MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 15179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020815	CAGC	2	8	15	22	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020815	GATG	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	471265563
3	NC_020815	CCCG	2	8	86	93	0 %	0 %	25 %	75 %	471265563
4	NC_020815	CGGT	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	471265563
5	NC_020815	CGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	50 %	50 %	471265563
6	NC_020815	CGCT	2	8	1167	1174	0 %	25 %	25 %	50 %	471265563
7	NC_020815	AAAC	2	8	1545	1552	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020815	TTTG	2	8	2794	2801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020815	CGGC	2	8	3057	3064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020815	AGCG	2	8	3312	3319	25 %	0 %	50 %	25 %	471265565
11	NC_020815	ACAA	2	8	3628	3635	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020815	CCTG	2	8	3691	3698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020815	ACCG	2	8	3757	3764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020815	CGAT	2	8	3793	3800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020815	GGCT	2	8	4059	4066	0 %	25 %	50 %	25 %	471265567
16	NC_020815	CGGC	2	8	4913	4920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020815	CCGT	2	8	5560	5567	0 %	25 %	25 %	50 %	471265568
18	NC_020815	TCCT	2	8	5629	5636	0 %	50 %	0 %	50 %	471265568
19	NC_020815	CACC	2	8	5886	5893	25 %	0 %	0 %	75 %	471265568
20	NC_020815	CGAA	2	8	6143	6150	50 %	0 %	25 %	25 %	471265568
21	NC_020815	CCGG	2	8	7475	7482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020815	GCCG	2	8	7502	7509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020815	ACCC	2	8	9248	9255	25 %	0 %	0 %	75 %	471265570
24	NC_020815	TGCC	2	8	9422	9429	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020815	GCAA	2	8	9652	9659	50 %	0 %	25 %	25 %	471265571
26	NC_020815	TGGG	2	8	9691	9698	0 %	25 %	75 %	0 %	471265571
27	NC_020815	CGCC	2	8	11191	11198	0 %	0 %	25 %	75 %	471265572
28	NC_020815	GTCG	2	8	11511	11518	0 %	25 %	50 %	25 %	471265572
29	NC_020815	GGCC	2	8	11663	11670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020815	GGTG	2	8	12337	12344	0 %	25 %	75 %	0 %	471265573
31	NC_020815	GAAG	2	8	12707	12714	50 %	0 %	50 %	0 %	471265574
32	NC_020815	GGTG	2	8	13470	13477	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020815	AACC	2	8	14564	14571	50 %	0 %	0 %	50 %	471265577
34	NC_020815	ATGG	2	8	15234	15241	25 %	25 %	50 %	0 %	471265578
35	NC_020815	CTGG	2	8	15378	15385	0 %	25 %	50 %	25 %	471265578
36	NC_020815	GGTG	2	8	15557	15564	0 %	25 %	75 %	0 %	471265578
37	NC_020815	CATC	2	8	15689	15696	25 %	25 %	0 %	50 %	471265578
38	NC_020815	GGTA	2	8	17283	17290	25 %	25 %	50 %	0 %	471265580
39	NC_020815	TCCT	2	8	17896	17903	0 %	50 %	0 %	50 %	471265581
40	NC_020815	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	471265582
41	NC_020815	GCAG	2	8	19772	19779	25 %	0 %	50 %	25 %	471265583
42	NC_020815	GTGC	2	8	19780	19787	0 %	25 %	50 %	25 %	471265583
43	NC_020815	CCTG	2	8	20295	20302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020815	GGTG	2	8	20527	20534	0 %	25 %	75 %	0 %	471265584
45	NC_020815	GACG	2	8	20562	20569	25 %	0 %	50 %	25 %	471265584
