MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw19

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020816	TCGA	2	8	743	750	25 %	25 %	25 %	25 %	471265476
2	NC_020816	AGAA	2	8	992	999	75 %	0 %	25 %	0 %	471265476
3	NC_020816	CCGT	2	8	1445	1452	0 %	25 %	25 %	50 %	471265476
4	NC_020816	TCTT	2	8	1487	1494	0 %	75 %	0 %	25 %	471265476
5	NC_020816	CGGC	2	8	1707	1714	0 %	0 %	50 %	50 %	471265476
6	NC_020816	TCGA	2	8	2150	2157	25 %	25 %	25 %	25 %	471265477
7	NC_020816	CTGG	2	8	2561	2568	0 %	25 %	50 %	25 %	471265478
8	NC_020816	GGCC	2	8	2573	2580	0 %	0 %	50 %	50 %	471265478
9	NC_020816	TCGG	2	8	2983	2990	0 %	25 %	50 %	25 %	471265479
10	NC_020816	CCAG	2	8	3134	3141	25 %	0 %	25 %	50 %	471265479
11	NC_020816	TCGG	2	8	4183	4190	0 %	25 %	50 %	25 %	471265479
12	NC_020816	CGCT	2	8	4354	4361	0 %	25 %	25 %	50 %	471265479
13	NC_020816	GTCG	2	8	5013	5020	0 %	25 %	50 %	25 %	471265479
14	NC_020816	CGCC	2	8	5243	5250	0 %	0 %	25 %	75 %	471265480
15	NC_020816	CCCG	2	8	5630	5637	0 %	0 %	25 %	75 %	471265480
16	NC_020816	CGCA	2	8	6197	6204	25 %	0 %	25 %	50 %	471265482
17	NC_020816	CCGT	2	8	7476	7483	0 %	25 %	25 %	50 %	471265482
18	NC_020816	ACCG	2	8	7697	7704	25 %	0 %	25 %	50 %	471265482
19	NC_020816	CGAC	2	8	8976	8983	25 %	0 %	25 %	50 %	471265483
20	NC_020816	GACC	2	8	9193	9200	25 %	0 %	25 %	50 %	471265483
21	NC_020816	GCCC	2	8	9529	9536	0 %	0 %	25 %	75 %	471265483
22	NC_020816	CCGG	2	8	9772	9779	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
23	NC_020816	CAGG	2	8	9824	9831	25 %	0 %	50 %	25 %	471265483
24	NC_020816	CGGC	2	8	9855	9862	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
25	NC_020816	CCTG	2	8	9930	9937	0 %	25 %	25 %	50 %	471265483
26	NC_020816	CTGC	2	8	10276	10283	0 %	25 %	25 %	50 %	471265483
27	NC_020816	CCGC	2	8	10642	10649	0 %	0 %	25 %	75 %	471265483
28	NC_020816	TGCC	2	8	11621	11628	0 %	25 %	25 %	50 %	471265484
29	NC_020816	CGGC	2	8	11777	11784	0 %	0 %	50 %	50 %	471265484
30	NC_020816	GTCC	2	8	12435	12442	0 %	25 %	25 %	50 %	471265485
31	NC_020816	GCCG	2	8	13734	13741	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
32	NC_020816	TCGT	2	8	14248	14255	0 %	50 %	25 %	25 %	471265485
33	NC_020816	TCGT	2	8	14470	14477	0 %	50 %	25 %	25 %	471265485
34	NC_020816	GGCT	2	8	15261	15268	0 %	25 %	50 %	25 %	471265486
35	NC_020816	GAAA	2	8	15385	15392	75 %	0 %	25 %	0 %	471265486
36	NC_020816	GAAA	2	8	15616	15623	75 %	0 %	25 %	0 %	471265487
37	NC_020816	TCTT	2	8	15649	15656	0 %	75 %	0 %	25 %	471265487
38	NC_020816	CCAC	2	8	16156	16163	25 %	0 %	0 %	75 %	471265488
39	NC_020816	GCTG	2	8	16969	16976	0 %	25 %	50 %	25 %	471265488
40	NC_020816	CCGG	2	8	17353	17360	0 %	0 %	50 %	50 %	471265488
41	NC_020816	GGGC	2	8	18713	18720	0 %	0 %	75 %	25 %	471265492

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.