MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC33

Total Repeats: 475

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020801	GCA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474283
2	NC_020801	TTC	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474283
3	NC_020801	CGG	2	6	530	535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474283
4	NC_020801	GTT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470474283
5	NC_020801	TTG	2	6	735	740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470474283
6	NC_020801	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474284
7	NC_020801	TCT	2	6	886	891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474284
8	NC_020801	CGC	2	6	1034	1039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474284
9	NC_020801	GGC	2	6	1073	1078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
10	NC_020801	GCA	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
11	NC_020801	CGG	2	6	1114	1119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
12	NC_020801	TCG	3	9	1123	1131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
13	NC_020801	TGG	2	6	1196	1201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474284
14	NC_020801	ATG	2	6	1228	1233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474284
15	NC_020801	GCA	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
16	NC_020801	CAT	2	6	1283	1288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474284
17	NC_020801	TGC	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
18	NC_020801	CGC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474284
19	NC_020801	CAC	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474284
20	NC_020801	CCA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474284
21	NC_020801	GTC	2	6	1782	1787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
22	NC_020801	TGG	2	6	1907	1912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474284
23	NC_020801	CAG	2	6	1989	1994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
24	NC_020801	GGC	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
25	NC_020801	TCC	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474284
26	NC_020801	CGT	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
27	NC_020801	CGG	2	6	2161	2166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
28	NC_020801	CAG	2	6	2277	2282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
29	NC_020801	TGA	2	6	2318	2323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474284
30	NC_020801	CGG	2	6	2332	2337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
31	NC_020801	CAT	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474284
32	NC_020801	CGA	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
33	NC_020801	GCA	2	6	2537	2542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
34	NC_020801	GGC	2	6	2667	2672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
35	NC_020801	AGC	2	6	2716	2721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
36	NC_020801	GGC	2	6	2748	2753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
37	NC_020801	TCT	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474284
38	NC_020801	GCA	3	9	2825	2833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
39	NC_020801	CGG	2	6	2933	2938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
40	NC_020801	CGG	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
41	NC_020801	GCA	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
42	NC_020801	GCT	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
43	NC_020801	AGT	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474284
44	NC_020801	AGC	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
45	NC_020801	TGC	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
46	NC_020801	CGA	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
47	NC_020801	GCA	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474284
48	NC_020801	CGG	2	6	3524	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474284
49	NC_020801	CTG	2	6	3595	3600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
50	NC_020801	TGG	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474284
51	NC_020801	TCG	2	6	3634	3639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474284
52	NC_020801	GCA	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
53	NC_020801	GCG	2	6	3820	3825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474285
54	NC_020801	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
55	NC_020801	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474285
56	NC_020801	GCA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
57	NC_020801	TGT	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470474285
58	NC_020801	ATC	2	6	3962	3967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474285
59	NC_020801	TCA	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474285
60	NC_020801	TGC	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474285
61	NC_020801	GAT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474285
62	NC_020801	CGA	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
63	NC_020801	GAC	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474285
64	NC_020801	TCA	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474286
65	NC_020801	CCG	2	6	4318	4323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474286
66	NC_020801	GCG	2	6	4330	4335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474286
67	NC_020801	CAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020801	ATT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020801	GGC	2	6	4682	4687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
70	NC_020801	GCG	2	6	4720	4725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
71	NC_020801	CTG	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474287
72	NC_020801	GGC	2	6	4773	4778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
73	NC_020801	TGG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474287
74	NC_020801	GCT	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474287
75	NC_020801	ACC	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474287
76	NC_020801	CGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474287
77	NC_020801	GGC	2	6	5069	5074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
78	NC_020801	CCA	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474287
79	NC_020801	CTG	2	6	5271	5276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474287
80	NC_020801	AAG	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470474287
81	NC_020801	CGG	2	6	5373	5378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474287
82	NC_020801	CTC	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474288
83	NC_020801	ATC	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474288
84	NC_020801	GCC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
85	NC_020801	GCT	2	6	5956	5961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474288
86	NC_020801	GGA	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470474288
87	NC_020801	AAC	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470474288
88	NC_020801	TCA	2	6	6233	6238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474288
89	NC_020801	CCG	2	6	6407	6412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
90	NC_020801	CGA	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474288
91	NC_020801	GGT	2	6	6432	6437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474288
92	NC_020801	CAA	2	6	6483	6488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470474288
93	NC_020801	GCC	3	9	6508	6516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
94	NC_020801	CCA	2	6	6531	6536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
95	NC_020801	GCC	2	6	6610	6615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
96	NC_020801	CCA	2	6	6633	6638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
97	NC_020801	CCA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
98	NC_020801	CCA	2	6	6735	6740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
99	NC_020801	GCC	2	6	6814	6819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
100	NC_020801	CCA	2	6	6837	6842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
101	NC_020801	GCC	2	6	6925	6930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
102	NC_020801	CCA	2	6	6948	6953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
103	NC_020801	GCC	2	6	7027	7032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
104	NC_020801	CCA	2	6	7050	7055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
105	NC_020801	GCC	2	6	7129	7134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
106	NC_020801	CCA	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
107	NC_020801	CCA	2	6	7229	7234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
108	NC_020801	CCA	2	6	7251	7256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
109	NC_020801	GCC	2	6	7330	7335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
110	NC_020801	CCA	2	6	7350	7355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
