MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC64

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020797	GCCAT	2	10	3092	3101	20 %	20 %	20 %	40 %	470464778
2	NC_020797	GCATT	2	10	3455	3464	20 %	40 %	20 %	20 %	470464778
3	NC_020797	GGCCG	2	10	4828	4837	0 %	0 %	60 %	40 %	470464780
4	NC_020797	GGCCG	2	10	8773	8782	0 %	0 %	60 %	40 %	470464781
5	NC_020797	GCCGC	2	10	9392	9401	0 %	0 %	40 %	60 %	470464782
6	NC_020797	GACCT	2	10	9848	9857	20 %	20 %	20 %	40 %	470464782
7	NC_020797	GTGGC	2	10	9874	9883	0 %	20 %	60 %	20 %	470464782
8	NC_020797	GCCCA	2	10	17247	17256	20 %	0 %	20 %	60 %	470464785
9	NC_020797	GATCG	2	10	17303	17312	20 %	20 %	40 %	20 %	470464785
10	NC_020797	GCGCC	2	10	22318	22327	0 %	0 %	40 %	60 %	470464793
11	NC_020797	CGGGT	2	10	23368	23377	0 %	20 %	60 %	20 %	470464795
12	NC_020797	GTCAG	2	10	23726	23735	20 %	20 %	40 %	20 %	470464795
13	NC_020797	GCTTG	2	10	28225	28234	0 %	40 %	40 %	20 %	470464801
14	NC_020797	TACCG	2	10	29708	29717	20 %	20 %	20 %	40 %	470464801
15	NC_020797	GCGCC	2	10	30946	30955	0 %	0 %	40 %	60 %	470464801
16	NC_020797	TCTCG	2	10	32413	32422	0 %	40 %	20 %	40 %	470464805
17	NC_020797	CCGCT	2	10	32600	32609	0 %	20 %	20 %	60 %	470464805
18	NC_020797	GATTT	2	10	35358	35367	20 %	60 %	20 %	0 %	470464808
19	NC_020797	TGCGT	2	10	35644	35653	0 %	40 %	40 %	20 %	470464808
20	NC_020797	TCGCG	2	10	36101	36110	0 %	20 %	40 %	40 %	470464809
21	NC_020797	AATCG	2	10	36505	36514	40 %	20 %	20 %	20 %	470464809
22	NC_020797	ACCGT	2	10	38408	38417	20 %	20 %	20 %	40 %	470464812
23	NC_020797	CCGCA	2	10	39208	39217	20 %	0 %	20 %	60 %	470464814
24	NC_020797	CGATG	2	10	40133	40142	20 %	20 %	40 %	20 %	470464815
25	NC_020797	GCCGT	2	10	40180	40189	0 %	20 %	40 %	40 %	470464815
26	NC_020797	ATGCC	2	10	43444	43453	20 %	20 %	20 %	40 %	470464820
27	NC_020797	ACGCC	2	10	44868	44877	20 %	0 %	20 %	60 %	470464823
28	NC_020797	CGATG	2	10	47876	47885	20 %	20 %	40 %	20 %	470464826
29	NC_020797	GGCGC	2	10	50442	50451	0 %	0 %	60 %	40 %	470464828
30	NC_020797	TCGGC	2	10	50504	50513	0 %	20 %	40 %	40 %	470464828
31	NC_020797	TGCGC	2	10	51563	51572	0 %	20 %	40 %	40 %	470464831
32	NC_020797	GCCCA	2	10	57953	57962	20 %	0 %	20 %	60 %	470464834
33	NC_020797	GATCG	2	10	58009	58018	20 %	20 %	40 %	20 %	470464834
34	NC_020797	CCAAG	2	10	59055	59064	40 %	0 %	20 %	40 %	470464836
35	NC_020797	TGCGG	2	10	64006	64015	0 %	20 %	60 %	20 %	470464840

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.