MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC64

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020797	GC	3	6	111	116	0 %	0 %	50 %	50 %	470464773
2	NC_020797	CG	3	6	244	249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020797	CG	3	6	1787	1792	0 %	0 %	50 %	50 %	470464776
4	NC_020797	GC	3	6	1918	1923	0 %	0 %	50 %	50 %	470464776
5	NC_020797	CG	3	6	2076	2081	0 %	0 %	50 %	50 %	470464776
6	NC_020797	TA	3	6	2239	2244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020797	TG	3	6	2309	2314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020797	GC	3	6	2674	2679	0 %	0 %	50 %	50 %	470464777
9	NC_020797	CG	3	6	2991	2996	0 %	0 %	50 %	50 %	470464778
10	NC_020797	CG	3	6	3106	3111	0 %	0 %	50 %	50 %	470464778
11	NC_020797	GC	3	6	3339	3344	0 %	0 %	50 %	50 %	470464778
12	NC_020797	CG	3	6	3794	3799	0 %	0 %	50 %	50 %	470464779
13	NC_020797	GC	3	6	4257	4262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020797	CG	3	6	5456	5461	0 %	0 %	50 %	50 %	470464780
15	NC_020797	CA	3	6	5725	5730	50 %	0 %	0 %	50 %	470464780
16	NC_020797	CG	3	6	6992	6997	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
17	NC_020797	CG	3	6	7070	7075	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
18	NC_020797	GT	3	6	10012	10017	0 %	50 %	50 %	0 %	470464782
19	NC_020797	GC	3	6	10052	10057	0 %	0 %	50 %	50 %	470464782
20	NC_020797	GC	3	6	10428	10433	0 %	0 %	50 %	50 %	470464783
21	NC_020797	GA	3	6	10515	10520	50 %	0 %	50 %	0 %	470464783
22	NC_020797	GC	3	6	10648	10653	0 %	0 %	50 %	50 %	470464783
23	NC_020797	GC	3	6	12011	12016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020797	GC	3	6	12370	12375	0 %	0 %	50 %	50 %	470464784
25	NC_020797	GC	3	6	12687	12692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020797	GC	3	6	12697	12702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020797	GC	3	6	13279	13284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020797	CG	3	6	14376	14381	0 %	0 %	50 %	50 %	470464785
29	NC_020797	GC	3	6	14388	14393	0 %	0 %	50 %	50 %	470464785
30	NC_020797	AC	3	6	14560	14565	50 %	0 %	0 %	50 %	470464785
31	NC_020797	AC	3	6	14656	14661	50 %	0 %	0 %	50 %	470464785
32	NC_020797	GC	3	6	17883	17888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020797	CG	3	6	19028	19033	0 %	0 %	50 %	50 %	470464786
34	NC_020797	GC	3	6	19216	19221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020797	CT	3	6	19402	19407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020797	TA	5	10	19848	19857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020797	TA	5	10	19868	19877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020797	AC	3	6	20812	20817	50 %	0 %	0 %	50 %	470464789
39	NC_020797	TA	3	6	20846	20851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020797	TA	5	10	20923	20932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020797	TA	3	6	21146	21151	50 %	50 %	0 %	0 %	470464790
42	NC_020797	TA	5	10	21158	21167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020797	GC	3	6	21648	21653	0 %	0 %	50 %	50 %	470464792
44	NC_020797	GC	3	6	22159	22164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020797	TG	3	6	23789	23794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020797	GC	3	6	24316	24321	0 %	0 %	50 %	50 %	470464796
47	NC_020797	GC	3	6	24831	24836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020797	CG	3	6	24837	24842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020797	GC	3	6	25486	25491	0 %	0 %	50 %	50 %	470464798
50	NC_020797	CG	4	8	26100	26107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020797	GC	3	6	26138	26143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020797	GC	3	6	26756	26761	0 %	0 %	50 %	50 %	470464800
53	NC_020797	CG	3	6	27328	27333	0 %	0 %	50 %	50 %	470464800
54	NC_020797	CG	3	6	28440	28445	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
55	NC_020797	GC	3	6	28609	28614	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
56	NC_020797	GC	3	6	28627	28632	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
57	NC_020797	GC	3	6	29087	29092	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
58	NC_020797	GC	3	6	30520	30525	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
59	NC_020797	CG	3	6	30671	30676	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
60	NC_020797	GC	3	6	30738	30743	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
61	NC_020797	CG	3	6	30889	30894	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
62	NC_020797	GT	3	6	31361	31366	0 %	50 %	50 %	0 %	470464802
63	NC_020797	GT	3	6	31583	31588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020797	GA	3	6	32230	32235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020797	CG	3	6	32803	32808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020797	CG	3	6	33234	33239	0 %	0 %	50 %	50 %	470464806
