MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum FQY_4

Total Repeats: 628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020799	GCCCG	2	10	433	442	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_020799	GGCTG	2	10	5260	5269	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020799	TTTCG	2	10	5422	5431	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020799	GCGTG	2	10	5537	5546	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020799	GCGCA	2	10	37325	37334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_020799	GCAAA	2	10	54674	54683	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020799	GCGCC	2	10	55371	55380	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_020799	ATCGA	2	10	55445	55454	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020799	TGGGA	2	10	61393	61402	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020799	CACCC	2	10	69705	69714	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_020799	CCGGC	2	10	78119	78128	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_020799	CGGCG	2	10	86627	86636	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020799	ATCCC	2	10	101387	101396	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_020799	ACGCC	2	10	104484	104493	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_020799	GGATT	2	10	122349	122358	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020799	GCCCC	2	10	122545	122554	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
17	NC_020799	TGGCG	2	10	123238	123247	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020799	CTGAC	2	10	134285	134294	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_020799	CGATG	2	10	140925	140934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020799	GCCGT	2	10	142849	142858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_020799	CGCTG	2	10	143726	143735	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_020799	GTTGT	2	10	145611	145620	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020799	CGCGC	2	10	146747	146756	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_020799	CGCGC	2	10	148862	148871	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_020799	GCCCG	2	10	157903	157912	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_020799	CGGGC	2	10	170785	170794	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020799	TGGGA	2	10	183002	183011	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020799	AAATC	2	10	183060	183069	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020799	GGTCC	2	10	202402	202411	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_020799	GAATG	2	10	210587	210596	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020799	GCCAC	2	10	223406	223415	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_020799	CAGCG	2	10	225077	225086	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_020799	TGACC	2	10	227684	227693	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_020799	CGTTC	2	10	242001	242010	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_020799	TCCGC	2	10	242040	242049	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_020799	CCGGA	2	10	246577	246586	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_020799	GCCGC	2	10	247054	247063	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_020799	GCCGG	2	10	254691	254700	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_020799	GGGCC	2	10	254745	254754	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_020799	TGGCG	2	10	263416	263425	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020799	GGGCT	2	10	268276	268285	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020799	TCGCT	2	10	268428	268437	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_020799	TTTGC	2	10	268571	268580	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020799	AGCGA	2	10	268643	268652	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020799	TCCCC	2	10	268664	268673	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_020799	AGCCC	2	10	268795	268804	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_020799	CGCGG	2	10	272218	272227	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_020799	CCGGC	2	10	274135	274144	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_020799	TGCAA	2	10	276975	276984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020799	CGAAG	2	10	277064	277073	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020799	GAACG	2	10	277107	277116	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020799	TTCGA	2	10	287050	287059	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020799	TGTGC	2	10	287722	287731	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020799	GCGGG	2	10	288879	288888	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020799	GCGCT	2	10	292969	292978	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_020799	AGCGA	2	10	304259	304268	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020799	CCTCC	2	10	304274	304283	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
58	NC_020799	AGCCC	2	10	304411	304420	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_020799	GGTCG	2	10	308961	308970	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020799	GGGGA	2	10	314437	314446	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020799	TCGCT	2	10	314458	314467	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_020799	AGCGA	2	10	314673	314682	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020799	TATTG	2	10	318796	318805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020799	GTTTT	2	10	321045	321054	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020799	GGGCC	2	10	321055	321064	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_020799	CGGTG	2	10	332228	332237	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020799	ACACC	2	10	343457	343466	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_020799	GGCGC	2	10	363169	363178	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_020799	CTGGC	2	10	372553	372562	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_020799	GGCGA	2	10	373837	373846	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020799	GCCAG	2	10	374513	374522	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_020799	AGAAA	2	10	376654	376663	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020799	TGCCA	2	10	379560	379569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_020799	GTGTT	2	10	408945	408954	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020799	TTCGG	2	10	433253	433262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020799	GTCGC	2	10	434279	434288	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_020799	ATCGG	2	10	445176	445185	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020799	GCGAC	2	10	458028	458037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_020799	GCGGG	2	10	469258	469267	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020799	GGGGC	2	10	469274	469283	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020799	GCGCG	2	10	469349	469358	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_020799	GGCCG	2	10	469497	469506	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_020799	GGCGG	2	10	469519	469528	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020799	GAATG	2	10	473973	473982	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020799	TGCCG	2	10	477521	477530	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_020799	CGGCC	2	10	479358	479367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_020799	CGAAA	2	10	482597	482606	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020799	GGGCA	2	10	500731	500740	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020799	CGTGC	2	10	502554	502563	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_020799	GCACG	2	10	511241	511250	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_020799	CGCCC	2	10	513840	513849	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
