MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC64

Total Repeats: 904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020797	GCC	2	6	37	42	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464773
2	NC_020797	TCG	2	6	70	75	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464773
3	NC_020797	GCA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464773
4	NC_020797	GCA	2	6	294	299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020797	GGC	2	6	319	324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020797	GCG	2	6	331	336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020797	CCG	2	6	348	353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020797	TCA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020797	CAA	2	6	486	491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020797	TGT	2	6	696	701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020797	CTT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020797	TTG	2	6	768	773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020797	GGT	2	6	862	867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464774
14	NC_020797	CCG	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464774
15	NC_020797	ACC	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464775
16	NC_020797	TCG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464775
17	NC_020797	ATC	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464775
18	NC_020797	GCT	2	6	1352	1357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464775
19	NC_020797	CCA	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020797	CAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464776
21	NC_020797	GCG	2	6	1954	1959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464776
22	NC_020797	AAG	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464776
23	NC_020797	GGC	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464776
24	NC_020797	CCG	2	6	2096	2101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464776
25	NC_020797	GCC	2	6	2102	2107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464776
26	NC_020797	GGC	2	6	2200	2205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020797	ACT	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020797	GAA	2	6	2315	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020797	CGC	2	6	2374	2379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020797	CGG	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464777
31	NC_020797	CCG	3	9	2610	2618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464777
32	NC_020797	GCT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464777
33	NC_020797	TGC	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464777
34	NC_020797	CCG	2	6	2692	2697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464777
35	NC_020797	GCG	3	9	2786	2794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464777
36	NC_020797	CCA	2	6	2799	2804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464777
37	NC_020797	CGC	2	6	2937	2942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464778
38	NC_020797	CCG	2	6	2959	2964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464778
39	NC_020797	GCG	2	6	3102	3107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464778
40	NC_020797	CCA	2	6	3145	3150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464778
41	NC_020797	TGG	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464778
42	NC_020797	CTG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464778
43	NC_020797	CGC	2	6	3201	3206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464778
44	NC_020797	TTG	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464778
45	NC_020797	TGC	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464778
46	NC_020797	GGC	2	6	3424	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464778
47	NC_020797	CAC	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464778
48	NC_020797	ACG	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
49	NC_020797	CCA	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464779
50	NC_020797	CCG	2	6	3523	3528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464779
51	NC_020797	AGC	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
52	NC_020797	GCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
53	NC_020797	TGC	2	6	3604	3609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464779
54	NC_020797	GCG	2	6	3622	3627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464779
55	NC_020797	GCG	2	6	3756	3761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464779
56	NC_020797	CAG	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
57	NC_020797	AAG	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020797	TGT	2	6	4223	4228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020797	TGC	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020797	ATT	2	6	4412	4417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020797	GTT	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020797	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464780
63	NC_020797	GCC	2	6	4621	4626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464780
64	NC_020797	CTG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
65	NC_020797	GCG	2	6	4689	4694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464780
66	NC_020797	TTG	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464780
67	NC_020797	TGC	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
68	NC_020797	CAA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464780
69	NC_020797	CTG	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
70	NC_020797	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464780
71	NC_020797	CGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464780
72	NC_020797	TCG	2	6	5105	5110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
73	NC_020797	CCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464780
74	NC_020797	AGC	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464780
75	NC_020797	GTG	2	6	5252	5257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464780
76	NC_020797	TGC	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
77	NC_020797	CAG	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464780
78	NC_020797	CTG	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
79	NC_020797	GTG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464780
80	NC_020797	CGG	2	6	5577	5582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464780
81	NC_020797	CTG	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
82	NC_020797	GGA	2	6	5671	5676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470464780
83	NC_020797	GTT	2	6	5681	5686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464780
84	NC_020797	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
85	NC_020797	GGT	3	9	5790	5798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020797	TCC	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_020797	ATT	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020797	CGC	2	6	5923	5928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
89	NC_020797	CCA	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464781
90	NC_020797	GAT	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464781
91	NC_020797	CCG	2	6	6194	6199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
92	NC_020797	AAG	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464781
93	NC_020797	CTC	2	6	6229	6234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470464781
94	NC_020797	TTG	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464781
95	NC_020797	GGC	2	6	6247	6252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
96	NC_020797	TCG	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
97	NC_020797	TGG	2	6	6384	6389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464781
98	NC_020797	GCA	2	6	6429	6434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
99	NC_020797	CAG	2	6	6577	6582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
100	NC_020797	AAC	2	6	6722	6727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464781
101	NC_020797	GTA	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464781
102	NC_020797	CCA	2	6	6764	6769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464781
103	NC_020797	GCC	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
104	NC_020797	TTG	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464781
105	NC_020797	GGT	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464781
106	NC_020797	CGC	2	6	7049	7054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
107	NC_020797	TCG	2	6	7061	7066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
108	NC_020797	GTG	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464781
109	NC_020797	CGA	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
110	NC_020797	CGG	2	6	7156	7161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
111	NC_020797	GCC	2	6	7239	7244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
112	NC_020797	GTC	2	6	7304	7309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
113	NC_020797	TCG	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
114	NC_020797	GTC	2	6	7426	7431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
115	NC_020797	GGC	3	9	7537	7545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
116	NC_020797	GCG	2	6	7622	7627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
117	NC_020797	GCG	2	6	7639	7644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
118	NC_020797	CAG	2	6	7738	7743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
119	NC_020797	CAG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
120	NC_020797	TCG	2	6	7811	7816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
121	NC_020797	CAG	2	6	7828	7833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
122	NC_020797	TGC	2	6	7982	7987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
123	NC_020797	TCG	2	6	8036	8041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
124	NC_020797	CGG	2	6	8118	8123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
125	NC_020797	GCT	2	6	8190	8195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
126	NC_020797	TTG	2	6	8246	8251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464781
127	NC_020797	TGG	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464781
128	NC_020797	TGG	2	6	8305	8310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464781
129	NC_020797	CAG	3	9	8314	8322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
130	NC_020797	GCG	2	6	8402	8407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
131	NC_020797	CGT	2	6	8622	8627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
132	NC_020797	CGG	2	6	8643	8648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
133	NC_020797	TGC	2	6	8681	8686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
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260	NC_020797	CCA	2	6	18711	18716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464786
261	NC_020797	TGC	2	6	18821	18826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464786
262	NC_020797	GGC	2	6	18828	18833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464786
263	NC_020797	GTA	2	6	18861	18866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464786
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265	NC_020797	ATC	2	6	18937	18942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464786
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269	NC_020797	CTG	2	6	19387	19392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_020797	TCG	2	6	19427	19432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464787
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277	NC_020797	GTC	2	6	19808	19813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_020797	CAG	2	6	20463	20468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464789
294	NC_020797	CAG	3	9	20529	20537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464789
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375	NC_020797	CCG	3	9	25802	25810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
376	NC_020797	AGC	2	6	25817	25822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
377	NC_020797	TCG	2	6	26159	26164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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380	NC_020797	CGA	2	6	26258	26263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
381	NC_020797	ACC	2	6	26347	26352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
382	NC_020797	CGA	2	6	26395	26400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_020797	GCT	2	6	26463	26468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464799
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