MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC47

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020798	GT	3	6	121	126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020798	GC	4	8	206	213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020798	TG	3	6	714	719	0 %	50 %	50 %	0 %	470464929
4	NC_020798	CG	3	6	723	728	0 %	0 %	50 %	50 %	470464929
5	NC_020798	CG	3	6	1614	1619	0 %	0 %	50 %	50 %	470464930
6	NC_020798	CG	3	6	1666	1671	0 %	0 %	50 %	50 %	470464930
7	NC_020798	GC	3	6	2071	2076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020798	GC	3	6	2461	2466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020798	GC	3	6	2600	2605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020798	TC	3	6	2945	2950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020798	TG	3	6	3126	3131	0 %	50 %	50 %	0 %	470464931
12	NC_020798	AT	3	6	4495	4500	50 %	50 %	0 %	0 %	470464933
13	NC_020798	CG	3	6	4914	4919	0 %	0 %	50 %	50 %	470464934
14	NC_020798	CG	3	6	4983	4988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020798	GC	3	6	5548	5553	0 %	0 %	50 %	50 %	470464935
16	NC_020798	CG	4	8	6012	6019	0 %	0 %	50 %	50 %	470464935
17	NC_020798	AC	3	6	6204	6209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020798	CA	3	6	6642	6647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020798	GC	3	6	6859	6864	0 %	0 %	50 %	50 %	470464936
20	NC_020798	GC	3	6	6968	6973	0 %	0 %	50 %	50 %	470464936
21	NC_020798	GC	3	6	7172	7177	0 %	0 %	50 %	50 %	470464936
22	NC_020798	CG	4	8	7266	7273	0 %	0 %	50 %	50 %	470464936
23	NC_020798	GC	3	6	8384	8389	0 %	0 %	50 %	50 %	470464939
24	NC_020798	GC	4	8	8944	8951	0 %	0 %	50 %	50 %	470464939
25	NC_020798	GC	4	8	9567	9574	0 %	0 %	50 %	50 %	470464940
26	NC_020798	CT	3	6	10180	10185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020798	AC	3	6	11012	11017	50 %	0 %	0 %	50 %	470464941
28	NC_020798	CG	3	6	11245	11250	0 %	0 %	50 %	50 %	470464941
29	NC_020798	GC	3	6	11652	11657	0 %	0 %	50 %	50 %	470464942
30	NC_020798	GC	3	6	11751	11756	0 %	0 %	50 %	50 %	470464942
31	NC_020798	GC	3	6	11974	11979	0 %	0 %	50 %	50 %	470464942
32	NC_020798	CG	3	6	12279	12284	0 %	0 %	50 %	50 %	470464942
33	NC_020798	GA	3	6	13113	13118	50 %	0 %	50 %	0 %	470464943
34	NC_020798	CG	3	6	13319	13324	0 %	0 %	50 %	50 %	470464944
35	NC_020798	CG	4	8	13327	13334	0 %	0 %	50 %	50 %	470464944
36	NC_020798	GC	3	6	13456	13461	0 %	0 %	50 %	50 %	470464944
37	NC_020798	TA	3	6	13764	13769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020798	GC	3	6	13816	13821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020798	GC	3	6	15026	15031	0 %	0 %	50 %	50 %	470464945
40	NC_020798	GC	3	6	15702	15707	0 %	0 %	50 %	50 %	470464946
41	NC_020798	CG	3	6	16179	16184	0 %	0 %	50 %	50 %	470464946
42	NC_020798	TC	4	8	16187	16194	0 %	50 %	0 %	50 %	470464946
43	NC_020798	AG	3	6	16503	16508	50 %	0 %	50 %	0 %	470464947
44	NC_020798	CG	3	6	16764	16769	0 %	0 %	50 %	50 %	470464947
45	NC_020798	CG	3	6	17462	17467	0 %	0 %	50 %	50 %	470464947
46	NC_020798	CG	3	6	17758	17763	0 %	0 %	50 %	50 %	470464947
47	NC_020798	CA	3	6	18341	18346	50 %	0 %	0 %	50 %	470464947
48	NC_020798	GC	3	6	18375	18380	0 %	0 %	50 %	50 %	470464947
49	NC_020798	GC	3	6	18556	18561	0 %	0 %	50 %	50 %	470464947
50	NC_020798	AT	3	6	18861	18866	50 %	50 %	0 %	0 %	470464947
51	NC_020798	CA	3	6	20368	20373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020798	GC	3	6	21091	21096	0 %	0 %	50 %	50 %	470464949
53	NC_020798	GC	3	6	21925	21930	0 %	0 %	50 %	50 %	470464950
54	NC_020798	GC	3	6	22786	22791	0 %	0 %	50 %	50 %	470464951
55	NC_020798	GC	3	6	22993	22998	0 %	0 %	50 %	50 %	470464951
56	NC_020798	GC	3	6	23090	23095	0 %	0 %	50 %	50 %	470464951
57	NC_020798	GC	3	6	24026	24031	0 %	0 %	50 %	50 %	470464953
58	NC_020798	AT	4	8	24823	24830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020798	CG	3	6	25380	25385	0 %	0 %	50 %	50 %	470464955
60	NC_020798	GC	3	6	26403	26408	0 %	0 %	50 %	50 %	470464957
61	NC_020798	CG	3	6	26898	26903	0 %	0 %	50 %	50 %	470464957
62	NC_020798	GC	3	6	27511	27516	0 %	0 %	50 %	50 %	470464957
63	NC_020798	GC	3	6	27675	27680	0 %	0 %	50 %	50 %	470464957
64	NC_020798	GC	3	6	28632	28637	0 %	0 %	50 %	50 %	470464959
