MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 88592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020815	GAT	2	6	27	32	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020815	TCG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265563
3	NC_020815	TCG	2	6	232	237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265563
4	NC_020815	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265563
5	NC_020815	GGC	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265563
6	NC_020815	TGC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265563
7	NC_020815	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265563
8	NC_020815	GCC	2	6	549	554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265563
9	NC_020815	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265563
10	NC_020815	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265563
11	NC_020815	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265563
12	NC_020815	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265563
13	NC_020815	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265563
14	NC_020815	TTC	2	6	681	686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265563
15	NC_020815	TTC	2	6	714	719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265563
16	NC_020815	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265563
17	NC_020815	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265563
18	NC_020815	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265563
19	NC_020815	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265563
20	NC_020815	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265563
21	NC_020815	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265563
22	NC_020815	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265563
23	NC_020815	CTG	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265563
24	NC_020815	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265563
25	NC_020815	TAC	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265563
26	NC_020815	CTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265563
27	NC_020815	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265563
28	NC_020815	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265563
29	NC_020815	TGG	2	6	1558	1563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020815	CAC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_020815	TGG	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265564
32	NC_020815	CGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265564
33	NC_020815	CAG	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265564
34	NC_020815	TGT	2	6	2116	2121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265564
35	NC_020815	TGC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265564
36	NC_020815	ATC	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265564
37	NC_020815	AGG	3	9	2542	2550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265564
38	NC_020815	CGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265564
39	NC_020815	GTG	2	6	2652	2657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265564
40	NC_020815	CAG	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265564
41	NC_020815	GCG	2	6	3015	3020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020815	GCA	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265565
43	NC_020815	GGC	2	6	3712	3717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020815	TCG	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020815	CTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265567
46	NC_020815	CAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265567
47	NC_020815	AAG	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265567
48	NC_020815	GCG	3	9	4028	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265567
49	NC_020815	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265567
50	NC_020815	GGT	2	6	4192	4197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265567
51	NC_020815	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265567
52	NC_020815	AAC	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265567
53	NC_020815	CCT	2	6	4515	4520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471265567
54	NC_020815	CAT	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265567
55	NC_020815	TGC	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265567
56	NC_020815	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265567
57	NC_020815	GCA	2	6	4851	4856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265567
58	NC_020815	CGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
59	NC_020815	TGC	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265568
60	NC_020815	GGT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265568
61	NC_020815	CGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
62	NC_020815	CGA	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
63	NC_020815	GCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
64	NC_020815	GAA	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265568
65	NC_020815	CGG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
66	NC_020815	CGG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
67	NC_020815	CGA	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
68	NC_020815	CGG	2	6	5385	5390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
69	NC_020815	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265568
70	NC_020815	CAG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
71	NC_020815	AGC	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
72	NC_020815	CGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
73	NC_020815	GCG	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
74	NC_020815	CGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
75	NC_020815	GGC	2	6	5707	5712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
76	NC_020815	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265568
77	NC_020815	CAT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265568
78	NC_020815	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265568
79	NC_020815	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
80	NC_020815	GCG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
81	NC_020815	CGA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
82	NC_020815	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
83	NC_020815	TCG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265568
84	NC_020815	GCG	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
85	NC_020815	CGC	2	6	6226	6231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265568
86	NC_020815	TCG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265568
87	NC_020815	TGC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265568
88	NC_020815	CGA	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
89	NC_020815	ACC	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265568
90	NC_020815	CAT	2	6	6525	6530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265568
91	NC_020815	TGA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265568
92	NC_020815	CTG	3	9	6574	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265568
93	NC_020815	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265568
94	NC_020815	GCC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265568
95	NC_020815	GAC	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
96	NC_020815	GCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
97	NC_020815	CGA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
98	NC_020815	TTG	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265568
99	NC_020815	GCC	2	6	6885	6890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265568
100	NC_020815	TGG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265568
101	NC_020815	CCG	2	6	7044	7049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265568
102	NC_020815	TGC	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265568
103	NC_020815	GCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265568
104	NC_020815	CAA	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265568
