MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC64

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020797	GCCAT	2	10	3092	3101	20 %	20 %	20 %	40 %	470464778
2	NC_020797	GCATT	2	10	3455	3464	20 %	40 %	20 %	20 %	470464778
3	NC_020797	GGCCG	2	10	4828	4837	0 %	0 %	60 %	40 %	470464780
4	NC_020797	GGCCG	2	10	8773	8782	0 %	0 %	60 %	40 %	470464781
5	NC_020797	GCCGC	2	10	9392	9401	0 %	0 %	40 %	60 %	470464782
6	NC_020797	GACCT	2	10	9848	9857	20 %	20 %	20 %	40 %	470464782
7	NC_020797	GTGGC	2	10	9874	9883	0 %	20 %	60 %	20 %	470464782
8	NC_020797	GCGAA	2	10	11502	11511	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020797	GCCCA	2	10	17247	17256	20 %	0 %	20 %	60 %	470464785
10	NC_020797	GATCG	2	10	17303	17312	20 %	20 %	40 %	20 %	470464785
11	NC_020797	CCCTG	2	10	19318	19327	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_020797	CCGGC	2	10	21800	21809	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_020797	GCGCC	2	10	22318	22327	0 %	0 %	40 %	60 %	470464793
14	NC_020797	CGGGT	2	10	23368	23377	0 %	20 %	60 %	20 %	470464795
15	NC_020797	GTCAG	2	10	23726	23735	20 %	20 %	40 %	20 %	470464795
16	NC_020797	CCGCA	2	10	25787	25796	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_020797	GCTTG	2	10	28225	28234	0 %	40 %	40 %	20 %	470464801
18	NC_020797	TACCG	2	10	29708	29717	20 %	20 %	20 %	40 %	470464801
19	NC_020797	GCGCC	2	10	30946	30955	0 %	0 %	40 %	60 %	470464801
20	NC_020797	TCTCG	2	10	32413	32422	0 %	40 %	20 %	40 %	470464805
21	NC_020797	CCGCT	2	10	32600	32609	0 %	20 %	20 %	60 %	470464805
22	NC_020797	GATTT	2	10	35358	35367	20 %	60 %	20 %	0 %	470464808
23	NC_020797	TGCGT	2	10	35644	35653	0 %	40 %	40 %	20 %	470464808
24	NC_020797	TCGCG	2	10	36101	36110	0 %	20 %	40 %	40 %	470464809
25	NC_020797	AATCG	2	10	36505	36514	40 %	20 %	20 %	20 %	470464809
26	NC_020797	ACCGT	2	10	38408	38417	20 %	20 %	20 %	40 %	470464812
27	NC_020797	CCGCA	2	10	39208	39217	20 %	0 %	20 %	60 %	470464814
28	NC_020797	CGATG	2	10	40133	40142	20 %	20 %	40 %	20 %	470464815
29	NC_020797	GCCGT	2	10	40180	40189	0 %	20 %	40 %	40 %	470464815
30	NC_020797	ATGCC	2	10	43444	43453	20 %	20 %	20 %	40 %	470464820
31	NC_020797	CGCTA	2	10	44389	44398	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_020797	ACGCC	2	10	44868	44877	20 %	0 %	20 %	60 %	470464823
33	NC_020797	CGGGC	2	10	47142	47151	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_020797	AATCG	2	10	47597	47606	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020797	CGATG	2	10	47876	47885	20 %	20 %	40 %	20 %	470464826
36	NC_020797	GGTAG	2	10	48732	48741	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020797	GGCGC	2	10	50442	50451	0 %	0 %	60 %	40 %	470464828
38	NC_020797	TCGGC	2	10	50504	50513	0 %	20 %	40 %	40 %	470464828
39	NC_020797	TGCGC	2	10	51563	51572	0 %	20 %	40 %	40 %	470464831
40	NC_020797	GCCCA	2	10	57953	57962	20 %	0 %	20 %	60 %	470464834
41	NC_020797	GATCG	2	10	58009	58018	20 %	20 %	40 %	20 %	470464834
42	NC_020797	CCAAG	2	10	59055	59064	40 %	0 %	20 %	40 %	470464836
43	NC_020797	TGCGG	2	10	64006	64015	0 %	20 %	60 %	20 %	470464840

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.