MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI6T6 complete sequence

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020567	TAATT	2	10	4360	4369	40 %	60 %	0 %	0 %	472455815
2	NC_020567	CATAA	2	10	5185	5194	60 %	20 %	0 %	20 %	472455816
3	NC_020567	GATAC	2	10	5389	5398	40 %	20 %	20 %	20 %	472455816
4	NC_020567	ACTCA	2	10	6316	6325	40 %	20 %	0 %	40 %	472455816
5	NC_020567	AATTA	2	10	6329	6338	60 %	40 %	0 %	0 %	472455816
6	NC_020567	AATAT	2	10	6746	6755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020567	CTTTA	2	10	8491	8500	20 %	60 %	0 %	20 %	472455818
8	NC_020567	TACTA	2	10	9200	9209	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020567	ATTTG	2	10	9914	9923	20 %	60 %	20 %	0 %	472455819
10	NC_020567	AAAAG	2	10	10907	10916	80 %	0 %	20 %	0 %	472455820
11	NC_020567	TTATT	2	10	12238	12247	20 %	80 %	0 %	0 %	472455821
12	NC_020567	ATTCA	2	10	13665	13674	40 %	40 %	0 %	20 %	472455822
13	NC_020567	TATGA	2	10	14660	14669	40 %	40 %	20 %	0 %	472455823
14	NC_020567	AATAT	2	10	15066	15075	60 %	40 %	0 %	0 %	472455823
15	NC_020567	AAATT	2	10	15670	15679	60 %	40 %	0 %	0 %	472455824
16	NC_020567	TATTT	2	10	17368	17377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020567	TGTGA	2	10	19207	19216	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020567	AAAAT	2	10	19648	19657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020567	TCTAA	2	10	19694	19703	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020567	CTTGA	2	10	30331	30340	20 %	40 %	20 %	20 %	472455833
21	NC_020567	ATAAA	2	10	31000	31009	80 %	20 %	0 %	0 %	472455834
22	NC_020567	CTTTT	2	10	31246	31255	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020567	TCACA	2	10	31542	31551	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_020567	CTTTA	2	10	32124	32133	20 %	60 %	0 %	20 %	472455835

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.