46	NC_020815	GCCG	2	8	21563	21570	0 %	0 %	50 %	50 %	471265584
47	NC_020815	TTCC	2	8	21986	21993	0 %	50 %	0 %	50 %	471265585
48	NC_020815	ACCC	2	8	22002	22009	25 %	0 %	0 %	75 %	471265585
49	NC_020815	GCCG	2	8	22070	22077	0 %	0 %	50 %	50 %	471265585
50	NC_020815	GCCG	2	8	22260	22267	0 %	0 %	50 %	50 %	471265585
51	NC_020815	ACGC	2	8	23258	23265	25 %	0 %	25 %	50 %	471265587
52	NC_020815	GCCG	2	8	23405	23412	0 %	0 %	50 %	50 %	471265587
53	NC_020815	GCAT	2	8	23465	23472	25 %	25 %	25 %	25 %	471265587
54	NC_020815	GCAG	2	8	23639	23646	25 %	0 %	50 %	25 %	471265587
55	NC_020815	GCCG	2	8	23854	23861	0 %	0 %	50 %	50 %	471265587
56	NC_020815	TGCC	2	8	24341	24348	0 %	25 %	25 %	50 %	471265588
57	NC_020815	ATCG	2	8	25314	25321	25 %	25 %	25 %	25 %	471265588
58	NC_020815	CACG	2	8	25538	25545	25 %	0 %	25 %	50 %	471265588
59	NC_020815	GGCC	2	8	25703	25710	0 %	0 %	50 %	50 %	471265588
60	NC_020815	CAGC	2	8	25895	25902	25 %	0 %	25 %	50 %	471265589
61	NC_020815	GCCC	2	8	25963	25970	0 %	0 %	25 %	75 %	471265589
62	NC_020815	GCGA	2	8	26530	26537	25 %	0 %	50 %	25 %	471265589
63	NC_020815	GCGT	2	8	26672	26679	0 %	25 %	50 %	25 %	471265589
64	NC_020815	GCCA	2	8	27108	27115	25 %	0 %	25 %	50 %	471265589
65	NC_020815	GAGC	2	8	27139	27146	25 %	0 %	50 %	25 %	471265589
66	NC_020815	CAGG	2	8	27200	27207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020815	GTGC	2	8	27958	27965	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020815	CCGA	2	8	28196	28203	25 %	0 %	25 %	50 %	471265591
69	NC_020815	CGCA	2	8	28747	28754	25 %	0 %	25 %	50 %	471265591
70	NC_020815	GGTC	2	8	29010	29017	0 %	25 %	50 %	25 %	471265591
71	NC_020815	GCCG	2	8	29836	29843	0 %	0 %	50 %	50 %	471265591
72	NC_020815	TGCG	2	8	30906	30913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020815	TCGT	2	8	31442	31449	0 %	50 %	25 %	25 %	471265593
74	NC_020815	TCAT	2	8	31586	31593	25 %	50 %	0 %	25 %	471265593
75	NC_020815	ACAG	2	8	32068	32075	50 %	0 %	25 %	25 %	471265593
76	NC_020815	TCAT	2	8	33272	33279	25 %	50 %	0 %	25 %	471265594
77	NC_020815	TGCG	2	8	33792	33799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020815	CACT	2	8	34324	34331	25 %	25 %	0 %	50 %	471265595
79	NC_020815	TTGA	2	8	34830	34837	25 %	50 %	25 %	0 %	471265596
80	NC_020815	ATTT	2	8	35058	35065	25 %	75 %	0 %	0 %	471265596
81	NC_020815	TTGA	2	8	35349	35356	25 %	50 %	25 %	0 %	471265596
82	NC_020815	CCGG	2	8	35428	35435	0 %	0 %	50 %	50 %	471265596
83	NC_020815	GATT	2	8	35453	35460	25 %	50 %	25 %	0 %	471265596
84	NC_020815	GTCA	2	8	36887	36894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020815	ACCA	2	8	37041	37048	50 %	0 %	0 %	50 %	471265599
86	NC_020815	GATG	2	8	37363	37370	25 %	25 %	50 %	0 %	471265599
87	NC_020815	CCAG	2	8	37630	37637	25 %	0 %	25 %	50 %	471265600
88	NC_020815	AACA	2	8	38495	38502	75 %	0 %	0 %	25 %	471265601
89	NC_020815	GGTG	2	8	38601	38608	0 %	25 %	75 %	0 %	471265601
90	NC_020815	CCGG	2	8	38635	38642	0 %	0 %	50 %	50 %	471265601
91	NC_020815	TCGA	2	8	38927	38934	25 %	25 %	25 %	25 %	471265601
92	NC_020815	CACC	2	8	38988	38995	25 %	0 %	0 %	75 %	471265601
93	NC_020815	GATA	2	8	39246	39253	50 %	25 %	25 %	0 %	471265601
94	NC_020815	CGGA	2	8	39279	39286	25 %	0 %	50 %	25 %	471265601
95	NC_020815	TGGG	2	8	39824	39831	0 %	25 %	75 %	0 %	471265602
