MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC33

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020801	GGCG	2	8	259	266	0 %	0 %	75 %	25 %	470474283
2	NC_020801	GAGC	2	8	1260	1267	25 %	0 %	50 %	25 %	470474284
3	NC_020801	TCAG	2	8	1939	1946	25 %	25 %	25 %	25 %	470474284
4	NC_020801	AGCG	2	8	2230	2237	25 %	0 %	50 %	25 %	470474284
5	NC_020801	GGGC	2	8	2607	2614	0 %	0 %	75 %	25 %	470474284
6	NC_020801	CACG	2	8	3023	3030	25 %	0 %	25 %	50 %	470474284
7	NC_020801	CCAG	2	8	3278	3285	25 %	0 %	25 %	50 %	470474284
8	NC_020801	CGGA	2	8	4345	4352	25 %	0 %	50 %	25 %	470474286
9	NC_020801	CTCA	2	8	4817	4824	25 %	25 %	0 %	50 %	470474287
10	NC_020801	GTCG	2	8	5102	5109	0 %	25 %	50 %	25 %	470474287
11	NC_020801	ACAA	2	8	5191	5198	75 %	0 %	0 %	25 %	470474287
12	NC_020801	TCGA	2	8	5325	5332	25 %	25 %	25 %	25 %	470474287
13	NC_020801	ATGC	2	8	6030	6037	25 %	25 %	25 %	25 %	470474288
14	NC_020801	TGGG	2	8	6250	6257	0 %	25 %	75 %	0 %	470474288
15	NC_020801	AGGC	2	8	6413	6420	25 %	0 %	50 %	25 %	470474288
16	NC_020801	TGGC	2	8	6620	6627	0 %	25 %	50 %	25 %	470474288
17	NC_020801	TGGC	2	8	6824	6831	0 %	25 %	50 %	25 %	470474288
18	NC_020801	TGGC	2	8	6935	6942	0 %	25 %	50 %	25 %	470474288
19	NC_020801	TGGC	2	8	7643	7650	0 %	25 %	50 %	25 %	470474288
20	NC_020801	TGGC	2	8	7847	7854	0 %	25 %	50 %	25 %	470474288
21	NC_020801	CGAA	2	8	8326	8333	50 %	0 %	25 %	25 %	470474288
22	NC_020801	GCGT	2	8	8376	8383	0 %	25 %	50 %	25 %	470474288
23	NC_020801	CGGC	2	8	8397	8404	0 %	0 %	50 %	50 %	470474288
24	NC_020801	GGGC	2	8	10705	10712	0 %	0 %	75 %	25 %	470474291
25	NC_020801	CGGC	2	8	11712	11719	0 %	0 %	50 %	50 %	470474292
26	NC_020801	GGGC	2	8	12505	12512	0 %	0 %	75 %	25 %	470474293
27	NC_020801	GCGT	2	8	12558	12565	0 %	25 %	50 %	25 %	470474293
28	NC_020801	TCGA	2	8	12784	12791	25 %	25 %	25 %	25 %	470474293
29	NC_020801	CGGC	3	12	13112	13123	0 %	0 %	50 %	50 %	470474293
30	NC_020801	CGGC	2	8	13173	13180	0 %	0 %	50 %	50 %	470474293
31	NC_020801	CGGT	2	8	13190	13197	0 %	25 %	50 %	25 %	470474293
32	NC_020801	CGCA	2	8	14249	14256	25 %	0 %	25 %	50 %	470474294
33	NC_020801	CTGG	2	8	14503	14510	0 %	25 %	50 %	25 %	470474295
34	NC_020801	CGAA	2	8	15504	15511	50 %	0 %	25 %	25 %	470474296
35	NC_020801	GCAA	2	8	16194	16201	50 %	0 %	25 %	25 %	470474297
36	NC_020801	TTTG	2	8	16333	16340	0 %	75 %	25 %	0 %	470474298
37	NC_020801	AGCC	2	8	17093	17100	25 %	0 %	25 %	50 %	470474299
38	NC_020801	CAGC	2	8	18170	18177	25 %	0 %	25 %	50 %	470474302
39	NC_020801	CGGC	2	8	18203	18210	0 %	0 %	50 %	50 %	470474302
40	NC_020801	GTCG	2	8	18356	18363	0 %	25 %	50 %	25 %	470474302
41	NC_020801	CGAC	2	8	21157	21164	25 %	0 %	25 %	50 %	470474306
42	NC_020801	CCTA	2	8	21470	21477	25 %	25 %	0 %	50 %	470474307
43	NC_020801	GCCA	2	8	21520	21527	25 %	0 %	25 %	50 %	470474307
44	NC_020801	GCAA	2	8	22013	22020	50 %	0 %	25 %	25 %	470474308
45	NC_020801	CGGT	2	8	22118	22125	0 %	25 %	50 %	25 %	470474308
46	NC_020801	TGAC	2	8	22151	22158	25 %	25 %	25 %	25 %	470474308
47	NC_020801	GAAT	2	8	23017	23024	50 %	25 %	25 %	0 %	470474310
48	NC_020801	CAAG	2	8	23168	23175	50 %	0 %	25 %	25 %	470474310
49	NC_020801	GCTG	2	8	23651	23658	0 %	25 %	50 %	25 %	470474311
50	NC_020801	CTCA	2	8	24198	24205	25 %	25 %	0 %	50 %	470474311
51	NC_020801	ATGC	2	8	25412	25419	25 %	25 %	25 %	25 %	470474312
52	NC_020801	TGGG	2	8	25632	25639	0 %	25 %	75 %	0 %	470474312
53	NC_020801	AGGC	2	8	25795	25802	25 %	0 %	50 %	25 %	470474312
54	NC_020801	TGGC	2	8	26002	26009	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
55	NC_020801	TGGC	2	8	26827	26834	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
56	NC_020801	TGGC	2	8	27133	27140	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
57	NC_020801	TGGC	2	8	27337	27344	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
58	NC_020801	CGAA	2	8	27816	27823	50 %	0 %	25 %	25 %	470474312
59	NC_020801	GCGT	2	8	27866	27873	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
60	NC_020801	CGGC	2	8	27887	27894	0 %	0 %	50 %	50 %	470474312
61	NC_020801	TGGC	2	8	28928	28935	0 %	25 %	50 %	25 %	470474314
62	NC_020801	CTTC	2	8	29052	29059	0 %	50 %	0 %	50 %	470474314
63	NC_020801	GGCA	2	8	29273	29280	25 %	0 %	50 %	25 %	470474315
64	NC_020801	GGCG	2	8	30633	30640	0 %	0 %	75 %	25 %	470474318
65	NC_020801	CTCA	2	8	31143	31150	25 %	25 %	0 %	50 %	470474319
66	NC_020801	CGCT	2	8	31171	31178	0 %	25 %	25 %	50 %	470474319

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.