MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC47

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020798	CTCG	2	8	131	138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020798	CCGC	2	8	397	404	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_020798	GAGC	2	8	424	431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020798	CAGC	2	8	631	638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020798	TGAC	2	8	956	963	25 %	25 %	25 %	25 %	470464929
6	NC_020798	ACGG	2	8	1050	1057	25 %	0 %	50 %	25 %	470464929
7	NC_020798	AGGA	2	8	1495	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020798	GCTC	2	8	1645	1652	0 %	25 %	25 %	50 %	470464930
9	NC_020798	CGCA	2	8	1834	1841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020798	CGGC	2	8	2455	2462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020798	GGGC	2	8	2533	2540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020798	CGCT	2	8	4190	4197	0 %	25 %	25 %	50 %	470464932
13	NC_020798	TGCT	2	8	4223	4230	0 %	50 %	25 %	25 %	470464932
14	NC_020798	CGAG	2	8	4543	4550	25 %	0 %	50 %	25 %	470464933
15	NC_020798	CGAT	2	8	4730	4737	25 %	25 %	25 %	25 %	470464934
16	NC_020798	CGAT	2	8	4742	4749	25 %	25 %	25 %	25 %	470464934
17	NC_020798	GCGA	2	8	4858	4865	25 %	0 %	50 %	25 %	470464934
18	NC_020798	ACCG	2	8	5338	5345	25 %	0 %	25 %	50 %	470464935
19	NC_020798	CGGC	2	8	5353	5360	0 %	0 %	50 %	50 %	470464935
20	NC_020798	GCCG	3	12	5412	5423	0 %	0 %	50 %	50 %	470464935
21	NC_020798	TCGA	2	8	5744	5751	25 %	25 %	25 %	25 %	470464935
22	NC_020798	GCAC	2	8	5965	5972	25 %	0 %	25 %	50 %	470464935
23	NC_020798	GCCC	2	8	6026	6033	0 %	0 %	25 %	75 %	470464935
24	NC_020798	GGCA	2	8	6130	6137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020798	CAGT	2	8	6359	6366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020798	AACC	2	8	7249	7256	50 %	0 %	0 %	50 %	470464936
27	NC_020798	GAAC	2	8	7535	7542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020798	TCGT	2	8	7553	7560	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020798	AGCT	2	8	9200	9207	25 %	25 %	25 %	25 %	470464940
30	NC_020798	GCAG	2	8	9285	9292	25 %	0 %	50 %	25 %	470464940
31	NC_020798	TTGC	2	8	9481	9488	0 %	50 %	25 %	25 %	470464940
32	NC_020798	ATGG	2	8	10247	10254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020798	ATTG	2	8	10817	10824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020798	GGTG	2	8	10899	10906	0 %	25 %	75 %	0 %	470464941
35	NC_020798	GCTA	2	8	10969	10976	25 %	25 %	25 %	25 %	470464941
36	NC_020798	GAAG	2	8	11176	11183	50 %	0 %	50 %	0 %	470464941
37	NC_020798	GCCA	2	8	11354	11361	25 %	0 %	25 %	50 %	470464941
38	NC_020798	CGGC	2	8	11793	11800	0 %	0 %	50 %	50 %	470464942
39	NC_020798	GGAC	2	8	11840	11847	25 %	0 %	50 %	25 %	470464942
40	NC_020798	GCAG	2	8	12241	12248	25 %	0 %	50 %	25 %	470464942
41	NC_020798	TGCG	2	8	12395	12402	0 %	25 %	50 %	25 %	470464942
42	NC_020798	CCGG	2	8	12837	12844	0 %	0 %	50 %	50 %	470464943
43	NC_020798	GAAG	2	8	12911	12918	50 %	0 %	50 %	0 %	470464943
44	NC_020798	GTCC	2	8	13367	13374	0 %	25 %	25 %	50 %	470464944
45	NC_020798	CGAC	2	8	14087	14094	25 %	0 %	25 %	50 %	470464945
46	NC_020798	GGTG	2	8	14211	14218	0 %	25 %	75 %	0 %	470464945
47	NC_020798	AGCG	2	8	14483	14490	25 %	0 %	50 %	25 %	470464945
48	NC_020798	TCCA	2	8	14735	14742	25 %	25 %	0 %	50 %	470464945
49	NC_020798	CGGT	2	8	15734	15741	0 %	25 %	50 %	25 %	470464946
50	NC_020798	GTCG	2	8	16200	16207	0 %	25 %	50 %	25 %	470464946
51	NC_020798	TGGT	2	8	16234	16241	0 %	50 %	50 %	0 %	470464946
52	NC_020798	CACG	2	8	17051	17058	25 %	0 %	25 %	50 %	470464947
53	NC_020798	CGGC	2	8	18083	18090	0 %	0 %	50 %	50 %	470464947
