MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC47

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020798	TCCAG	2	10	1967	1976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020798	GACGC	2	10	2766	2775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_020798	CTGCG	2	10	2915	2924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_020798	AGCAA	2	10	3116	3125	60 %	0 %	20 %	20 %	470464931
5	NC_020798	GATGC	2	10	4503	4512	20 %	20 %	40 %	20 %	470464933
6	NC_020798	ATCGC	2	10	7581	7590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_020798	CGCGT	2	10	11555	11564	0 %	20 %	40 %	40 %	470464942
8	NC_020798	CAAAA	2	10	12226	12235	80 %	0 %	0 %	20 %	470464942
9	NC_020798	GCGGA	2	10	12428	12437	20 %	0 %	60 %	20 %	470464942
10	NC_020798	GCAGG	2	10	12465	12474	20 %	0 %	60 %	20 %	470464942
11	NC_020798	TGGTC	2	10	12710	12719	0 %	40 %	40 %	20 %	470464943
12	NC_020798	TGGGA	2	10	13666	13675	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020798	TCGCG	2	10	17447	17456	0 %	20 %	40 %	40 %	470464947
14	NC_020798	TTTGC	2	10	18979	18988	0 %	60 %	20 %	20 %	470464947
15	NC_020798	GCGGT	2	10	21280	21289	0 %	20 %	60 %	20 %	470464949
16	NC_020798	TCACC	2	10	21528	21537	20 %	20 %	0 %	60 %	470464950
17	NC_020798	TGACC	2	10	22104	22113	20 %	20 %	20 %	40 %	470464950
18	NC_020798	GCAAA	2	10	23401	23410	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020798	TTGCG	2	10	23820	23829	0 %	40 %	40 %	20 %	470464953
20	NC_020798	CGGCA	2	10	24051	24060	20 %	0 %	40 %	40 %	470464953
21	NC_020798	TACGC	2	10	24808	24817	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_020798	TTGAT	2	10	25106	25115	20 %	60 %	20 %	0 %	470464955
23	NC_020798	TGCGC	2	10	25200	25209	0 %	20 %	40 %	40 %	470464955
24	NC_020798	CGCAG	2	10	25346	25355	20 %	0 %	40 %	40 %	470464955
25	NC_020798	GCCGG	2	10	28831	28840	0 %	0 %	60 %	40 %	470464959
26	NC_020798	GCCTT	2	10	29826	29835	0 %	40 %	20 %	40 %	470464960
27	NC_020798	CGGCG	2	10	30075	30084	0 %	0 %	60 %	40 %	470464960
28	NC_020798	CGACT	2	10	32181	32190	20 %	20 %	20 %	40 %	470464961
29	NC_020798	ATATT	2	10	32690	32699	40 %	60 %	0 %	0 %	470464962
30	NC_020798	TCCTA	2	10	32825	32834	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_020798	GACGC	2	10	34029	34038	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_020798	CTGCG	2	10	34178	34187	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_020798	AGCAA	2	10	34379	34388	60 %	0 %	20 %	20 %	470464963
34	NC_020798	CGAGC	2	10	37316	37325	20 %	0 %	40 %	40 %	470464970
35	NC_020798	TGACG	2	10	37677	37686	20 %	20 %	40 %	20 %	470464971
36	NC_020798	TGCCG	2	10	37704	37713	0 %	20 %	40 %	40 %	470464971
37	NC_020798	ACGTC	2	10	37757	37766	20 %	20 %	20 %	40 %	470464971
38	NC_020798	CTCAC	2	10	37882	37891	20 %	20 %	0 %	60 %	470464971
39	NC_020798	CGCCC	2	10	38188	38197	0 %	0 %	20 %	80 %	470464971
40	NC_020798	CCGCA	2	10	39141	39150	20 %	0 %	20 %	60 %	470464973
41	NC_020798	GCGAC	2	10	41007	41016	20 %	0 %	40 %	40 %	470464976
42	NC_020798	CTTGG	2	10	44092	44101	0 %	40 %	40 %	20 %	470464977
43	NC_020798	AAGCG	2	10	45021	45030	40 %	0 %	40 %	20 %	470464979
44	NC_020798	CTGAT	2	10	46066	46075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020798	GCTGC	2	10	46183	46192	0 %	20 %	40 %	40 %	470464980
46	NC_020798	GCGTG	2	10	46292	46301	0 %	20 %	60 %	20 %	470464980
47	NC_020798	CCCCG	2	10	47001	47010	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.