111	NC_020801	CCA	2	6	7452	7457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
112	NC_020801	CCA	2	6	7532	7537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
113	NC_020801	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
114	NC_020801	GCC	2	6	7633	7638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
115	NC_020801	CCA	2	6	7656	7661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
116	NC_020801	CCA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
117	NC_020801	CCA	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
118	NC_020801	GCC	2	6	7837	7842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
119	NC_020801	CCA	2	6	7860	7865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
120	NC_020801	CCA	2	6	7940	7945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
121	NC_020801	CCA	2	6	7962	7967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474288
122	NC_020801	CGC	2	6	8043	8048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474288
123	NC_020801	GTG	2	6	8308	8313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474288
124	NC_020801	TCT	2	6	8346	8351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474288
125	NC_020801	TGC	2	6	8357	8362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474288
126	NC_020801	GCA	2	6	8423	8428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474288
127	NC_020801	CGT	2	6	8429	8434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474288
128	NC_020801	GGC	2	6	8456	8461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474288
129	NC_020801	TGG	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474288
130	NC_020801	CCG	2	6	8649	8654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_020801	CCG	2	6	8707	8712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_020801	GCC	2	6	8734	8739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_020801	CGA	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020801	GGA	2	6	9003	9008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470474289
135	NC_020801	CTT	2	6	9156	9161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474289
136	NC_020801	CCT	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_020801	CGG	2	6	9534	9539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020801	CCT	2	6	9596	9601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_020801	GGT	2	6	9697	9702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020801	CGG	2	6	9787	9792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_020801	GCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020801	AGC	2	6	10125	10130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474290
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144	NC_020801	CTG	2	6	10245	10250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474290
145	NC_020801	GCG	2	6	10275	10280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474290
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216	NC_020801	CCG	4	12	13774	13785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
217	NC_020801	CAA	2	6	13830	13835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
218	NC_020801	GAG	2	6	14080	14085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_020801	GGC	2	6	16171	16176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474297
246	NC_020801	TGT	2	6	16239	16244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470474298
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248	NC_020801	GCC	3	9	16405	16413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474298
249	NC_020801	CCG	2	6	16433	16438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474298
250	NC_020801	TGG	2	6	16515	16520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474298
251	NC_020801	AAG	2	6	16543	16548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470474298
252	NC_020801	ACC	2	6	16662	16667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
253	NC_020801	ATG	2	6	16704	16709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_020801	TCG	2	6	16788	16793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474299
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257	NC_020801	GCG	2	6	16939	16944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474299
258	NC_020801	CGT	2	6	17032	17037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474299
259	NC_020801	CAG	2	6	17042	17047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474299
260	NC_020801	TCC	2	6	17082	17087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474299
261	NC_020801	CTG	2	6	17172	17177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_020801	CTG	2	6	17638	17643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_020801	CGG	2	6	17900	17905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_020801	CCT	2	6	17971	17976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474301
265	NC_020801	GCG	2	6	17986	17991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474301
266	NC_020801	CAG	2	6	18007	18012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474301
267	NC_020801	TCG	2	6	18076	18081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474301
268	NC_020801	GGT	2	6	18124	18129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474301
269	NC_020801	TCC	2	6	18145	18150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474302
270	NC_020801	CTT	2	6	18264	18269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474302
271	NC_020801	AGC	2	6	18283	18288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474302
272	NC_020801	GCG	2	6	18483	18488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474302
273	NC_020801	GCT	2	6	18525	18530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474302
274	NC_020801	CTG	2	6	18862	18867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_020801	GGC	2	6	18934	18939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474303
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278	NC_020801	CAC	2	6	19140	19145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474303
279	NC_020801	ACC	2	6	19198	19203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474303
280	NC_020801	TGA	2	6	19242	19247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474303
281	NC_020801	GAA	2	6	19259	19264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470474303
282	NC_020801	CGG	2	6	19485	19490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_020801	TGA	2	6	19505	19510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020801	TCA	2	6	19561	19566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474304
285	NC_020801	ACT	2	6	19606	19611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474304
286	NC_020801	AGC	2	6	19639	19644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474304
287	NC_020801	GAA	2	6	19697	19702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470474304
288	NC_020801	GTG	2	6	19710	19715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474304
289	NC_020801	CAA	2	6	19718	19723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470474304
290	NC_020801	ACG	2	6	19744	19749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474304
291	NC_020801	GAT	2	6	19766	19771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474304
292	NC_020801	GTG	2	6	19821	19826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474304
293	NC_020801	GTT	2	6	20021	20026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470474304
294	NC_020801	TGA	2	6	20031	20036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474304
295	NC_020801	GTA	2	6	20050	20055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_020801	GCT	2	6	20090	20095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_020801	GCC	2	6	20199	20204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
298	NC_020801	GCG	2	6	20299	20304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_020801	GTC	2	6	20313	20318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_020801	GCG	2	6	20328	20333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_020801	GCG	2	6	20348	20353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_020801	TGC	3	9	20359	20367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_020801	GTG	2	6	20394	20399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
304	NC_020801	GGC	2	6	20400	20405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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308	NC_020801	TCT	2	6	20833	20838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474305
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323	NC_020801	GCG	2	6	21827	21832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474308
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375	NC_020801	CAG	2	6	24748	24753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_020801	GCA	2	6	24820	24825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
377	NC_020801	GGC	2	6	24839	24844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
378	NC_020801	CTC	2	6	25071	25076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474312
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