MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020568	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223736
2	NC_020568	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020568	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020568	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223739
5	NC_020568	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223739
6	NC_020568	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470223739
7	NC_020568	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223739
8	NC_020568	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470223739
9	NC_020568	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470223741
10	NC_020568	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223741
11	NC_020568	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020568	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223745
13	NC_020568	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223745
14	NC_020568	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470223746
15	NC_020568	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020568	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020568	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223747
18	NC_020568	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223747
19	NC_020568	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223748
20	NC_020568	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223749
21	NC_020568	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223751
22	NC_020568	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470223754
23	NC_020568	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223755
24	NC_020568	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223757
25	NC_020568	AAAAAT	2	12	37192	37203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020568	AATGAA	2	12	38428	38439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020568	ACAACT	2	12	40493	40504	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470223759
28	NC_020568	GCTAAA	2	12	41732	41743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020568	ATTTGG	2	12	44977	44988	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020568	TAGTTT	2	12	47181	47192	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470223765
31	NC_020568	ATAACC	2	12	47677	47688	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470223765
32	NC_020568	TTTGTA	2	12	52832	52843	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470223768
33	NC_020568	TTTTTC	2	12	53849	53860	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470223769
34	NC_020568	TATTTT	2	12	54153	54164	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470223769
35	NC_020568	ATAAAA	2	12	55345	55356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470223770
36	NC_020568	TTGTGA	2	12	59452	59463	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223772
37	NC_020568	TTTATA	2	12	59792	59803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223772
38	NC_020568	TTTATC	2	12	60094	60105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470223773
39	NC_020568	ACAAAT	2	12	63427	63438	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470223775
40	NC_020568	AATTAA	2	12	63518	63529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223775
41	NC_020568	ATTTAT	2	12	65937	65948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020568	TTAATG	2	12	66461	66472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223776
43	NC_020568	AAGTCA	2	12	67666	67677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223777
44	NC_020568	AAAAAG	2	12	67780	67791	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223777
45	NC_020568	GAAAAA	2	12	68093	68104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223777
46	NC_020568	AATTAT	2	12	70332	70343	50 %	50 %	0 %	0 %	470223779
47	NC_020568	ACCCTT	2	12	72171	72182	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470223780
48	NC_020568	TTTAGC	2	12	74080	74091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223781
49	NC_020568	AAATAA	2	12	74131	74142	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470223781
50	NC_020568	GTTAGA	2	12	76254	76265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223782
51	NC_020568	AAAAGA	2	12	76308	76319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223782
52	NC_020568	GCTAAA	2	12	79096	79107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223784
53	NC_020568	AACAAA	2	12	79517	79528	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020568	TAAAGA	2	12	83244	83255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223789
55	NC_020568	AACCAC	2	12	87116	87127	50 %	0 %	0 %	50 %	470223791
56	NC_020568	AATATA	2	12	88818	88829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020568	AACCGA	2	12	90427	90438	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470223793
58	NC_020568	ATAGAT	2	12	95327	95338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223796
59	NC_020568	TATCAT	2	12	96094	96105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223797
60	NC_020568	TTTATT	2	12	96502	96513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470223798
61	NC_020568	TATTTG	2	12	96588	96599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470223798
62	NC_020568	TAAATA	2	12	98021	98032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223798
63	NC_020568	TTTTTC	2	12	99715	99726	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470223799
64	NC_020568	TTAAAT	2	12	99810	99821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020568	TAACAA	2	12	101167	101178	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020568	TAAGCC	2	12	101576	101587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470223801
67	NC_020568	ATCGCA	2	12	102791	102802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470223802
68	NC_020568	TTTGAA	2	12	103822	103833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223803
69	NC_020568	CAATGG	2	12	112780	112791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470223809
