MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw19

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020816	GCC	2	6	63	68	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020816	CTT	2	6	409	414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020816	GTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020816	TGG	2	6	573	578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020816	GGC	2	6	671	676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020816	CTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265476
7	NC_020816	GCA	2	6	852	857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265476
8	NC_020816	CGC	2	6	940	945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265476
9	NC_020816	CCA	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265476
10	NC_020816	GGC	2	6	1161	1166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265476
11	NC_020816	TGG	2	6	1203	1208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265476
12	NC_020816	GCC	2	6	1255	1260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265476
13	NC_020816	ATG	2	6	1520	1525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265476
14	NC_020816	GGC	3	9	1592	1600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265476
15	NC_020816	GCG	2	6	1637	1642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265476
16	NC_020816	CTT	2	6	1783	1788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265476
17	NC_020816	GCG	2	6	1826	1831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265476
18	NC_020816	TGC	2	6	1890	1895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020816	AGC	2	6	1940	1945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265477
20	NC_020816	CCA	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265477
21	NC_020816	CGC	2	6	2042	2047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265477
22	NC_020816	CCG	2	6	2298	2303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265478
23	NC_020816	CCA	2	6	2332	2337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265478
24	NC_020816	CAC	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265478
25	NC_020816	GGC	2	6	2534	2539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265478
26	NC_020816	GAT	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265478
27	NC_020816	GCC	2	6	2628	2633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265478
28	NC_020816	ACA	2	6	2655	2660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265478
29	NC_020816	CTG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265478
30	NC_020816	CTA	2	6	2824	2829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265478
31	NC_020816	TGC	2	6	2863	2868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020816	TGC	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020816	GTG	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265479
34	NC_020816	CGC	2	6	3101	3106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265479
35	NC_020816	ACG	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265479
36	NC_020816	GGT	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265479
37	NC_020816	TCC	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471265479
38	NC_020816	ATC	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265479
39	NC_020816	CGG	2	6	3365	3370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265479
40	NC_020816	CGG	3	9	3475	3483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265479
41	NC_020816	GCT	2	6	3532	3537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265479
42	NC_020816	GTG	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265479
43	NC_020816	CGC	2	6	3701	3706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265479
44	NC_020816	CAC	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265479
45	NC_020816	GCT	2	6	3818	3823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265479
46	NC_020816	TGC	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265479
47	NC_020816	CTT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265479
48	NC_020816	GAC	2	6	4002	4007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265479
49	NC_020816	GCC	2	6	4012	4017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265479
50	NC_020816	GCG	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265479
51	NC_020816	GCC	2	6	4120	4125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265479
52	NC_020816	CGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265479
53	NC_020816	CGC	2	6	4241	4246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265479
54	NC_020816	GTT	2	6	4248	4253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265479
55	NC_020816	GGC	2	6	4284	4289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265479
56	NC_020816	TGG	2	6	4322	4327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265479
57	NC_020816	GCC	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265479
58	NC_020816	CGC	2	6	4755	4760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265479
59	NC_020816	CGG	2	6	4790	4795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265479
60	NC_020816	CAG	3	9	4989	4997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265479
61	NC_020816	CGT	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265479
62	NC_020816	CCG	2	6	5237	5242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265480
63	NC_020816	AGC	2	6	5330	5335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265480
64	NC_020816	GCC	2	6	5342	5347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265480
65	NC_020816	CGG	3	9	5355	5363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265480
66	NC_020816	CCG	2	6	5492	5497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265480
67	NC_020816	GTG	2	6	5504	5509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265480
68	NC_020816	GAC	2	6	5614	5619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265480
69	NC_020816	CCG	3	9	5718	5726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265480
70	NC_020816	GTG	2	6	5966	5971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020816	AAC	2	6	5983	5988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020816	GCC	2	6	5992	5997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020816	CCG	2	6	6008	6013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265481
74	NC_020816	ACG	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265481
75	NC_020816	CGG	2	6	6062	6067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265481
76	NC_020816	AGC	2	6	6068	6073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265481
77	NC_020816	CCT	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471265481
78	NC_020816	GAC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265481
79	NC_020816	GCT	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265481
80	NC_020816	GCC	2	6	6246	6251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265482
81	NC_020816	GGT	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265482
82	NC_020816	GAT	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265482
83	NC_020816	GCG	2	6	6382	6387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265482
84	NC_020816	ATC	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265482
85	NC_020816	CCG	2	6	6484	6489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265482
86	NC_020816	GTC	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265482
87	NC_020816	TTC	2	6	6564	6569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265482
88	NC_020816	TGG	2	6	6573	6578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265482
89	NC_020816	TCG	3	9	6733	6741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265482
90	NC_020816	GCC	2	6	6769	6774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265482
91	NC_020816	CGG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265482
92	NC_020816	GCG	2	6	6816	6821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265482
93	NC_020816	GTT	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265482
94	NC_020816	CTG	3	9	6915	6923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265482
95	NC_020816	GCC	2	6	6939	6944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265482
96	NC_020816	CGG	3	9	6979	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265482
97	NC_020816	CTG	2	6	7026	7031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265482
98	NC_020816	GAA	2	6	7190	7195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265482
