MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. SN

Total Repeats: 324

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020814	ATTA	2	8	10818	10825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020814	CAAA	2	8	10888	10895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020814	ATTT	2	8	11522	11529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020814	TGTT	2	8	11630	11637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020814	TTTA	2	8	20009	20016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020814	ATTT	2	8	20043	20050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020814	TTTA	2	8	30600	30607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020814	AAAT	2	8	39982	39989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020814	CAAA	2	8	50495	50502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020814	AAAC	2	8	57761	57768	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020814	TGGT	2	8	57870	57877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020814	GACG	2	8	58004	58011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020814	AGCC	2	8	63852	63859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020814	ATCT	2	8	68514	68521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020814	CTCC	3	12	75643	75654	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_020814	AACT	2	8	78355	78362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020814	AAGA	2	8	87373	87380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020814	ACTA	2	8	87773	87780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020814	AAAG	2	8	92276	92283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020814	TAAG	2	8	92320	92327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020814	CTTT	2	8	92570	92577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020814	TGCT	2	8	92622	92629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020814	GTAT	2	8	111751	111758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020814	TAAG	2	8	112072	112079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020814	CTTT	2	8	115728	115735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020814	AAGA	2	8	115742	115749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020814	GATA	2	8	118157	118164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020814	GAAA	2	8	125413	125420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020814	ATAA	2	8	128205	128212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020814	TTAT	2	8	128628	128635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020814	GACA	2	8	128639	128646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020814	TTAT	2	8	128744	128751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020814	CATT	2	8	129685	129692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020814	TTGG	2	8	130351	130358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020814	CTCC	2	8	130531	130538	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_020814	AAAT	2	8	174780	174787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020814	GTTT	2	8	180622	180629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020814	TTTA	2	8	180668	180675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020814	TATT	2	8	184171	184178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020814	ATTA	2	8	197527	197534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020814	AAAT	2	8	197765	197772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020814	ACTA	2	8	198878	198885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020814	CTAT	2	8	199364	199371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020814	GCTT	2	8	233605	233612	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020814	CGTT	2	8	256540	256547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020814	AAAC	2	8	262770	262777	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020814	TAGT	2	8	262827	262834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020814	TAAC	2	8	273894	273901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020814	CTTA	2	8	278458	278465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020814	AAGC	2	8	278511	278518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020814	GATT	2	8	278607	278614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020814	TAAA	2	8	288939	288946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020814	AAAC	2	8	295074	295081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020814	CAAG	2	8	336011	336018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020814	CTTT	2	8	336222	336229	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020814	TAAA	2	8	336351	336358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020814	TTTG	2	8	336396	336403	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020814	ATTT	2	8	338876	338883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020814	GAAA	2	8	339704	339711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020814	AAAC	2	8	340329	340336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020814	TAAA	2	8	340416	340423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020814	TTTG	2	8	340618	340625	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020814	ACGC	2	8	340710	340717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020814	AGTT	2	8	343672	343679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020814	ACAT	2	8	346369	346376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020814	AATT	2	8	346730	346737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020814	GTAA	2	8	347451	347458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020814	ACAA	2	8	363807	363814	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020814	TTTA	2	8	364017	364024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020814	TTTA	2	8	364181	364188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020814	TTCA	2	8	364363	364370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020814	TAAA	2	8	364745	364752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020814	TCTA	2	8	364843	364850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020814	TAAA	2	8	380530	380537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020814	CTAA	2	8	382312	382319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020814	AAGG	2	8	384279	384286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020814	AACT	2	8	385818	385825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020814	ATTT	2	8	386228	386235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020814	TCTT	2	8	389851	389858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020814	ATAA	2	8	389916	389923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020814	GTAT	2	8	390230	390237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020814	TATT	2	8	390305	390312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020814	TAGA	2	8	390485	390492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020814	CTTT	2	8	390842	390849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020814	TAAT	2	8	390915	390922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020814	GTTT	2	8	391481	391488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020814	ATTT	2	8	394204	394211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020814	GTAT	2	8	394219	394226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020814	GGTT	2	8	394363	394370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020814	TTAA	2	8	410860	410867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020814	ACCT	2	8	410875	410882	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020814	TTTG	2	8	411723	411730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020814	