70	NC_020568	TGAAGA	2	12	113614	113625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470223810
71	NC_020568	TTTCAT	2	12	114295	114306	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470223811
72	NC_020568	TGTATA	2	12	118515	118526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223815
73	NC_020568	TCGAAA	2	12	120016	120027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223817
74	NC_020568	CTATTG	2	12	122602	122613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223819
75	NC_020568	CATATG	2	12	123805	123816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223820
76	NC_020568	AATGTA	2	12	124706	124717	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020568	CTGTAA	2	12	126527	126538	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020568	GGTATG	2	12	126848	126859	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470223823
79	NC_020568	CAGATT	2	12	129446	129457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223825
80	NC_020568	AGATAT	2	12	136824	136835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223832
81	NC_020568	GTTTTT	2	12	137733	137744	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020568	ATGCCT	2	12	137963	137974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470223833
83	NC_020568	TGAAAG	2	12	138603	138614	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470223833
84	NC_020568	GATATG	2	12	146103	146114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223839
85	NC_020568	ATTTGA	2	12	150009	150020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223842
86	NC_020568	GATTTT	2	12	154520	154531	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470223847
87	NC_020568	ACAAAG	2	12	159040	159051	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470223851
88	NC_020568	TGTAAT	2	12	160064	160075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020568	AAAGAT	2	12	161053	161064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223852
90	NC_020568	ATTAAT	2	12	162959	162970	50 %	50 %	0 %	0 %	470223853
91	NC_020568	CAATAT	2	12	163525	163536	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470223853
92	NC_020568	TCCCAC	2	12	164276	164287	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020568	TTGGTA	2	12	167610	167621	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223857
94	NC_020568	GCGATT	2	12	167630	167641	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470223857
95	NC_020568	AAATTT	2	12	167728	167739	50 %	50 %	0 %	0 %	470223857
96	NC_020568	ACCTGC	2	12	170631	170642	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470223859
97	NC_020568	AAGATA	2	12	170777	170788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223859
98	NC_020568	CGTTAA	2	12	173711	173722	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223861
99	NC_020568	CTATTA	2	12	175562	175573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223861
100	NC_020568	TATGAT	2	12	177096	177107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223861
101	NC_020568	TTGAAA	2	12	177548	177559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223861
102	NC_020568	AACATT	2	12	179988	179999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470223861
103	NC_020568	AGCAAC	2	12	183477	183488	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470223865
104	NC_020568	TGTTTG	2	12	183525	183536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223865
105	NC_020568	CACCTT	2	12	185529	185540	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470223867
106	NC_020568	ACCTTT	2	12	186034	186045	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470223867
107	NC_020568	TTTATA	2	12	186130	186141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020568	ATTAAT	2	12	186153	186164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020568	GTAAAT	2	12	189773	189784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223870
110	NC_020568	ATTTTA	2	12	191368	191379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223871
111	NC_020568	TATCTT	2	12	195982	195993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470223874
112	NC_020568	ATTTGG	2	12	196995	197006	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223875
113	NC_020568	GAGTTT	2	12	200338	200349	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223876
114	NC_020568	TATACA	2	12	204339	204350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470223880
115	NC_020568	TTATTT	2	12	206371	206382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470223881
116	NC_020568	ATTTAT	2	12	206950	206961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223881
117	NC_020568	TTTTTA	2	12	206981	206992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020568	CCCTGA	2	12	209708	209719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470223884
119	NC_020568	TCCTGA	2	12	210527	210538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470223884
120	NC_020568	TCAATT	2	12	212678	212689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223886
121	NC_020568	AATATG	2	12	213978	213989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223887
122	NC_020568	GATTTT	2	12	217134	217145	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020568	AAAAAT	2	12	217485	217496	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470223889
124	NC_020568	AGGACA	2	12	219345	219356	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470223891
125	NC_020568	ACATTT	2	12	219681	219692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223891
126	NC_020568	TTCTTG	2	12	224610	224621	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470223895
127	NC_020568	GGACGT	2	12	235112	235123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470223904
128	NC_020568	ATATGA	2	12	237849	237860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020568	GGAATA	2	12	252710	252721	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020568	TGGTAT	2	12	264290	264301	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020568	TATAGA	2	12	267644	267655	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223923
