MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 2459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020568	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470223735
2	NC_020568	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470223736
3	NC_020568	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470223736
4	NC_020568	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470223736
5	NC_020568	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470223738
6	NC_020568	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020568	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470223739
8	NC_020568	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	470223740
9	NC_020568	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	470223741
10	NC_020568	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020568	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020568	GCAAG	2	10	16624	16633	40 %	0 %	40 %	20 %	470223744
13	NC_020568	TTTGA	2	10	16783	16792	20 %	60 %	20 %	0 %	470223744
14	NC_020568	TCAAT	2	10	18920	18929	40 %	40 %	0 %	20 %	470223746
15	NC_020568	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	470223747
16	NC_020568	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	470223748
17	NC_020568	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020568	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020568	ACCAA	2	10	26266	26275	60 %	0 %	0 %	40 %	470223750
20	NC_020568	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470223750
21	NC_020568	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470223751
22	NC_020568	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470223751
23	NC_020568	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470223752
24	NC_020568	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470223752
25	NC_020568	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470223754
26	NC_020568	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470223754
27	NC_020568	TATGA	2	10	32680	32689	40 %	40 %	20 %	0 %	470223754
28	NC_020568	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	470223755
29	NC_020568	TTTCA	2	10	34313	34322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020568	AAATG	2	10	35554	35563	60 %	20 %	20 %	0 %	470223757
31	NC_020568	ATTTT	2	10	35635	35644	20 %	80 %	0 %	0 %	470223757
32	NC_020568	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020568	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020568	ATGAG	2	10	37066	37075	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020568	TGAAT	2	10	37413	37422	40 %	40 %	20 %	0 %	470223758
36	NC_020568	TTGGT	2	10	37455	37464	0 %	60 %	40 %	0 %	470223758
37	NC_020568	AATAT	2	10	37523	37532	60 %	40 %	0 %	0 %	470223758
38	NC_020568	TTCGT	2	10	37734	37743	0 %	60 %	20 %	20 %	470223758
39	NC_020568	CAAAA	2	10	38094	38103	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020568	AAATT	2	10	40193	40202	60 %	40 %	0 %	0 %	470223759
41	NC_020568	TTGAA	2	10	42222	42231	40 %	40 %	20 %	0 %	470223761
42	NC_020568	TTGAA	2	10	42568	42577	40 %	40 %	20 %	0 %	470223761
43	NC_020568	TTTGT	2	10	43472	43481	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020568	TTTTG	2	10	45118	45127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020568	ATATT	2	10	45239	45248	40 %	60 %	0 %	0 %	470223763
46	NC_020568	GAATT	2	10	46156	46165	40 %	40 %	20 %	0 %	470223764
47	NC_020568	TCAGT	2	10	48057	48066	20 %	40 %	20 %	20 %	470223765
48	NC_020568	GGCCA	2	10	53064	53073	20 %	0 %	40 %	40 %	470223768
49	NC_020568	AAGTA	2	10	56290	56299	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020568	TTTTA	2	10	56654	56663	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020568	TAAAT	2	10	58774	58783	60 %	40 %	0 %	0 %	470223772
52	NC_020568	ATATT	2	10	60644	60653	40 %	60 %	0 %	0 %	470223773
