MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Micavibrio aeruginosavorus EPB

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020812	ACCCAA	2	12	24972	24983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020812	TCCCTC	2	12	35255	35266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020812	TCGCTT	2	12	35363	35374	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020812	TGGGGT	2	12	55718	55729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020812	TCCGCC	2	12	72965	72976	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_020812	TTGCTG	2	12	119827	119838	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020812	TAGGGG	2	12	156936	156947	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020812	GATCAT	2	12	171106	171117	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020812	GTTTTT	2	12	178678	178689	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020812	TGGGGG	2	12	194341	194352	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020812	ATTCAA	2	12	197462	197473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020812	GTTGGG	2	12	199230	199241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020812	AAACAG	2	12	214392	214403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020812	CCGCGC	2	12	217536	217547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020812	TGTGGG	2	12	217565	217576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020812	AGGGTG	2	12	253070	253081	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020812	GAAAAA	2	12	258368	258379	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020812	CCGGAC	2	12	288681	288692	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020812	TCTGTT	2	12	292393	292404	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020812	CCCTGT	2	12	346528	346539	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020812	ATCCCC	2	12	363860	363871	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020812	AAAAGA	2	12	363898	363909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020812	GCATGT	2	12	366018	366029	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020812	TGCCCG	2	12	403375	403386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020812	AATGCA	2	12	415786	415797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020812	CTTATA	2	12	415861	415872	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020812	CTTTTT	2	12	430191	430202	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020812	TGCCGT	2	12	440624	440635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020812	GGGAGT	2	12	459883	459894	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020812	AATCAC	2	12	471024	471035	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020812	AAGAAT	2	12	560656	560667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020812	GCCCTT	2	12	584352	584363	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020812	GTTTTG	2	12	609034	609045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020812	TTTTGT	2	12	621860	621871	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020812	GTTTTT	2	12	644607	644618	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020812	TATTAA	3	18	679388	679405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020812	GGCCCG	2	12	780468	780479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020812	GGGCGA	2	12	795359	795370	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020812	CCTTAC	2	12	796684	796695	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020812	GGGGCC	2	12	817759	817770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020812	ATAGGG	2	12	849119	849130	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020812	TTTGTT	2	12	875956	875967	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020812	TTGAGA	2	12	898551	898562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020812	GTTTCT	2	12	904848	904859	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020812	GCTCTC	2	12	953484	953495	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020812	GACAAG	2	12	976681	976692	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020812	CAAAAG	2	12	999379	999390	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020812	TAGTGA	2	12	1034702	1034713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020812	AGATTT	2	12	1057305	1057316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020812	GTGCAG	2	12	1058398	1058409	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020812	GAAAAG	2	12	1139384	1139395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020812	AAGAGA	2	12	1157069	1157080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020812	AACAAA	2	12	1278012	1278023	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020812	AATCCC	2	12	1307812	1307823	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020812	AGGCTG	2	12	1413563	1413574	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020812	TCTTGC	2	12	1413762	1413773	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020812	CCGAAA	2	12	1437111	1437122	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020812	ATATAA	2	12	1462610	1462621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020812	CCCCAC	2	12	1518495	1518506	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
60	NC_020812	TATCCA	2	12	1552037	1552048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020812	TGACGT	2	12	1586726	1586737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020812	TGGCTT	2	12	1620965	1620976	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020812	TAAAAA	2	12	1637652	1637663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020812	CGGACC	2	12	1637972	1637983	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020812	AGAGGG	2	12	1648144	1648155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020812	TTATTC	2	12	1671904	1671915	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020812	AACACA	2	12	1731612	1731623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020812	TGCAAA	2	12	1745151	1745162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020812	AAAAAT	2	12	1771098	1771109	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020812	GAACCC	2	12	1825696	1825707	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020812	AGCAGG	2	12	1903659	1903670	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020812	TCAAAT	2	12	1933682	1933693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020812	CTTGAG	2	12	1953295	1953306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020812	CAAAAA	2	12	2083732	2083743	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020812	CCATAA	2	12	2126943	2126954	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020812	CTTGTC	2	12	2135934	2135945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020812	CCTTTG	2	12	2152358	2152369	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020812	CCGTCA	2	12	2176827	2176838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020812	TGAAAA	2	12	2183207	2183218	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020812	CAGCGA	2	12	2210495	2210506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020812	CATGCG	2	12	2213807	2213818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020812	GATCCA	2	12	2223315	2223326	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020812	GGGCTG	2	12	2223482	2223493	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020812	TAGAAA	2	12	2267760	2267771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020812	TAAAGT	2	12	2302106	2302117	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020812	AACGCG	2	12	2316962	2316973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020812	ACACCC	2	12	2324216	2324227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_020812	CCTATC	2	12	2369501	2369512	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020812	CAATAA	2	12	2438101	2438112	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020812	CCTGAC	2	12	2457904	2457915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.