96	NC_020815	CAGT	2	8	40028	40035	25 %	25 %	25 %	25 %	471265602
97	NC_020815	CCAG	2	8	40190	40197	25 %	0 %	25 %	50 %	471265602
98	NC_020815	GGCC	2	8	41527	41534	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
99	NC_020815	GATA	2	8	41697	41704	50 %	25 %	25 %	0 %	471265603
100	NC_020815	GGTT	2	8	43092	43099	0 %	50 %	50 %	0 %	471265603
101	NC_020815	TGGC	2	8	43102	43109	0 %	25 %	50 %	25 %	471265603
102	NC_020815	TGCC	2	8	43111	43118	0 %	25 %	25 %	50 %	471265603
103	NC_020815	GGTG	2	8	43409	43416	0 %	25 %	75 %	0 %	471265603
104	NC_020815	CCGA	2	8	43698	43705	25 %	0 %	25 %	50 %	471265603
105	NC_020815	GACG	2	8	44026	44033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020815	CCGG	2	8	44295	44302	0 %	0 %	50 %	50 %	471265604
107	NC_020815	GATG	2	8	44308	44315	25 %	25 %	50 %	0 %	471265604
108	NC_020815	CATG	2	8	44316	44323	25 %	25 %	25 %	25 %	471265604
109	NC_020815	CCCG	2	8	44970	44977	0 %	0 %	25 %	75 %	471265604
110	NC_020815	CGCA	2	8	45297	45304	25 %	0 %	25 %	50 %	471265604
111	NC_020815	TGGC	2	8	45373	45380	0 %	25 %	50 %	25 %	471265604
112	NC_020815	TGCC	2	8	45659	45666	0 %	25 %	25 %	50 %	471265604
113	NC_020815	CGGC	2	8	46022	46029	0 %	0 %	50 %	50 %	471265605
114	NC_020815	GCTG	2	8	46770	46777	0 %	25 %	50 %	25 %	471265606
115	NC_020815	CTCA	2	8	47168	47175	25 %	25 %	0 %	50 %	471265607
116	NC_020815	GCAA	2	8	47272	47279	50 %	0 %	25 %	25 %	471265607
117	NC_020815	CAAC	2	8	47617	47624	50 %	0 %	0 %	50 %	471265607
118	NC_020815	GCAC	2	8	47720	47727	25 %	0 %	25 %	50 %	471265607
119	NC_020815	CGTG	2	8	48031	48038	0 %	25 %	50 %	25 %	471265607
120	NC_020815	CGCC	2	8	48275	48282	0 %	0 %	25 %	75 %	471265608
121	NC_020815	GCGT	2	8	48920	48927	0 %	25 %	50 %	25 %	471265608
122	NC_020815	GCCG	2	8	48995	49002	0 %	0 %	50 %	50 %	471265608
123	NC_020815	CAAG	2	8	49604	49611	50 %	0 %	25 %	25 %	471265608
124	NC_020815	ACCC	2	8	49891	49898	25 %	0 %	0 %	75 %	471265609
125	NC_020815	CAGC	2	8	50272	50279	25 %	0 %	25 %	50 %	471265609
126	NC_020815	CCCG	2	8	50453	50460	0 %	0 %	25 %	75 %	471265609
127	NC_020815	ATCT	2	8	50655	50662	25 %	50 %	0 %	25 %	471265609
128	NC_020815	CCAC	2	8	50799	50806	25 %	0 %	0 %	75 %	471265609
129	NC_020815	GACC	2	8	51101	51108	25 %	0 %	25 %	50 %	471265609
130	NC_020815	TGCA	2	8	51337	51344	25 %	25 %	25 %	25 %	471265609
131	NC_020815	AGCG	2	8	52119	52126	25 %	0 %	50 %	25 %	471265609
132	NC_020815	GACG	2	8	52236	52243	25 %	0 %	50 %	25 %	471265609
133	NC_020815	CGTG	2	8	52388	52395	0 %	25 %	50 %	25 %	471265609
134	NC_020815	GGTC	2	8	52864	52871	0 %	25 %	50 %	25 %	471265610
135	NC_020815	CGAT	2	8	53307	53314	25 %	25 %	25 %	25 %	471265610
136	NC_020815	AAGG	2	8	53381	53388	50 %	0 %	50 %	0 %	471265610
137	NC_020815	TGCC	2	8	53472	53479	0 %	25 %	25 %	50 %	471265610
138	NC_020815	GCCG	2	8	53719	53726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020815	TGCT	2	8	53968	53975	0 %	50 %	25 %	25 %	471265611
140	NC_020815	GGCC	2	8	54194	54201	0 %	0 %	50 %	50 %	471265611
141	NC_020815	CGTG	2	8	54991	54998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020815	GCTG	2	8	55211	55218	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020815	AGGC	2	8	55230	55237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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