53	NC_020568	AATGT	2	10	61369	61378	40 %	40 %	20 %	0 %	470223774
54	NC_020568	CATTT	2	10	62273	62282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020568	TAGTA	2	10	64917	64926	40 %	40 %	20 %	0 %	470223775
56	NC_020568	TTTTA	2	10	65133	65142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020568	TACTA	2	10	66276	66285	40 %	40 %	0 %	20 %	470223776
58	NC_020568	ATCAA	2	10	69026	69035	60 %	20 %	0 %	20 %	470223778
59	NC_020568	TAATA	2	10	70858	70867	60 %	40 %	0 %	0 %	470223779
60	NC_020568	GTGTT	2	10	70941	70950	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020568	ATTCA	2	10	73533	73542	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020568	TATAT	2	10	73794	73803	40 %	60 %	0 %	0 %	470223781
63	NC_020568	CTAAA	2	10	75434	75443	60 %	20 %	0 %	20 %	470223782
64	NC_020568	CAAAA	2	10	75465	75474	80 %	0 %	0 %	20 %	470223782
65	NC_020568	GATAT	2	10	80157	80166	40 %	40 %	20 %	0 %	470223785
66	NC_020568	ATATA	2	10	80980	80989	60 %	40 %	0 %	0 %	470223786
67	NC_020568	GATAT	2	10	81814	81823	40 %	40 %	20 %	0 %	470223787
68	NC_020568	AATAA	2	10	82444	82453	80 %	20 %	0 %	0 %	470223788
69	NC_020568	ATTGC	2	10	84424	84433	20 %	40 %	20 %	20 %	470223790
70	NC_020568	TCATT	2	10	84612	84621	20 %	60 %	0 %	20 %	470223790
71	NC_020568	CATGG	2	10	85828	85837	20 %	20 %	40 %	20 %	470223790
72	NC_020568	TGAAA	2	10	86496	86505	60 %	20 %	20 %	0 %	470223791
73	NC_020568	TCAAT	2	10	86868	86877	40 %	40 %	0 %	20 %	470223791
74	NC_020568	GTATT	2	10	87357	87366	20 %	60 %	20 %	0 %	470223792
75	NC_020568	ATTAA	2	10	90099	90108	60 %	40 %	0 %	0 %	470223793
76	NC_020568	AGATA	2	10	93218	93227	60 %	20 %	20 %	0 %	470223795
77	NC_020568	TAAAA	2	10	93778	93787	80 %	20 %	0 %	0 %	470223795
78	NC_020568	ATACA	2	10	94208	94217	60 %	20 %	0 %	20 %	470223796
79	NC_020568	AAAGA	2	10	95411	95420	80 %	0 %	20 %	0 %	470223796
80	NC_020568	GTAAT	2	10	95630	95639	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020568	ATGTT	2	10	96896	96905	20 %	60 %	20 %	0 %	470223798
82	NC_020568	TTGCG	2	10	97467	97476	0 %	40 %	40 %	20 %	470223798
83	NC_020568	AGTTA	2	10	99027	99036	40 %	40 %	20 %	0 %	470223799
84	NC_020568	AGATG	2	10	102226	102235	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020568	GGTGA	2	10	102822	102831	20 %	20 %	60 %	0 %	470223802
86	NC_020568	GAAAA	2	10	106259	106268	80 %	0 %	20 %	0 %	470223805
87	NC_020568	TTATT	2	10	106426	106435	20 %	80 %	0 %	0 %	470223805
88	NC_020568	AATCA	2	10	109448	109457	60 %	20 %	0 %	20 %	470223807
89	NC_020568	ATTTT	2	10	110146	110155	20 %	80 %	0 %	0 %	470223808
90	NC_020568	ATCAA	2	10	110173	110182	60 %	20 %	0 %	20 %	470223808
91	NC_020568	ATCAC	2	10	111406	111415	40 %	20 %	0 %	40 %	470223809
92	NC_020568	AACGA	2	10	112083	112092	60 %	0 %	20 %	20 %	470223809
93	NC_020568	ACACA	2	10	114139	114148	60 %	0 %	0 %	40 %	470223811
94	NC_020568	GACAA	2	10	115290	115299	60 %	0 %	20 %	20 %	470223812
95	NC_020568	ATTAC	2	10	117474	117483	40 %	40 %	0 %	20 %	470223814
96	NC_020568	ATTTT	2	10	117778	117787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020568	TATCT	2	10	118134	118143	20 %	60 %	0 %	20 %	470223815
98	NC_020568	ATACG	2	10	120567	120576	40 %	20 %	20 %	20 %	470223817
99	NC_020568	TTATA	2	10	121225	121234	40 %	60 %	0 %	0 %	470223818
100	NC_020568	TTTTA	2	10	122023	122032	20 %	80 %	0 %	0 %	470223818
101	NC_020568	GTATT	2	10	122536	122545	20 %	60 %	20 %	0 %	470223819
102	NC_020568	AATAA	2	10	123129	123138	80 %	20 %	0 %	0 %	470223819
103	NC_020568	TACGC	2	10	123396	123405	20 %	20 %	20 %	40 %	470223819
104	NC_020568	TCCCT	2	10	126202	126211	0 %	40 %	0 %	60 %	470223822
105	NC_020568	GCTTT	2	10	128436	128445	0 %	60 %	20 %	20 %	470223824
106	NC_020568	TAATT	2	10	128521	128530	40 %	60 %	0 %	0 %	470223824
107	NC_020568	ATACT	2	10	129702	129711	40 %	40 %	0 %	20 %	470223826