ATCT	2	8	412396	412403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020814	TAAT	2	8	415148	415155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020814	AAAG	2	8	416431	416438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020814	GAGC	2	8	418574	418581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020814	CGCT	2	8	418640	418647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020814	CTTT	2	8	426774	426781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020814	AACA	2	8	426796	426803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020814	TATC	2	8	426870	426877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020814	CATA	2	8	426931	426938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020814	CTTC	2	8	427389	427396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020814	GGTG	2	8	444619	444626	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020814	TTTA	2	8	455774	455781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020814	TATC	2	8	460352	460359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020814	TATC	2	8	460369	460376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020814	ATAC	2	8	481450	481457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020814	TTCT	2	8	481462	481469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020814	GAAA	2	8	481479	481486	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020814	CAAA	2	8	492661	492668	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020814	TATT	2	8	500551	500558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020814	GTAG	2	8	507090	507097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020814	CATA	2	8	507188	507195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020814	CCCA	2	8	513757	513764	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_020814	GTAG	2	8	513825	513832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020814	AATA	2	8	524294	524301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020814	TAAA	2	8	524341	524348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020814	TTAA	2	8	536279	536286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020814	AAGA	2	8	541154	541161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020814	TCCA	2	8	543612	543619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020814	TTAT	2	8	548318	548325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020814	TGTC	2	8	588837	588844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020814	ATAA	2	8	589759	589766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020814	AAAT	2	8	589974	589981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020814	TTAT	2	8	589983	589990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020814	GAAA	2	8	590304	590311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020814	TAAA	2	8	590447	590454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020814	GTAT	2	8	590929	590936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020814	AATT	2	8	591199	591206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020814	ATAA	2	8	591437	591444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020814	AAAT	2	8	592348	592355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020814	GACT	2	8	598952	598959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020814	TATT	2	8	620041	620048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020814	TTAC	2	8	626195	626202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020814	TTTA	2	8	634185	634192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020814	CTAT	2	8	647000	647007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020814	CATA	2	8	647433	647440	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020814	ATCT	2	8	647649	647656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020814	TTTA	2	8	654100	654107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020814	CTAT	2	8	672538	672545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020814	CTTT	2	8	673294	673301	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020814	TTTG	2	8	674022	674029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020814	AAAG	2	8	699121	699128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020814	AAAT	2	8	701420	701427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020814	TTTA	2	8	709933	709940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020814	CTAA	2	8	713290	713297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020814	TTAT	2	8	727714	727721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020814	GTAA	2	8	752680	752687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020814	TTTA	2	8	752733	752740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020814	TTTA	2	8	752771	752778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020814	TAAA	2	8	772276	772283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020814	TGTC	2	8	773001	773008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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296	NC_020814	TTTG	2	8	1398724	1398731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
297	NC_020814	TGTC	2	8	1405671	1405678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
298	NC_020814	AGTA	2	8	1405972	1405979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
299	NC_020814	ATTT	2	8	1410371	1410378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_020814	ATAA	2	8	1425444	1425451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_020814	ATGT	2	8	1429980	1429987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
302	NC_020814	CCCT	2	8	1432518	1432525	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
303	NC_020814	ATTT	2	8	1438468	1438475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_020814	CTTG	2	8	1439195	1439202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
305	NC_020814	TGTT	2	8	1459688	1459695	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
306	NC_020814	AGAT	2	8	1460929	1460936	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
307	NC_020814	AGGA	2	8	1460998	1461005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
308	NC_020814	GCAA	2	8	1461204	1461211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
309	NC_020814	CTTA	2	8	1462280	1462287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
310	NC_020814	TTTA	2	8	1462307	1462314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_020814	TACT	2	8	1475412	1475419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
312	NC_020814	CATC	2	8	1475856	1475863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
313	NC_020814	TCTT	2	8	1476112	1476119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
314	NC_020814	AAGT	2	8	1476295	1476302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
315	NC_020814	AATT	2	8	1490774	1490781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_020814	CCAG	2	8	1516301	1516308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
317	NC_020814	TAAT	2	8	1516437	1516444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_020814	AATA	2	8	1519497	1519504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_020814	TCTA	2	8	1519870	1519877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
320	NC_020814	CAAA	2	8	1519988	1519995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
321	NC_020814	ATTT	2	8	1520019	1520026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_020814	CTTT	2	8	1520296	1520303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
323	NC_020814	AGCT	2	8	1521106	1521113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
324	NC_020814	TTTG	2	8	1521158	1521165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.