MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 2429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020568	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020568	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020568	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020568	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020568	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020568	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020568	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020568	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020568	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020568	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020568	TAAA	2	8	14546	14553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020568	AGTA	2	8	20567	20574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020568	ATTC	2	8	20652	20659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020568	TTTG	2	8	23804	23811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020568	ATCT	2	8	24139	24146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020568	GCCT	2	8	24267	24274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020568	ATTT	2	8	24599	24606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020568	ATCA	2	8	30940	30947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020568	TTCT	2	8	34392	34399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020568	ATAA	2	8	34430	34437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020568	TAAA	2	8	35807	35814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020568	AAAT	2	8	36632	36639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020568	TTAA	2	8	37184	37191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020568	AAGA	2	8	38042	38049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020568	GCAT	2	8	38222	38229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020568	AGCA	2	8	41826	41833	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020568	TCTT	2	8	44250	44257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020568	GATA	2	8	44572	44579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020568	ACTT	2	8	45002	45009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020568	TTAT	3	12	45022	45033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020568	TGGT	2	8	45592	45599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020568	TTTC	2	8	46457	46464	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020568	GTAA	2	8	46583	46590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020568	ATCC	2	8	46871	46878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020568	TCAA	2	8	48373	48380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020568	AATT	2	8	50424	50431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020568	CTTG	2	8	50475	50482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020568	AATT	2	8	50514	50521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020568	AATG	2	8	54849	54856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020568	TAAT	2	8	55091	55098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020568	ATTT	2	8	55907	55914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020568	TTAT	2	8	55968	55975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020568	CTAA	2	8	56073	56080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020568	GATT	2	8	62332	62339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020568	TAGA	2	8	62519	62526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020568	TTCA	2	8	62911	62918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020568	ATAA	2	8	63117	63124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020568	ATAA	2	8	63127	63134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020568	ATCA	2	8	63252	63259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020568	AACA	2	8	65179	65186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020568	ATTG	2	8	65296	65303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020568	CTTG	2	8	65456	65463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020568	ATTT	2	8	65615	65622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020568	CATA	2	8	66003	66010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020568	ATTA	2	8	66860	66867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020568	TCCT	2	8	67004	67011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020568	TAAT	2	8	71143	71150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020568	TGAC	2	8	71178	71185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020568	ATTT	2	8	72870	72877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020568	AAGA	2	8	73088	73095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020568	ATTT	2	8	73104	73111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020568	AAGA	2	8	73144	73151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020568	TATT	2	8	73168	73175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020568	ATTT	2	8	73338	73345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020568	AATA	2	8	74339	74346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020568	AGCT	2	8	78167	78174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020568	TAAT	2	8	78241	78248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020568	TAAT	2	8	78313	78320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020568	AGAA	2	8	78332	78339	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020568	TTGT	2	8	79451	79458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020568	AATC	2	8	82841	82848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020568	ATAA	2	8	86090	86097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020568	TTAT	2	8	88875	88882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020568	ATAA	2	8	89170	89177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020568	CAAT	2	8	91042	91049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020568	AGGG	2	8	94096	94103	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020568	ATAA	2	8	96219	96226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020568	TATT	2	8	96257	96264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020568	AGTA	2	8	98199	98206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020568	TTGT	2	8	98342	98349	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020568	AAAT	2	8	99841	99848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020568	ATTG	2	8	101087	101094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020568	GTTA	2	8	101209	101216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020568	TCAG	2	8	108300	108307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020568	TAAA	2	8	115854	115861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020568	TAAA	2	8	115892	115899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020568	GAAA	2	8	116725	116732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020568	ATAA	2	8	117543	117550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020568	TAAA	2	8	117790	117797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020568	AAAT	2	8	123702	123709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020568	ATTA	2	8	123736	123743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020568	ATTA	2	8	124575	124582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020568	TAAA	2	8	124599	124606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020568	GAGC	2	8	125512	125519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020568	TGAA	2	8	125575	125582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020568	ATAG	2	8	126486	126493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020568	TAAA	2	8	128763	128770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020568	CTTT	2	8	133194	133201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020568	CTTT	2	8	134451	134458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020568	ATTT	2	8	134538	134545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020568	AAGA	2	8	136124	136131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020568	GAGT	2	8	136147	136154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020568	ACTT	2	8	137709	137716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020568	ATTT	2	8	140047	140054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020568	TATT	2	8	142891	142898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020568	TAAT	2	8	143051	143058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020568	ATTA	2	8	147126	147133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020568	TAAA	2	8	157176	157183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020568	TAAA	2	8	160294	160301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020568	AATA	2	8	162400	162407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020568	GTTT	2	8	162680	162687	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020568	TAAC	2	8	162780	162787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020568	AAAT	2	8	164247	164254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020568	GTTT	2	8	164288	164295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020568	TGTA	2	8	164402	164409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020568	TTTA	2	8	164527	164534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020568	GAGT	2	8	166278	166285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020568	TCAT	2	8	171026	171033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020568	TTTG	2	8	171109	171116	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020568	ATTT	2	8	172475	172482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020568	ATTT	2	8	172487	172494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020568	ATGT	2	8	172718	172725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020568	TTAA	2	8	172839	172846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020568	AGTA	2	8	172881	172888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020568	ATCA	2	8	181025	181032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020568	TAAA	2	8	181750	181757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020568	ATGT	2	8	186287	186294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020568	TTAA	2	8	187767	187774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020568	AATA	2	8	187847	187854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020568	TGTA	2	8	192605	192612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020568	CTTA	2	8	192694	192701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020568	TAAT	2	8	192720	192727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020568	TTTG	2	8	192810	192817	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020568	AAAG	2	8	192991	192998	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020568	AGTT	2	8	197490	197497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020568	ATGA	2	8	197738	197745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020568	GTAG	2	8	197791	197798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020568	CTTT	2	8	205236	205243	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020568	CTAT	2	8	208398	208405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020568	ACAA	2	8	208445	208452	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020568	ATTT	2	8	208734	208741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020568	GAAA	2	8	208757	208764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020568	ATAA	2	8	208840	208847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020568	TAGT	2	8	208978	208985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020568	TAGT	2	8	217282	217289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020568	ATGA	2	8	217325	217332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020568	TGAA	2	8	227961	227968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020568	TTGT	2	8	228020	228027	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020568	TATT	2	8	228852	228859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020568	GAAA	2	8	230650	230657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020568	TTTG	2	8	234140	234147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020568	ACAT	2	8	234466	234473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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