MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020568	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223736
2	NC_020568	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223739
3	NC_020568	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223739
4	NC_020568	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470223739
5	NC_020568	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223739
6	NC_020568	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470223739
7	NC_020568	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470223741
8	NC_020568	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223741
9	NC_020568	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223745
10	NC_020568	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223745
11	NC_020568	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	470223746
12	NC_020568	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223747
13	NC_020568	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223747
14	NC_020568	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223748
15	NC_020568	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223749
16	NC_020568	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223751
17	NC_020568	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470223754
18	NC_020568	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223755
19	NC_020568	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223757
20	NC_020568	ACAACT	2	12	40493	40504	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470223759
21	NC_020568	TAGTTT	2	12	47181	47192	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470223765
22	NC_020568	ATAACC	2	12	47677	47688	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470223765
23	NC_020568	TTTGTA	2	12	52832	52843	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470223768
24	NC_020568	TTTTTC	2	12	53849	53860	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470223769
25	NC_020568	TATTTT	2	12	54153	54164	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470223769
26	NC_020568	ATAAAA	2	12	55345	55356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470223770
27	NC_020568	TTGTGA	2	12	59452	59463	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223772
28	NC_020568	TTTATA	2	12	59792	59803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223772
29	NC_020568	TTTATC	2	12	60094	60105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470223773
30	NC_020568	ACAAAT	2	12	63427	63438	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470223775
31	NC_020568	AATTAA	2	12	63518	63529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223775
32	NC_020568	TTAATG	2	12	66461	66472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223776
33	NC_020568	AAGTCA	2	12	67666	67677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223777
34	NC_020568	AAAAAG	2	12	67780	67791	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223777
35	NC_020568	GAAAAA	2	12	68093	68104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223777
36	NC_020568	AATTAT	2	12	70332	70343	50 %	50 %	0 %	0 %	470223779
37	NC_020568	ACCCTT	2	12	72171	72182	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470223780
38	NC_020568	TTTAGC	2	12	74080	74091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223781
39	NC_020568	AAATAA	2	12	74131	74142	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470223781
40	NC_020568	GTTAGA	2	12	76254	76265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223782
41	NC_020568	AAAAGA	2	12	76308	76319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223782
42	NC_020568	GCTAAA	2	12	79096	79107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223784
43	NC_020568	TAAAGA	2	12	83244	83255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223789
44	NC_020568	AACCAC	2	12	87116	87127	50 %	0 %	0 %	50 %	470223791
45	NC_020568	AACCGA	2	12	90427	90438	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470223793
46	NC_020568	ATAGAT	2	12	95327	95338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223796
47	NC_020568	TATCAT	2	12	96094	96105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223797
48	NC_020568	TTTATT	2	12	96502	96513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470223798
49	NC_020568	TATTTG	2	12	96588	96599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470223798
50	NC_020568	TAAATA	2	12	98021	98032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223798
51	NC_020568	TTTTTC	2	12	99715	99726	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470223799
52	NC_020568	TAAGCC	2	12	101576	101587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470223801
53	NC_020568	ATCGCA	2	12	102791	102802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470223802
54	NC_020568	TTTGAA	2	12	103822	103833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223803
55	NC_020568	CAATGG	2	12	112780	112791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470223809
56	NC_020568	TGAAGA	2	12	113614	113625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470223810
57	NC_020568	TTTCAT	2	12	114295	114306	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470223811
58	NC_020568	TGTATA	2	12	118515	118526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223815
59	NC_020568	TCGAAA	2	12	120016	120027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223817
60	NC_020568	CTATTG	2	12	122602	122613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223819
61	NC_020568	CATATG	2	12	123805	123816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223820
62	NC_020568	GGTATG	2	12	126848	126859	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470223823
63	NC_020568	CAGATT	2	12	129446	129457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223825
64	NC_020568	AGATAT	2	12	136824	136835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223832
65	NC_020568	ATGCCT	2	12	137963	137974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470223833
66	NC_020568	TGAAAG	2	12	138603	138614	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470223833
67	NC_020568	GATATG	2	12	146103	146114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223839
68	NC_020568	ATTTGA	2	12	150009	150020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223842