132	NC_020568	ATATAG	2	12	273937	273948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020568	ACGATG	2	12	274273	274284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470223928
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135	NC_020568	ATAATT	2	12	280203	280214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020568	AGAATC	2	12	281831	281842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223933
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140	NC_020568	GACATT	2	12	287926	287937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223939
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151	NC_020568	TAATTA	2	12	306671	306682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020568	ACAAGA	2	12	307511	307522	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470223953
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227	NC_020568	AAGTGA	2	12	463028	463039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470224073
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232	NC_020568	AAAATA	2	12	473410	473421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_020568	GTTGGT	2	12	474764	474775	0 %	50 %	50 %	0 %	470224079
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236	NC_020568	AATTTA	2	12	477339	477350	50 %	50 %	0 %	0 %	470224081
237	NC_020568	CAAGAA	2	12	480468	480479	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
238	NC_020568	AAAATG	2	12	490201	490212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_020568	AGTTGA	2	12	490467	490478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
241	NC_020568	TAAAAA	2	12	491415	491426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470224087
242	NC_020568	TTATAA	2	12	492862	492873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_020568	TTTATA	2	12	493779	493790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224089
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275	NC_020568	GTTATA	2	12	555511	555522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_020568	CCAAAC	2	12	596087	596098	50 %	0 %	0 %	50 %	470224154
342	NC_020568	TTTTGA	2	12	601874	601885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470224160
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345	NC_020568	TATTTA	2	12	605988	605999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224162
346	NC_020568	AATGAT	2	12	608665	608676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
347	NC_020568	TAGATG	2	12	608738	608749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
348	NC_020568	CATGAC	2	12	610688	610699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
349	NC_020568	GCAATT	2	12	612527	612538	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224167
350	NC_020568	GAAAAA	2	12	613088	613099	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470224167
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352	NC_020568	TTGATA	2	12	617336	617347	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470224171
353	NC_020568	TAAAAT	2	12	624058	624069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_020568	AAAATA	2	12	626086	626097	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470224177
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356	NC_020568	TTATTT	2	12	630176	630187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_020568	TTTAAT	2	12	632177	632188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224184
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359	NC_020568	TTTGAT	2	12	636108	636119	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470224186
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373	NC_020568	CGTCAG	2	12	658921	658932	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470224203
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462	NC_020568	TCAGTT	2	12	824378	824389	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470224332
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467	NC_020568	GATTCA	2	12	828954	828965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
468	NC_020568	GATTCA	2	12	828990	829001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
469	NC_020568	GATTCA	2	12	829008	829019	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
470	NC_020568	GATTCA	2	12	829026	829037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
471	NC_020568	ATTCAG	2	12	829063	829074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
472	NC_020568	GATTCA	2	12	829368	829379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
473	NC_020568	TCAGAC	2	12	829389	829400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224335
474	NC_020568	TCAGAT	2	12	829407	829418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
475	NC_020568	GATTCA	2	12	829422	829433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
476	NC_020568	GACTCA	2	12	829476	829487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224335
477	NC_020568	GATTCA	2	12	829566	829577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
478	NC_020568	GACTCA	2	12	829602	829613	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224335
479	NC_020568	GATTCA	2	12	829620	829631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
480	NC_020568	GACTCA	2	12	829638	829649	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224335
481	NC_020568	TATCAA	2	12	831972	831983	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
482	NC_020568	AGTACT	2	12	833510	833521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224338
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486	NC_020568	GCTCAA	2	12	839086	839097	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224341
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489	NC_020568	TAAAAA	2	12	844872	844883	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_020568	ATGTTA	2	12	846288	846299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470224347
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