54	NC_020798	TCGA	2	8	20320	20327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020798	CACG	2	8	20876	20883	25 %	0 %	25 %	50 %	470464949
56	NC_020798	GGGC	2	8	21174	21181	0 %	0 %	75 %	25 %	470464949
57	NC_020798	CAGG	2	8	21481	21488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020798	GTTG	2	8	21984	21991	0 %	50 %	50 %	0 %	470464950
59	NC_020798	ACGC	2	8	22240	22247	25 %	0 %	25 %	50 %	470464950
60	NC_020798	CATC	2	8	22338	22345	25 %	25 %	0 %	50 %	470464950
61	NC_020798	GCCA	2	8	22801	22808	25 %	0 %	25 %	50 %	470464951
62	NC_020798	CGAT	2	8	23666	23673	25 %	25 %	25 %	25 %	470464953
63	NC_020798	CTCG	2	8	24146	24153	0 %	25 %	25 %	50 %	470464953
64	NC_020798	TCGC	2	8	24707	24714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020798	TGAC	2	8	24850	24857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020798	AGTT	2	8	24872	24879	25 %	50 %	25 %	0 %	470464955
67	NC_020798	CGGA	2	8	25301	25308	25 %	0 %	50 %	25 %	470464955
68	NC_020798	CATC	2	8	26250	26257	25 %	25 %	0 %	50 %	470464957
69	NC_020798	GCGA	2	8	26423	26430	25 %	0 %	50 %	25 %	470464957
70	NC_020798	AGCG	2	8	26642	26649	25 %	0 %	50 %	25 %	470464957
71	NC_020798	CGGT	2	8	27986	27993	0 %	25 %	50 %	25 %	470464957
72	NC_020798	GCTC	2	8	28032	28039	0 %	25 %	25 %	50 %	470464957
73	NC_020798	CGCT	2	8	29600	29607	0 %	25 %	25 %	50 %	470464960
74	NC_020798	GCCG	3	12	30018	30029	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
75	NC_020798	CTGC	2	8	30939	30946	0 %	25 %	25 %	50 %	470464960
76	NC_020798	CGGC	2	8	31643	31650	0 %	0 %	50 %	50 %	470464961
77	NC_020798	ACGC	2	8	31937	31944	25 %	0 %	25 %	50 %	470464961
78	NC_020798	CGCA	2	8	31974	31981	25 %	0 %	25 %	50 %	470464961
79	NC_020798	CGGT	2	8	32222	32229	0 %	25 %	50 %	25 %	470464961
80	NC_020798	TGGC	2	8	32361	32368	0 %	25 %	50 %	25 %	470464962
81	NC_020798	TCGG	2	8	32388	32395	0 %	25 %	50 %	25 %	470464962
82	NC_020798	GGGT	2	8	32749	32756	0 %	25 %	75 %	0 %	470464962
83	NC_020798	GCTG	2	8	32903	32910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020798	GGGC	2	8	33843	33850	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020798	AGCA	2	8	34601	34608	50 %	0 %	25 %	25 %	470464963
86	NC_020798	GGTG	2	8	35067	35074	0 %	25 %	75 %	0 %	470464964
87	NC_020798	TGCC	2	8	35679	35686	0 %	25 %	25 %	50 %	470464965
88	NC_020798	TCAC	2	8	35759	35766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020798	GCAG	2	8	36526	36533	25 %	0 %	50 %	25 %	470464968
90	NC_020798	ATCG	2	8	36812	36819	25 %	25 %	25 %	25 %	470464969
91	NC_020798	GATG	2	8	37283	37290	25 %	25 %	50 %	0 %	470464970
92	NC_020798	GGAA	2	8	38133	38140	50 %	0 %	50 %	0 %	470464971
93	NC_020798	GCCG	2	8	38412	38419	0 %	0 %	50 %	50 %	470464971
94	NC_020798	GCGA	2	8	38939	38946	25 %	0 %	50 %	25 %	470464972
95	NC_020798	TCGA	2	8	39284	39291	25 %	25 %	25 %	25 %	470464973
96	NC_020798	TTGT	2	8	39418	39425	0 %	75 %	25 %	0 %	470464973
97	NC_020798	CGAC	2	8	39507	39514	25 %	0 %	25 %	50 %	470464973
98	NC_020798	TGAG	2	8	39792	39799	25 %	25 %	50 %	0 %	470464973
99	NC_020798	GCCG	2	8	39925	39932	0 %	0 %	50 %	50 %	470464973
100	NC_020798	GTCC	2	8	40263	40270	0 %	25 %	25 %	50 %	470464974
101	NC_020798	CGAG	2	8	41195	41202	25 %	0 %	50 %	25 %	470464976
102	NC_020798	GGCT	2	8	41329	41336	0 %	25 %	50 %	25 %	470464976
103	NC_020798	CGTG	2	8	41586	41593	0 %	25 %	50 %	25 %	470464976
104	NC_020798	GCCC	2	8	42002	42009	0 %	0 %	25 %	75 %	470464976
105	NC_020798	CGCT	2	8	42379	42386	0 %	25 %	25 %	50 %	470464976
106	NC_020798	CTGA	2	8	42670	42677	25 %	25 %	25 %	25 %	470464976
107	NC_020798	GCTC	2	8	43349	43356	0 %	25 %	25 %	50 %	470464976
108	NC_020798	ATCC	2	8	45848	45855	25 %	25 %	0 %	50 %	470464979
109	NC_020798	GGGT	2	8	46578	46585	0 %	25 %	75 %	0 %	470464980

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.