99	NC_020816	CGC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265482
100	NC_020816	ACG	2	6	7251	7256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265482
101	NC_020816	CGG	2	6	7324	7329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265482
102	NC_020816	CTG	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265482
103	NC_020816	GCA	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265482
104	NC_020816	CCG	2	6	7639	7644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265482
105	NC_020816	GGC	3	9	7674	7682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265482
106	NC_020816	GCT	2	6	7715	7720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265482
107	NC_020816	ATC	2	6	7818	7823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265482
108	NC_020816	CGG	2	6	7846	7851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265482
109	NC_020816	GCT	2	6	7862	7867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265482
110	NC_020816	CGC	2	6	7896	7901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265482
111	NC_020816	GCG	2	6	7929	7934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265482
112	NC_020816	TCA	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265483
113	NC_020816	CGC	2	6	8079	8084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265483
114	NC_020816	AGC	2	6	8124	8129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
115	NC_020816	AAG	2	6	8192	8197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265483
116	NC_020816	TCG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
117	NC_020816	CCA	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265483
118	NC_020816	CGA	2	6	8395	8400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
119	NC_020816	CTG	2	6	8420	8425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
120	NC_020816	ACG	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
121	NC_020816	CGA	2	6	8455	8460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
122	NC_020816	GCT	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
123	NC_020816	CGA	2	6	8554	8559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
124	NC_020816	CGG	3	9	8743	8751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
125	NC_020816	GCG	2	6	8779	8784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
126	NC_020816	CGA	2	6	8824	8829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
127	NC_020816	ATC	2	6	8873	8878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265483
128	NC_020816	TAT	2	6	8888	8893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471265483
129	NC_020816	GTT	2	6	8918	8923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265483
130	NC_020816	ATC	2	6	8969	8974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265483
131	NC_020816	GCC	2	6	8984	8989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265483
132	NC_020816	GCG	3	9	9030	9038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
133	NC_020816	TGC	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
134	NC_020816	CTG	2	6	9170	9175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
135	NC_020816	GGC	2	6	9279	9284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
136	NC_020816	CTG	2	6	9311	9316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
137	NC_020816	GCT	2	6	9538	9543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
138	NC_020816	CGA	2	6	9571	9576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
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140	NC_020816	GGC	2	6	9599	9604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
141	NC_020816	CGC	2	6	9691	9696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265483
142	NC_020816	ACG	2	6	9707	9712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
143	NC_020816	CAT	2	6	9796	9801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265483
144	NC_020816	CCG	2	6	9841	9846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265483
145	NC_020816	GCA	2	6	9895	9900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
146	NC_020816	GGC	2	6	9916	9921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
147	NC_020816	TGC	2	6	10032	10037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
148	NC_020816	CGG	2	6	10038	10043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
149	NC_020816	GAT	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265483
150	NC_020816	CGG	2	6	10140	10145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
151	NC_020816	TCG	2	6	10152	10157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
152	NC_020816	ATG	2	6	10284	10289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265483
153	NC_020816	GAT	2	6	10330	10335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265483
154	NC_020816	CGC	2	6	10457	10462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265483
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156	NC_020816	GGC	2	6	10472	10477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
157	NC_020816	CCG	3	9	10479	10487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265483
158	NC_020816	ATC	2	6	10547	10552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265483
159	NC_020816	ACG	2	6	10587	10592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
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161	NC_020816	CGG	3	9	10612	10620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265483
162	NC_020816	TTA	2	6	10630	10635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471265483
163	NC_020816	GAC	2	6	10652	10657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265483
164	NC_020816	CTG	2	6	10679	10684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
165	NC_020816	TGC	2	6	10689	10694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265483
166	NC_020816	TAT	2	6	10751	10756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471265483
167	NC_020816	CCG	2	6	10793	10798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265483
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173	NC_020816	CGG	2	6	11054	11059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_020816	TGA	2	6	11157	11162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_020816	CGA	2	6	11179	11184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_020816	CTT	2	6	11244	11249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265484
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190	NC_020816	TCC	2	6	11892	11897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
191	NC_020816	GCC	2	6	12253	12258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265485
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232	NC_020816	GCA	2	6	15073	15078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_020816	GTA	2	6	15185	15190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_020816	CCG	2	6	16741	16746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265488
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257	NC_020816	CGC	2	6	17063	17068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265488
258	NC_020816	GTG	2	6	17283	17288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265488
259	NC_020816	CAC	2	6	17346	17351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265488
260	NC_020816	GCT	2	6	17363	17368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265488
261	NC_020816	TGA	2	6	17375	17380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265488
262	NC_020816	GCT	2	6	17408	17413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265488
263	NC_020816	TCG	2	6	17437	17442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265488
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269	NC_020816	CGG	2	6	17923	17928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265490
270	NC_020816	GCC	2	6	17991	17996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265490
271	NC_020816	AGC	2	6	18167	18172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265491
272	NC_020816	GCG	2	6	18392	18397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265491
273	NC_020816	ATG	2	6	18676	18681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265492
274	NC_020816	TGA	2	6	18734	18739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265492
275	NC_020816	GGC	2	6	18756	18761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265492
276	NC_020816	GTG	2	6	18808	18813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265492
277	NC_020816	GGC	2	6	18823	18828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.