MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw19

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020816	TC	3	6	1470	1475	0 %	50 %	0 %	50 %	471265476
2	NC_020816	GC	4	8	2253	2260	0 %	0 %	50 %	50 %	471265478
3	NC_020816	GC	3	6	2266	2271	0 %	0 %	50 %	50 %	471265478
4	NC_020816	TG	3	6	3804	3809	0 %	50 %	50 %	0 %	471265479
5	NC_020816	GC	3	6	3840	3845	0 %	0 %	50 %	50 %	471265479
6	NC_020816	CG	3	6	3906	3911	0 %	0 %	50 %	50 %	471265479
7	NC_020816	CG	4	8	4070	4077	0 %	0 %	50 %	50 %	471265479
8	NC_020816	CG	3	6	4303	4308	0 %	0 %	50 %	50 %	471265479
9	NC_020816	TC	3	6	4331	4336	0 %	50 %	0 %	50 %	471265479
10	NC_020816	GC	3	6	4612	4617	0 %	0 %	50 %	50 %	471265479
11	NC_020816	CG	4	8	5400	5407	0 %	0 %	50 %	50 %	471265480
12	NC_020816	AG	3	6	5525	5530	50 %	0 %	50 %	0 %	471265480
13	NC_020816	GC	3	6	5679	5684	0 %	0 %	50 %	50 %	471265480
14	NC_020816	GC	3	6	6232	6237	0 %	0 %	50 %	50 %	471265482
15	NC_020816	CG	3	6	6410	6415	0 %	0 %	50 %	50 %	471265482
16	NC_020816	CG	3	6	6452	6457	0 %	0 %	50 %	50 %	471265482
17	NC_020816	GC	4	8	7976	7983	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
18	NC_020816	TA	3	6	8030	8035	50 %	50 %	0 %	0 %	471265483
19	NC_020816	CG	3	6	8410	8415	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
20	NC_020816	CG	3	6	8478	8483	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
21	NC_020816	GC	3	6	9472	9477	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
22	NC_020816	CG	3	6	9514	9519	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
23	NC_020816	GC	3	6	9522	9527	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
24	NC_020816	AC	3	6	10083	10088	50 %	0 %	0 %	50 %	471265483
25	NC_020816	GC	3	6	10089	10094	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
26	NC_020816	CG	3	6	10099	10104	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
27	NC_020816	TC	3	6	10561	10566	0 %	50 %	0 %	50 %	471265483
28	NC_020816	CG	3	6	10814	10819	0 %	0 %	50 %	50 %	471265483
29	NC_020816	GC	3	6	11296	11301	0 %	0 %	50 %	50 %	471265484
30	NC_020816	CG	3	6	12113	12118	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
31	NC_020816	GC	3	6	12186	12191	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
32	NC_020816	GC	4	8	12509	12516	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
33	NC_020816	CG	3	6	12634	12639	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
34	NC_020816	GC	3	6	12804	12809	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
35	NC_020816	GC	3	6	13021	13026	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
36	NC_020816	GC	3	6	13168	13173	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
37	NC_020816	CG	3	6	13664	13669	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
38	NC_020816	AC	3	6	13997	14002	50 %	0 %	0 %	50 %	471265485
39	NC_020816	GC	3	6	14214	14219	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
40	NC_020816	GC	4	8	14455	14462	0 %	0 %	50 %	50 %	471265485
41	NC_020816	TG	3	6	14621	14626	0 %	50 %	50 %	0 %	471265485
42	NC_020816	AC	3	6	15330	15335	50 %	0 %	0 %	50 %	471265486
43	NC_020816	CG	3	6	15453	15458	0 %	0 %	50 %	50 %	471265486
44	NC_020816	TC	3	6	16817	16822	0 %	50 %	0 %	50 %	471265488
45	NC_020816	CG	3	6	17013	17018	0 %	0 %	50 %	50 %	471265488
46	NC_020816	GC	3	6	17180	17185	0 %	0 %	50 %	50 %	471265488
47	NC_020816	GA	3	6	17686	17691	50 %	0 %	50 %	0 %	471265489
48	NC_020816	GC	3	6	18371	18376	0 %	0 %	50 %	50 %	471265491

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.