92	NC_020799	CGTGC	2	10	520961	520970	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_020799	GCACC	2	10	523645	523654	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_020799	AAAAG	2	10	527217	527226	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020799	ACCCA	2	10	528240	528249	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_020799	ATTTC	2	10	530659	530668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020799	CAGGG	2	10	532626	532635	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020799	CCGCA	2	10	536321	536330	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_020799	GCCGG	2	10	542618	542627	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_020799	AGGAA	2	10	546115	546124	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020799	TCGGG	2	10	552524	552533	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020799	CGTGC	2	10	557665	557674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_020799	TCGCT	2	10	565186	565195	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_020799	TTTGC	2	10	565328	565337	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020799	AGCGA	2	10	565399	565408	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020799	AGCCC	2	10	565635	565644	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_020799	AGGCC	2	10	565689	565698	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_020799	GGCCC	2	10	567922	567931	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_020799	CAAGC	2	10	571732	571741	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_020799	CAACG	2	10	576206	576215	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_020799	CGGTC	2	10	580932	580941	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_020799	GGCCT	2	10	583948	583957	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_020799	TTTTG	2	10	585522	585531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020799	ATCCA	2	10	586334	586343	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_020799	GCCAC	2	10	586585	586594	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_020799	ATTGG	2	10	608291	608300	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020799	AAGGA	2	10	612133	612142	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020799	CGGCC	2	10	613773	613782	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119	NC_020799	CGGCC	2	10	616493	616502	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_020799	GGTGC	2	10	619255	619264	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020799	GCGGA	2	10	619287	619296	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020799	ATCAA	2	10	619442	619451	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020799	GCAGG	2	10	626120	626129	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020799	CGGAT	2	10	631654	631663	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020799	TGGCG	2	10	636979	636988	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020799	GCGCC	2	10	639703	639712	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_020799	ATGTG	2	10	642048	642057	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020799	AAACG	2	10	642308	642317	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_020799	CGGCG	2	10	644597	644606	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_020799	GCCGC	2	10	650772	650781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_020799	GCAGG	2	10	661967	661976	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_020799	CGGAC	2	10	670919	670928	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_020799	TGCCC	2	10	671112	671121	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_020799	GCAAG	2	10	671481	671490	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020799	GTGCT	2	10	674256	674265	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020799	TCCGC	2	10	683757	683766	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_020799	TCGGA	2	10	686016	686025	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020799	CGGCA	2	10	690976	690985	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_020799	GACCG	2	10	710040	710049	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_020799	TTGCC	2	10	710078	710087	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_020799	GCGAA	2	10	723579	723588	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_020799	GCCGT	2	10	728751	728760	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_020799	ATGCC	2	10	729694	729703	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_020799	CAATC	2	10	734515	734524	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_020799	ACTGA	2	10	736052	736061	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020799	CCGTG	2	10	747309	747318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_020799	GTCTG	2	10	757030	757039	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_020799	AAACG	2	10	757040	757049	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_020799	CGGGC	2	10	771575	771584	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
150	NC_020799	CGTGC	2	10	772885	772894	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_020799	TTTGT	2	10	775989	775998	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020799	GCGTG	2	10	780058	780067	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
153	NC_020799	CGGAT	2	10	781527	781536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_020799	CCGAC	2	10	1541184	1541193	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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274	NC_020799	TCGTG	2	10	1547902	1547911	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
275	NC_020799	CGGAA	2	10	1549160	1549169	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_020799	CTCAT	2	10	1551355	1551364	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
278	NC_020799	GCGAC	2	10	1551850	1551859	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
279	NC_020799	TCGAT	2	10	1555524	1555533	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
280	NC_020799	GCCAT	2	10	1557116	1557125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
281	NC_020799	AGGGC	5	25	1567310	1567334	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
282	NC_020799	CACTC	2	10	1572150	1572159	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
283	NC_020799	TGCAG	2	10	1577139	1577148	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
284	NC_020799	CGGAC	2	10	1577176	1577185	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
285	NC_020799	GGCGC	2	10	1588806	1588815	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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287	NC_020799	GCTGT	2	10	1609916	1609925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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421	NC_020799	TACCG	2	10	2470849	2470858	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_020799	GCCGG	2	10	2470859	2470868	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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424	NC_020799	GTTTT	2	10	2475643	2475652	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_020799	TGTTT	2	10	3055391	3055400	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

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