_020816	GCGCC	2	10	13775	13784	0 %	0 %	40 %	60 %	471265485
18	NC_020816	GCCGC	2	10	14349	14358	0 %	0 %	40 %	60 %	471265485
19	NC_020816	ATCCG	2	10	16048	16057	20 %	20 %	20 %	40 %	471265488
20	NC_020816	TGGCG	2	10	17823	17832	0 %	20 %	60 %	20 %	471265490
21	NC_020816	TGCCC	2	10	18508	18517	0 %	20 %	20 %	60 %	471265491

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.