67	NC_020797	GC	3	6	33311	33316	0 %	0 %	50 %	50 %	470464806
68	NC_020797	CG	4	8	33796	33803	0 %	0 %	50 %	50 %	470464807
69	NC_020797	CG	3	6	33814	33819	0 %	0 %	50 %	50 %	470464807
70	NC_020797	TG	3	6	33827	33832	0 %	50 %	50 %	0 %	470464807
71	NC_020797	GC	3	6	34049	34054	0 %	0 %	50 %	50 %	470464807
72	NC_020797	CG	3	6	34250	34255	0 %	0 %	50 %	50 %	470464807
73	NC_020797	GA	3	6	34491	34496	50 %	0 %	50 %	0 %	470464807
74	NC_020797	CG	3	6	34838	34843	0 %	0 %	50 %	50 %	470464808
75	NC_020797	CG	3	6	35201	35206	0 %	0 %	50 %	50 %	470464808
76	NC_020797	GC	3	6	35237	35242	0 %	0 %	50 %	50 %	470464808
77	NC_020797	CA	3	6	35267	35272	50 %	0 %	0 %	50 %	470464808
78	NC_020797	GC	3	6	35429	35434	0 %	0 %	50 %	50 %	470464808
79	NC_020797	GC	3	6	35999	36004	0 %	0 %	50 %	50 %	470464809
80	NC_020797	CG	3	6	37348	37353	0 %	0 %	50 %	50 %	470464810
81	NC_020797	CG	3	6	38346	38351	0 %	0 %	50 %	50 %	470464812
82	NC_020797	CA	3	6	38423	38428	50 %	0 %	0 %	50 %	470464812
83	NC_020797	GC	3	6	39142	39147	0 %	0 %	50 %	50 %	470464814
84	NC_020797	GT	3	6	39160	39165	0 %	50 %	50 %	0 %	470464814
85	NC_020797	GA	3	6	39562	39567	50 %	0 %	50 %	0 %	470464814
86	NC_020797	GA	3	6	39775	39780	50 %	0 %	50 %	0 %	470464815
87	NC_020797	AC	3	6	40619	40624	50 %	0 %	0 %	50 %	470464815
88	NC_020797	CG	3	6	41117	41122	0 %	0 %	50 %	50 %	470464815
89	NC_020797	CG	3	6	41805	41810	0 %	0 %	50 %	50 %	470464815
90	NC_020797	TG	3	6	42995	43000	0 %	50 %	50 %	0 %	470464818
91	NC_020797	GC	3	6	44147	44152	0 %	0 %	50 %	50 %	470464821
92	NC_020797	CA	3	6	44743	44748	50 %	0 %	0 %	50 %	470464823
93	NC_020797	AT	3	6	44790	44795	50 %	50 %	0 %	0 %	470464823
94	NC_020797	GC	3	6	45136	45141	0 %	0 %	50 %	50 %	470464824
95	NC_020797	CG	3	6	46188	46193	0 %	0 %	50 %	50 %	470464825
96	NC_020797	CG	3	6	46782	46787	0 %	0 %	50 %	50 %	470464825
97	NC_020797	CG	3	6	47166	47171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020797	AT	4	8	47423	47430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020797	GC	3	6	47950	47955	0 %	0 %	50 %	50 %	470464826
100	NC_020797	GC	3	6	48031	48036	0 %	0 %	50 %	50 %	470464826
101	NC_020797	GC	3	6	48537	48542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020797	GC	3	6	49441	49446	0 %	0 %	50 %	50 %	470464827
103	NC_020797	GC	3	6	49527	49532	0 %	0 %	50 %	50 %	470464827
104	NC_020797	GA	3	6	50987	50992	50 %	0 %	50 %	0 %	470464829
105	NC_020797	CT	3	6	51317	51322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020797	TA	3	6	51365	51370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020797	GC	3	6	51736	51741	0 %	0 %	50 %	50 %	470464831
108	NC_020797	GC	3	6	51829	51834	0 %	0 %	50 %	50 %	470464831
109	NC_020797	GC	3	6	52918	52923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020797	CG	3	6	53375	53380	0 %	0 %	50 %	50 %	470464833
111	NC_020797	CG	3	6	53896	53901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020797	CG	3	6	54572	54577	0 %	0 %	50 %	50 %	470464834
113	NC_020797	GC	3	6	54584	54589	0 %	0 %	50 %	50 %	470464834
114	NC_020797	AC	3	6	54756	54761	50 %	0 %	0 %	50 %	470464834
115	NC_020797	AC	3	6	54852	54857	50 %	0 %	0 %	50 %	470464834
116	NC_020797	GC	3	6	58058	58063	0 %	0 %	50 %	50 %	470464834
117	NC_020797	GC	3	6	59341	59346	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
118	NC_020797	GC	3	6	59526	59531	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
119	NC_020797	CG	3	6	59598	59603	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
120	NC_020797	CG	5	10	60463	60472	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
121	NC_020797	CG	3	6	60552	60557	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
122	NC_020797	GC	3	6	60562	60567	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
123	NC_020797	GC	3	6	60688	60693	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
124	NC_020797	CG	3	6	60723	60728	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
125	NC_020797	GC	3	6	60903	60908	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
126	NC_020797	GC	3	6	61401	61406	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
127	NC_020797	GC	3	6	62194	62199	0 %	0 %	50 %	50 %	470464837
128	NC_020797	TG	3	6	62249	62254	0 %	50 %	50 %	0 %	470464837
129	NC_020797	GC	3	6	62484	62489	0 %	0 %	50 %	50 %	470464838
130	NC_020797	GC	3	6	62813	62818	0 %	0 %	50 %	50 %	470464839
131	NC_020797	CT	3	6	62945	62950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020797	GC	3	6	63169	63174	0 %	0 %	50 %	50 %	470464840
133	NC_020797	CG	3	6	63182	63187	0 %	0 %	50 %	50 %	470464840
134	NC_020797	CG	3	6	63273	63278	0 %	0 %	50 %	50 %	470464840
135	NC_020797	CG	3	6	63540	63545	0 %	0 %	50 %	50 %	470464840
136	NC_020797	AG	3	6	64035	64040	50 %	0 %	50 %	0 %	470464840

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.