MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. SN

Total Repeats: 17793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020814	TTG	2	6	200	205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263592
2	NC_020814	AAG	2	6	560	565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263592
3	NC_020814	TCT	2	6	571	576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263592
4	NC_020814	TAG	2	6	599	604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263592
5	NC_020814	CAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471263592
6	NC_020814	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263592
7	NC_020814	TAT	2	6	802	807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263592
8	NC_020814	ATA	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263592
9	NC_020814	GAT	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263592
10	NC_020814	ACA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471263592
11	NC_020814	GGT	2	6	1030	1035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263592
12	NC_020814	TGG	2	6	1040	1045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263592
13	NC_020814	ACC	2	6	1150	1155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471263592
14	NC_020814	AAC	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471263592
15	NC_020814	CAA	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471263592
16	NC_020814	TAA	2	6	1377	1382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263592
17	NC_020814	GTT	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263593
18	NC_020814	AAG	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263593
19	NC_020814	CTT	2	6	1977	1982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263593
20	NC_020814	CAT	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263593
21	NC_020814	TAG	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263593
22	NC_020814	TAT	2	6	2110	2115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263593
23	NC_020814	CTT	2	6	2139	2144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263593
24	NC_020814	TAA	2	6	2184	2189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263593
25	NC_020814	TCT	2	6	2249	2254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263593
26	NC_020814	ACC	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471263593
27	NC_020814	CCT	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471263593
28	NC_020814	ATC	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263593
29	NC_020814	CAT	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263594
30	NC_020814	CTC	2	6	2562	2567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471263594
31	NC_020814	TGT	2	6	2570	2575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263594
32	NC_020814	CTT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263594
33	NC_020814	TCT	2	6	2710	2715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263594
34	NC_020814	TTC	2	6	2727	2732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263594
35	NC_020814	TCA	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263595
36	NC_020814	TGG	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263595
37	NC_020814	TGA	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263595
38	NC_020814	CTG	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471263595
39	NC_020814	AGA	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263595
40	NC_020814	CTC	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471263595
41	NC_020814	GCA	2	6	3691	3696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471263595
42	NC_020814	ATT	3	9	3800	3808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263595
43	NC_020814	GAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263595
44	NC_020814	TGG	2	6	4002	4007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263595
45	NC_020814	GAA	2	6	4202	4207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263595
46	NC_020814	TGA	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263595
47	NC_020814	GAA	2	6	4341	4346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263596
48	NC_020814	TGC	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471263596
49	NC_020814	ACA	2	6	4570	4575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471263596
50	NC_020814	ACA	2	6	4582	4587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471263596
51	NC_020814	AGA	2	6	4703	4708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263596
52	NC_020814	ATA	2	6	4731	4736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263596
53	NC_020814	CTA	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263596
54	NC_020814	TCT	2	6	4779	4784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263596
55	NC_020814	GAA	2	6	4896	4901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263596
56	NC_020814	ATA	2	6	4945	4950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263596
57	NC_020814	CAT	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263596
58	NC_020814	AAT	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263596
59	NC_020814	TAT	2	6	5348	5353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263596
60	NC_020814	CTA	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263596
61	NC_020814	AAG	2	6	5691	5696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263597
62	NC_020814	AGA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263597
63	NC_020814	GTT	2	6	5861	5866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263597
64	NC_020814	CTT	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263597
65	NC_020814	ATG	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263597
66	NC_020814	TGT	2	6	5943	5948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263597
67	NC_020814	AGA	2	6	5955	5960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263597
68	NC_020814	CTT	2	6	5975	5980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263597
69	NC_020814	GAA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263597
70	NC_020814	GGT	3	9	6078	6086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263597
71	NC_020814	AGA	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263597
72	NC_020814	GTT	2	6	6363	6368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263598
73	NC_020814	ATC	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263598
74	NC_020814	GCT	2	6	6604	6609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471263598
75	NC_020814	AAG	2	6	6651	6656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263598
76	NC_020814	CCT	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471263598
77	NC_020814	TCT	2	6	6807	6812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263598
78	NC_020814	CTA	2	6	7030	7035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263598
79	NC_020814	TAG	2	6	7041	7046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263598
80	NC_020814	CTT	3	9	7090	7098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263598
81	NC_020814	GGT	2	6	7193	7198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263598
82	NC_020814	GTT	3	9	7246	7254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263598
83	NC_020814	CCA	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471263598
84	NC_020814	TTG	2	6	7498	7503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263598
85	NC_020814	AAC	2	6	7553	7558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471263598
86	NC_020814	ATT	2	6	7574	7579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263599
87	NC_020814	TAG	2	6	7683	7688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263599
88	NC_020814	GGT	2	6	7801	7806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263599
89	NC_020814	CTT	2	6	8135	8140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263599
90	NC_020814	CTA	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263599
91	NC_020814	GGT	4	12	8563	8574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263599
92	NC_020814	TGT	2	6	8764	8769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263600
93	NC_020814	TAT	2	6	8783	8788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263600
