MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC33

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020801	CCAAG	2	10	515	524	40 %	0 %	20 %	40 %	470474283
2	NC_020801	TGCGG	2	10	5466	5475	0 %	20 %	60 %	20 %	470474287
3	NC_020801	CGATC	2	10	5933	5942	20 %	20 %	20 %	40 %	470474288
4	NC_020801	TGGGC	2	10	5989	5998	0 %	20 %	60 %	20 %	470474288
5	NC_020801	GGCCG	2	10	9190	9199	0 %	0 %	60 %	40 %	470474289
6	NC_020801	GGAGG	2	10	9726	9735	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020801	CGGCC	2	10	10413	10422	0 %	0 %	40 %	60 %	470474291
8	NC_020801	GGGCT	2	10	10634	10643	0 %	20 %	60 %	20 %	470474291
9	NC_020801	GCGCC	2	10	11089	11098	0 %	0 %	40 %	60 %	470474292
10	NC_020801	GCCTG	3	15	11105	11119	0 %	20 %	40 %	40 %	470474292
11	NC_020801	GTAGC	2	10	13804	13813	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020801	GCGCA	2	10	15702	15711	20 %	0 %	40 %	40 %	470474296
13	NC_020801	CTGAC	2	10	18891	18900	20 %	20 %	20 %	40 %	470474303
14	NC_020801	ACCCG	2	10	19249	19258	20 %	0 %	20 %	60 %	470474303
15	NC_020801	GCCGG	2	10	20818	20827	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020801	CAGGG	2	10	23300	23309	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020801	CGATC	2	10	25315	25324	20 %	20 %	20 %	40 %	470474312
18	NC_020801	TGGGC	2	10	25371	25380	0 %	20 %	60 %	20 %	470474312
19	NC_020801	GCCAA	2	10	30586	30595	40 %	0 %	20 %	40 %	470474318

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.