105	NC_020815	AAG	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265568
106	NC_020815	GCC	2	6	7247	7252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265568
107	NC_020815	AGC	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265568
108	NC_020815	GCC	2	6	7363	7368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265568
109	NC_020815	CGC	2	6	7411	7416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265568
110	NC_020815	GAC	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020815	CAC	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265569
112	NC_020815	GCC	2	6	7582	7587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265569
113	NC_020815	GCT	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265569
114	NC_020815	GGC	2	6	7634	7639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265569
115	NC_020815	CTG	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265569
116	NC_020815	GGC	2	6	7708	7713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265569
117	NC_020815	GCC	2	6	7754	7759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265569
118	NC_020815	GCT	2	6	7786	7791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265569
119	NC_020815	GCT	2	6	7822	7827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265569
120	NC_020815	TAC	2	6	7832	7837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265569
121	NC_020815	CGC	2	6	7844	7849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265569
122	NC_020815	CGC	3	9	7924	7932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265569
123	NC_020815	CTG	2	6	7940	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265569
124	NC_020815	GGC	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265569
125	NC_020815	CCA	2	6	7995	8000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265569
126	NC_020815	TGA	2	6	8010	8015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265569
127	NC_020815	AAG	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265569
128	NC_020815	ATC	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265569
129	NC_020815	CTG	2	6	8087	8092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265569
130	NC_020815	GCC	2	6	8126	8131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265569
131	NC_020815	GCA	2	6	8244	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265569
132	NC_020815	GCG	2	6	8255	8260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265569
133	NC_020815	CAA	2	6	8320	8325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265569
134	NC_020815	GCG	2	6	8405	8410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020815	GTT	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265570
136	NC_020815	CCA	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265570
137	NC_020815	GCC	2	6	8625	8630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265570
138	NC_020815	GGT	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265570
139	NC_020815	GCG	2	6	8643	8648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265570
140	NC_020815	CAG	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265570
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142	NC_020815	GCC	2	6	8779	8784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265570
143	NC_020815	GGC	2	6	8855	8860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265570
144	NC_020815	CGC	2	6	8914	8919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265570
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146	NC_020815	GCC	2	6	9029	9034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265570
147	NC_020815	GGC	2	6	9046	9051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265570
148	NC_020815	CGG	2	6	9070	9075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265570
149	NC_020815	CTG	2	6	9098	9103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265570
150	NC_020815	ATG	2	6	9206	9211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265570
151	NC_020815	GCC	2	6	9212	9217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265570
152	NC_020815	CAG	2	6	9317	9322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265570
153	NC_020815	GAC	2	6	9366	9371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020815	CGG	2	6	9613	9618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_020815	TGT	2	6	9664	9669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265571
156	NC_020815	CGC	2	6	9680	9685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265571
157	NC_020815	GTC	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265571
158	NC_020815	TCC	2	6	9735	9740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471265571
159	NC_020815	GAG	2	6	9777	9782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265571
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162	NC_020815	CAA	2	6	9869	9874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265571
163	NC_020815	GCG	2	6	9930	9935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265571
164	NC_020815	ACG	2	6	9937	9942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265571
165	NC_020815	GGC	2	6	9956	9961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265571
166	NC_020815	GAC	2	6	9993	9998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265571
167	NC_020815	CCG	2	6	10000	10005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265571
168	NC_020815	AAG	2	6	10011	10016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265571
169	NC_020815	GCA	2	6	10022	10027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265571
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182	NC_020815	CAG	2	6	10764	10769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265571
183	NC_020815	AAG	2	6	10806	10811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265571
184	NC_020815	ATC	2	6	10812	10817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265571
185	NC_020815	ATC	2	6	10939	10944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_020815	AAC	2	6	10990	10995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_020815	ATG	2	6	11097	11102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_020815	CAC	2	6	11150	11155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_020815	TGG	2	6	11167	11172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_020815	TCA	2	6	11711	11716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
205	NC_020815	TGC	2	6	11742	11747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265573
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208	NC_020815	TCA	2	6	11922	11927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265573
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215	NC_020815	TCG	2	6	12243	12248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265573
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219	NC_020815	GTC	2	6	12507	12512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
220	NC_020815	AGT	2	6	12558	12563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265574
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224	NC_020815	ACG	2	6	12778	12783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265574
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229	NC_020815	TGG	2	6	13033	13038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265575
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231	NC_020815	ATC	2	6	13059	13064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265575
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240	NC_020815	GCA	2	6	13379	13384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265575
241	NC_020815	CAA	2	6	13530	13535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_020815	GCA	2	6	13575	13580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_020815	ATC	2	6	13621	13626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_020815	GCG	2	6	13774	13779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265576
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256	NC_020815	GCG	2	6	14418	14423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_020815	GAG	2	6	28086	28091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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