94	NC_020814	GTT	2	6	9264	9269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263600
95	NC_020814	CTA	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263600
96	NC_020814	GAT	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263601
97	NC_020814	GAA	2	6	9655	9660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263601
98	NC_020814	TGG	2	6	9685	9690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263601
99	NC_020814	CTA	2	6	9772	9777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263601
100	NC_020814	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263601
101	NC_020814	TCT	2	6	9981	9986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263601
102	NC_020814	GGT	2	6	10001	10006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263601
103	NC_020814	CTA	2	6	10057	10062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263601
104	NC_020814	CTA	2	6	10228	10233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263601
105	NC_020814	GCG	2	6	10296	10301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471263601
106	NC_020814	GCC	2	6	10520	10525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471263601
107	NC_020814	TAT	2	6	10975	10980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263602
108	NC_020814	TGC	2	6	11068	11073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471263602
109	NC_020814	CTA	2	6	11121	11126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263602
110	NC_020814	GAA	2	6	11713	11718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263603
111	NC_020814	AGA	2	6	11721	11726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263603
112	NC_020814	CTT	2	6	11794	11799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263603
113	NC_020814	GAA	2	6	11821	11826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263603
114	NC_020814	GAC	2	6	11839	11844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471263603
115	NC_020814	ATG	2	6	12055	12060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263603
116	NC_020814	ATC	2	6	12170	12175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263603
117	NC_020814	TAT	2	6	12384	12389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263604
118	NC_020814	ATC	2	6	12470	12475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263604
119	NC_020814	TTA	2	6	12510	12515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263604
120	NC_020814	ACC	2	6	12578	12583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471263604
121	NC_020814	ATA	2	6	12584	12589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263604
122	NC_020814	ATG	2	6	12620	12625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263604
123	NC_020814	TAG	2	6	12645	12650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263604
124	NC_020814	TGG	2	6	13059	13064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263604
125	NC_020814	GAA	2	6	13121	13126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263604
126	NC_020814	GCT	2	6	13136	13141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471263604
127	NC_020814	ACG	2	6	13194	13199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471263604
128	NC_020814	TAA	2	6	13347	13352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263604
129	NC_020814	ATA	2	6	13436	13441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263604
130	NC_020814	CTT	2	6	13592	13597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263604
131	NC_020814	ACA	2	6	13818	13823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471263604
132	NC_020814	TCT	2	6	13977	13982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263604
133	NC_020814	TTA	2	6	13987	13992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263604
134	NC_020814	CAT	2	6	14041	14046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263604
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136	NC_020814	TTA	2	6	14221	14226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263605
137	NC_020814	TTG	2	6	14242	14247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263605
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151	NC_020814	ATT	2	6	15051	15056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263605
152	NC_020814	TCT	2	6	15057	15062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263605
153	NC_020814	AAT	2	6	15063	15068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263605
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159	NC_020814	GTT	2	6	15324	15329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263605
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162	NC_020814	AAT	2	6	15630	15635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471263605
163	NC_020814	CTT	2	6	15700	15705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263605
164	NC_020814	TAT	2	6	15755	15760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263605
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247	NC_020814	TCT	2	6	23103	23108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263614
248	NC_020814	CTT	2	6	23188	23193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263614
249	NC_020814	TCT	2	6	23296	23301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263614
250	NC_020814	CTT	2	6	23331	23336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263615
251	NC_020814	TTC	2	6	23400	23405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263615
252	NC_020814	TCT	2	6	23512	23517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263615
253	NC_020814	TCT	2	6	23571	23576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263615
254	NC_020814	CTA	3	9	23609	23617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263615
255	NC_020814	ACC	2	6	23673	23678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471263615
256	NC_020814	CTT	2	6	23717	23722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263615
257	NC_020814	AAG	2	6	23979	23984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263615
258	NC_020814	GTT	2	6	24045	24050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263615
259	NC_020814	TCA	2	6	24061	24066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263615
260	NC_020814	TCT	3	9	24151	24159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263615
261	NC_020814	CAT	2	6	24300	24305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471263615
262	NC_020814	TTC	2	6	24339	24344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263615
263	NC_020814	AGA	3	9	24351	24359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263615
264	NC_020814	TTC	2	6	24363	24368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263615
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271	NC_020814	GAA	2	6	24975	24980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263617
272	NC_020814	ACA	2	6	25001	25006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471263617
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277	NC_020814	AGA	2	6	25202	25207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263617
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280	NC_020814	CCA	2	6	25470	25475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471263617
281	NC_020814	TGG	2	6	25532	25537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471263617
282	NC_020814	GAT	2	6	25602	25607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471263617
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284	NC_020814	ACC	2	6	25703	25708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471263617
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289	NC_020814	AGA	3	9	26067	26075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471263618
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374	NC_020814	TGT	2	6	33845	33850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471263627
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376	NC_020814	TAT	2	6	34210	34215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471263628
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380	NC_020814	TCT	2	6	34608	34613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471263629
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