69	NC_020568	GATTTT	2	12	154520	154531	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470223847
70	NC_020568	ACAAAG	2	12	159040	159051	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470223851
71	NC_020568	AAAGAT	2	12	161053	161064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223852
72	NC_020568	ATTAAT	2	12	162959	162970	50 %	50 %	0 %	0 %	470223853
73	NC_020568	CAATAT	2	12	163525	163536	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470223853
74	NC_020568	TTGGTA	2	12	167610	167621	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223857
75	NC_020568	GCGATT	2	12	167630	167641	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470223857
76	NC_020568	AAATTT	2	12	167728	167739	50 %	50 %	0 %	0 %	470223857
77	NC_020568	ACCTGC	2	12	170631	170642	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470223859
78	NC_020568	AAGATA	2	12	170777	170788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223859
79	NC_020568	CGTTAA	2	12	173711	173722	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223861
80	NC_020568	CTATTA	2	12	175562	175573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223861
81	NC_020568	TATGAT	2	12	177096	177107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223861
82	NC_020568	TTGAAA	2	12	177548	177559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223861
83	NC_020568	AACATT	2	12	179988	179999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470223861
84	NC_020568	AGCAAC	2	12	183477	183488	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470223865
85	NC_020568	TGTTTG	2	12	183525	183536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223865
86	NC_020568	CACCTT	2	12	185529	185540	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470223867
87	NC_020568	ACCTTT	2	12	186034	186045	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470223867
88	NC_020568	GTAAAT	2	12	189773	189784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223870
89	NC_020568	ATTTTA	2	12	191368	191379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223871
90	NC_020568	TATCTT	2	12	195982	195993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470223874
91	NC_020568	ATTTGG	2	12	196995	197006	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223875
92	NC_020568	GAGTTT	2	12	200338	200349	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223876
93	NC_020568	TATACA	2	12	204339	204350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470223880
94	NC_020568	TTATTT	2	12	206371	206382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470223881
95	NC_020568	ATTTAT	2	12	206950	206961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223881
96	NC_020568	CCCTGA	2	12	209708	209719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470223884
97	NC_020568	TCCTGA	2	12	210527	210538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470223884
98	NC_020568	TCAATT	2	12	212678	212689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223886
99	NC_020568	AATATG	2	12	213978	213989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223887
100	NC_020568	AAAAAT	2	12	217485	217496	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470223889
101	NC_020568	AGGACA	2	12	219345	219356	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470223891
102	NC_020568	ACATTT	2	12	219681	219692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223891
103	NC_020568	TTCTTG	2	12	224610	224621	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470223895
104	NC_020568	GGACGT	2	12	235112	235123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470223904
105	NC_020568	TATAGA	2	12	267644	267655	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223923
106	NC_020568	ACGATG	2	12	274273	274284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470223928
107	NC_020568	AGAATC	2	12	281831	281842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223933
108	NC_020568	AAGTAA	2	12	285254	285265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223937
109	NC_020568	ATAAAG	2	12	286235	286246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223938
110	NC_020568	GACATT	2	12	287926	287937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223939
111	NC_020568	GATTTC	2	12	289745	289756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470223941
112	NC_020568	TTCATA	2	12	290315	290326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223942
113	NC_020568	GATTAT	2	12	294722	294733	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223945
114	NC_020568	ATGGTG	2	12	294855	294866	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470223945
115	NC_020568	CAGCAA	2	12	295242	295253	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470223945
116	NC_020568	TCTTCA	2	12	300821	300832	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470223950
117	NC_020568	TTATCT	2	12	300917	300928	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470223950
118	NC_020568	GAAAAA	2	12	303179	303190	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223952
119	NC_020568	GATACA	2	12	304344	304355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223952
120	NC_020568	ACAAGA	2	12	307511	307522	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470223953
121	NC_020568	AGGACA	2	12	307889	307900	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470223953
122	NC_020568	TAAATT	2	12	310739	310750	50 %	50 %	0 %	0 %	470223954
123	NC_020568	TGAAGA	2	12	311000	311011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470223954
124	NC_020568	TAAAAC	2	12	317449	317460	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470223958
125	NC_020568	CTGAAT	2	12	323972	323983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223964
126	NC_020568	GAAAAA	2	12	328167	328178	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470223967
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129	NC_020568	GAAACA	2	12	330835	330846	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470223969
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131	NC_020568	AATGCA	2	12	343774	343785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223979
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133	NC_020568	AAAATG	2	12	348309	348320	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223983
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137	NC_020568	GATGCT	2	12	366994	367005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470223998
