MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. SN

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020814	TAAAAT	2	12	2803	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020814	TAAGTT	2	12	50648	50659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020814	TATAAA	3	18	51324	51341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020814	AAAAAT	2	12	68487	68498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020814	AGAAAG	2	12	86453	86464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020814	AGGTAT	2	12	86813	86824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020814	AAGAAA	2	12	88004	88015	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020814	AAAATT	2	12	92100	92111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020814	AAATTT	2	12	120889	120900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020814	TTTATA	2	12	128880	128891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020814	AGCTAA	2	12	129460	129471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020814	CCAATA	2	12	129806	129817	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020814	GATAAA	2	12	151528	151539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020814	TAGTAT	2	12	171340	171351	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020814	TTTAGC	2	12	199373	199384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020814	TTTAGC	2	12	199528	199539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020814	AAATAT	2	12	254635	254646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020814	TAAGCT	2	12	338437	338448	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020814	GAGATA	2	12	338774	338785	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020814	AAGAAA	2	12	347111	347122	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020814	TACCAT	2	12	366207	366218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020814	ATATTT	2	12	385751	385762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020814	GTTTTT	2	12	390993	391004	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020814	ATTGGG	2	12	411149	411160	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020814	CTCTTC	2	12	427226	427237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020814	ATTTAT	2	12	439461	439472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020814	GCAAAA	2	12	519818	519829	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020814	TAAATT	2	12	541165	541176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020814	ATTAAT	2	12	589868	589879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020814	ATATAA	2	12	591501	591512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020814	TTTATA	2	12	620079	620090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020814	AATATT	2	12	626062	626073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020814	CCAAAA	2	12	626216	626227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020814	GTTTAA	2	12	647282	647293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020814	GCTGGT	2	12	672403	672414	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020814	CTTGTT	2	12	672657	672668	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020814	ATAACA	2	12	673126	673137	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020814	AATTTT	2	12	768196	768207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020814	AGCTTG	2	12	775956	775967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020814	ATTTTG	2	12	859138	859149	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020814	GGCTTT	2	12	876201	876212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020814	AATTGG	2	12	886252	886263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020814	AATTTA	2	12	886376	886387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020814	TTTTCT	2	12	928115	928126	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020814	TTTATA	2	12	955656	955667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020814	AACACA	2	12	967910	967921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020814	TGACAA	2	12	1006842	1006853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020814	TATTTT	2	12	1022515	1022526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020814	TATAAA	2	12	1046506	1046517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020814	ATTTTT	2	12	1070269	1070280	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020814	GCTATA	2	12	1095763	1095774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020814	TAAAAA	2	12	1105061	1105072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020814	AAAACT	2	12	1125549	1125560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020814	TTCTTT	2	12	1205468	1205479	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020814	GTTTAA	2	12	1224888	1224899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020814	GCTTTG	2	12	1225141	1225152	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020814	TAAATA	2	12	1226989	1227000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020814	AGCTTG	2	12	1244211	1244222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020814	TGAAAA	2	12	1304776	1304787	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020814	GTTTAT	2	12	1305266	1305277	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020814	TGGTGA	2	12	1371256	1371267	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020814	TAAAAA	2	12	1371575	1371586	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020814	AATTGG	2	12	1459828	1459839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020814	TCTATG	2	12	1475699	1475710	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020814	TCTCTT	2	12	1476217	1476228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020814	TAATAC	2	12	1476376	1476387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020814	TTATGT	2	12	1492591	1492602	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020814	TCTTTT	2	12	1520227	1520238	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.