65	NC_020798	GC	3	6	29768	29773	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
66	NC_020798	CG	3	6	30119	30124	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
67	NC_020798	CG	3	6	30252	30257	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
68	NC_020798	CG	3	6	30315	30320	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
69	NC_020798	GC	3	6	30445	30450	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
70	NC_020798	GC	3	6	30648	30653	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
71	NC_020798	AG	3	6	30947	30952	50 %	0 %	50 %	0 %	470464960
72	NC_020798	GC	3	6	31014	31019	0 %	0 %	50 %	50 %	470464960
73	NC_020798	GC	4	8	31755	31762	0 %	0 %	50 %	50 %	470464961
74	NC_020798	CG	3	6	31862	31867	0 %	0 %	50 %	50 %	470464961
75	NC_020798	AT	3	6	32327	32332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020798	GC	3	6	33247	33252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020798	CG	3	6	33314	33319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020798	CG	3	6	33695	33700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020798	CG	3	6	33862	33867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020798	TC	3	6	34208	34213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020798	GC	3	6	34454	34459	0 %	0 %	50 %	50 %	470464963
82	NC_020798	CT	3	6	34578	34583	0 %	50 %	0 %	50 %	470464963
83	NC_020798	CG	3	6	35132	35137	0 %	0 %	50 %	50 %	470464964
84	NC_020798	TA	3	6	35444	35449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020798	GC	3	6	35910	35915	0 %	0 %	50 %	50 %	470464966
86	NC_020798	GT	3	6	35929	35934	0 %	50 %	50 %	0 %	470464966
87	NC_020798	GC	3	6	36370	36375	0 %	0 %	50 %	50 %	470464967
88	NC_020798	CG	3	6	36806	36811	0 %	0 %	50 %	50 %	470464969
89	NC_020798	CG	4	8	37003	37010	0 %	0 %	50 %	50 %	470464969
90	NC_020798	GC	3	6	37827	37832	0 %	0 %	50 %	50 %	470464971
91	NC_020798	CG	3	6	37958	37963	0 %	0 %	50 %	50 %	470464971
92	NC_020798	CG	3	6	38577	38582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020798	CA	3	6	38617	38622	50 %	0 %	0 %	50 %	470464972
94	NC_020798	CT	3	6	39116	39121	0 %	50 %	0 %	50 %	470464973
95	NC_020798	CG	3	6	39611	39616	0 %	0 %	50 %	50 %	470464973
96	NC_020798	GC	3	6	39877	39882	0 %	0 %	50 %	50 %	470464973
97	NC_020798	CG	3	6	39969	39974	0 %	0 %	50 %	50 %	470464973
98	NC_020798	CG	3	6	39981	39986	0 %	0 %	50 %	50 %	470464973
99	NC_020798	GA	3	6	40205	40210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020798	GC	3	6	40338	40343	0 %	0 %	50 %	50 %	470464974
101	NC_020798	GC	3	6	40667	40672	0 %	0 %	50 %	50 %	470464975
102	NC_020798	CA	3	6	40902	40907	50 %	0 %	0 %	50 %	470464976
103	NC_020798	GC	3	6	40957	40962	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
104	NC_020798	GC	3	6	41750	41755	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
105	NC_020798	GC	3	6	42248	42253	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
106	NC_020798	CG	3	6	42428	42433	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
107	NC_020798	GC	3	6	42463	42468	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
108	NC_020798	GC	3	6	42589	42594	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
109	NC_020798	CG	3	6	42599	42604	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
110	NC_020798	CG	5	10	42684	42693	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
111	NC_020798	GC	3	6	43552	43557	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
112	NC_020798	GC	3	6	43625	43630	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
113	NC_020798	CG	4	8	43809	43816	0 %	0 %	50 %	50 %	470464976
114	NC_020798	GC	3	6	44754	44759	0 %	0 %	50 %	50 %	470464978
115	NC_020798	GT	3	6	44791	44796	0 %	50 %	50 %	0 %	470464978
116	NC_020798	GC	3	6	44809	44814	0 %	0 %	50 %	50 %	470464978
117	NC_020798	GT	3	6	45266	45271	0 %	50 %	50 %	0 %	470464979
118	NC_020798	GC	3	6	45393	45398	0 %	0 %	50 %	50 %	470464979
119	NC_020798	GA	3	6	45629	45634	50 %	0 %	50 %	0 %	470464979
120	NC_020798	TG	3	6	45922	45927	0 %	50 %	50 %	0 %	470464979
121	NC_020798	GC	3	6	46397	46402	0 %	0 %	50 %	50 %	470464980
122	NC_020798	GT	3	6	46584	46589	0 %	50 %	50 %	0 %	470464980
123	NC_020798	GC	3	6	46596	46601	0 %	0 %	50 %	50 %	470464980

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.