108	NC_020568	TAATA	2	10	130866	130875	60 %	40 %	0 %	0 %	470223827
109	NC_020568	ATTTT	2	10	131857	131866	20 %	80 %	0 %	0 %	470223828
110	NC_020568	TTGTA	2	10	134062	134071	20 %	60 %	20 %	0 %	470223830
111	NC_020568	TGCAA	2	10	135067	135076	40 %	20 %	20 %	20 %	470223831
112	NC_020568	ATATG	2	10	137085	137094	40 %	40 %	20 %	0 %	470223832
113	NC_020568	TATGA	2	10	138765	138774	40 %	40 %	20 %	0 %	470223834
114	NC_020568	AATAT	2	10	139771	139780	60 %	40 %	0 %	0 %	470223834
115	NC_020568	TGGTA	2	10	141668	141677	20 %	40 %	40 %	0 %	470223835
116	NC_020568	CGAAC	2	10	141758	141767	40 %	0 %	20 %	40 %	470223835
117	NC_020568	TTCAA	2	10	143783	143792	40 %	40 %	0 %	20 %	470223836
118	NC_020568	ACATC	2	10	144626	144635	40 %	20 %	0 %	40 %	470223838
119	NC_020568	TAATT	2	10	146849	146858	40 %	60 %	0 %	0 %	470223839
120	NC_020568	AGAGA	2	10	149875	149884	60 %	0 %	40 %	0 %	470223842
121	NC_020568	AATCC	2	10	150231	150240	40 %	20 %	0 %	40 %	470223842
122	NC_020568	TGAAT	2	10	158987	158996	40 %	40 %	20 %	0 %	470223851
123	NC_020568	TGATT	2	10	160118	160127	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020568	CAAAA	2	10	160371	160380	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020568	CAAAA	2	10	162482	162491	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020568	TAAAG	2	10	162831	162840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020568	TTCAT	2	10	163225	163234	20 %	60 %	0 %	20 %	470223853
128	NC_020568	TTTAC	2	10	163608	163617	20 %	60 %	0 %	20 %	470223853
129	NC_020568	TTATT	2	10	164822	164831	20 %	80 %	0 %	0 %	470223854
130	NC_020568	GGATT	2	10	165810	165819	20 %	40 %	40 %	0 %	470223855
131	NC_020568	TAACT	2	10	168847	168856	40 %	40 %	0 %	20 %	470223858
132	NC_020568	TTTAT	2	10	171755	171764	20 %	80 %	0 %	0 %	470223860
133	NC_020568	TATCA	2	10	172859	172868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020568	ATGCA	2	10	173358	173367	40 %	20 %	20 %	20 %	470223861
135	NC_020568	TATGA	2	10	180604	180613	40 %	40 %	20 %	0 %	470223862
136	NC_020568	GTGAA	2	10	180638	180647	40 %	20 %	40 %	0 %	470223862
137	NC_020568	ATCAT	2	10	180991	181000	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020568	TTAAT	2	10	181081	181090	40 %	60 %	0 %	0 %	470223863
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266	NC_020568	TGAAA	2	10	324511	324520	60 %	20 %	20 %	0 %	470223964
267	NC_020568	TTTTA	2	10	328104	328113	20 %	80 %	0 %	0 %	470223967
268	NC_020568	TCATA	2	10	328471	328480	40 %	40 %	0 %	20 %	470223967
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270	NC_020568	GACAT	2	10	330577	330586	40 %	20 %	20 %	20 %	470223969
271	NC_020568	ATCAA	2	10	330737	330746	60 %	20 %	0 %	20 %	470223969
272	NC_020568	GTTAA	2	10	331793	331802	40 %	40 %	20 %	0 %	470223970
273	NC_020568	TAAAT	2	10	333369	333378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020568	AAATG	2	10	333593	333602	60 %	20 %	20 %	0 %	470223972
275	NC_020568	CCATA	2	10	334114	334123	40 %	20 %	0 %	40 %	470223972
276	NC_020568	CATTG	2	10	338415	338424	20 %	40 %	20 %	20 %	470223976
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280	NC_020568	ATATT	2	10	343219	343228	40 %	60 %	0 %	0 %	470223979
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282	NC_020568	ATAGA	2	10	345170	345179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_020568	GATTG	2	10	485705	485714	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_020568	GATAT	2	10	490170	490179	40 %	40 %	20 %	0 %	470224086
404	NC_020568	GATTT	2	10	490634	490643	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
405	NC_020568	TCTGT	2	10	492811	492820	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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497	NC_020568	TTATA	2	10	608476	608485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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