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140	NC_020568	ATTAAA	2	12	370777	370788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224000
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219	NC_020568	CTGGTA	2	12	562925	562936	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470224132
220	NC_020568	ACGACT	2	12	564649	564660	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224134
221	NC_020568	AACGTG	2	12	565622	565633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470224134
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224	NC_020568	TTGCTA	2	12	568670	568681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470224136
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226	NC_020568	TTATGA	2	12	575437	575448	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470224141
227	NC_020568	TTTCTT	2	12	578631	578642	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470224144
228	NC_020568	AAGCAC	2	12	579559	579570	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470224145
229	NC_020568	ACTGCA	2	12	581565	581576	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224147
230	NC_020568	TTAAAA	2	12	581961	581972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224147
231	NC_020568	TCAGAT	2	12	583503	583514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224147
232	NC_020568	GACTCA	2	12	583518	583529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224147
233	NC_020568	GACTCA	2	12	583536	583547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224147
234	NC_020568	GACTCA	2	12	583566	583577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224147
235	NC_020568	GACTCA	2	12	583638	583649	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224147
236	NC_020568	GACTCA	2	12	583686	583697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224147
237	NC_020568	TCAGAT	2	12	583743	583754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224147
238	NC_020568	GATTCA	2	12	583848	583859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224147
239	NC_020568	GATTCA	2	12	583866	583877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224147
240	NC_020568	TCAGAT	2	12	583887	583898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224147
241	NC_020568	GACTCA	2	12	583902	583913	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224147
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249	NC_020568	GATTCA	2	12	587982	587993	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224148
250	NC_020568	GATTCA	2	12	588000	588011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224148
251	NC_020568	GACTCA	2	12	588018	588029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224148
252	NC_020568	GACTCA	2	12	588036	588047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224148
253	NC_020568	GATTCA	2	12	588054	588065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224148
254	NC_020568	TCAGAC	2	12	588075	588086	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224148
255	NC_020568	GATTCA	2	12	588090	588101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224148
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257	NC_020568	GACTCA	2	12	588162	588173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224148
258	NC_020568	GACTCA	2	12	588198	588209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224148
259	NC_020568	GATTCA	2	12	588216	588227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224148
260	NC_020568	GATTCA	2	12	588234	588245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224148
261	NC_020568	GATTCA	2	12	588252	588263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224148
262	NC_020568	TCAGAT	2	12	588273	588284	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224148
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342	NC_020568	TATATG	2	12	762918	762929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470224285
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344	NC_020568	AATGAT	2	12	764433	764444	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470224287
345	NC_020568	CAACTA	2	12	768243	768254	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470224290
346	NC_020568	CAAAAA	2	12	770749	770760	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	470224293
347	NC_020568	AAATGA	2	12	773274	773285	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470224294
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349	NC_020568	TTTTTA	2	12	779027	779038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470224300
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375	NC_020568	GATTCA	2	12	828918	828929	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224335
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442	NC_020568	TTCCAG	2	12	961513	961524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470224428
443	NC_020568	AAGTAG	2	12	963131	963142	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470224429
444	NC_020568	TGACGA	2	12	967981	967992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470224433
445	NC_020568	AAAGTA	2	12	970945	970956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470224436
446	NC_020568	ATGTTG	2	12	974003	974014	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470224437
447	NC_020568	ATAAAC	2	12	976520	976531	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470224439
448	NC_020568	TTTAAC	2	12	983010	983021	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470224443
449	NC_020568	TGACAA	2	12	986894	986905	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470224445
450	NC_020568	AAAATA	2	12	987094	987105	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470224445
451	NC_020568	AAAGAA	2	12	988369	988380	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470224446
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454	NC_020568	TAGAGG	2	12	992226	992237	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470224448
455	NC_020568	GTAAAT	2	12	997289	997300	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470224452
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457	NC_020568	GGCTTT	2	12	999888	999899	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470224454
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