MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI6T6 complete sequence

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020567	ACAT	2	8	273	280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020567	AAGA	2	8	507	514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020567	CTTA	2	8	1096	1103	25 %	50 %	0 %	25 %	472455814
4	NC_020567	AGTA	2	8	1584	1591	50 %	25 %	25 %	0 %	472455814
5	NC_020567	TAGA	2	8	1867	1874	50 %	25 %	25 %	0 %	472455814
6	NC_020567	CCAT	2	8	2321	2328	25 %	25 %	0 %	50 %	472455814
7	NC_020567	CGTA	2	8	3200	3207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020567	GTAA	2	8	3290	3297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020567	TCTT	2	8	3423	3430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020567	TTCA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020567	ATTT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020567	GCAA	2	8	3501	3508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020567	TGAA	2	8	3514	3521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020567	AAGT	2	8	3530	3537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020567	AACG	2	8	3562	3569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020567	TAAA	2	8	3681	3688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020567	AAAT	2	8	3874	3881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020567	TATT	2	8	3977	3984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020567	TTAA	2	8	4207	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	472455815
20	NC_020567	TTTA	2	8	4296	4303	25 %	75 %	0 %	0 %	472455815
21	NC_020567	AAGT	2	8	5163	5170	50 %	25 %	25 %	0 %	472455816
22	NC_020567	AAAG	2	8	5651	5658	75 %	0 %	25 %	0 %	472455816
23	NC_020567	CATT	2	8	5794	5801	25 %	50 %	0 %	25 %	472455816
24	NC_020567	TTAA	2	8	5833	5840	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
25	NC_020567	AATT	2	8	5873	5880	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
26	NC_020567	AAAG	2	8	6085	6092	75 %	0 %	25 %	0 %	472455816
27	NC_020567	ATTT	2	8	6127	6134	25 %	75 %	0 %	0 %	472455816
28	NC_020567	TGGA	2	8	6373	6380	25 %	25 %	50 %	0 %	472455816
29	NC_020567	ATTT	2	8	6893	6900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020567	TAGA	2	8	7529	7536	50 %	25 %	25 %	0 %	472455817
31	NC_020567	TAAA	2	8	7775	7782	75 %	25 %	0 %	0 %	472455817
32	NC_020567	ATAA	2	8	7913	7920	75 %	25 %	0 %	0 %	472455817
33	NC_020567	AAGA	2	8	7935	7942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020567	TATT	2	8	8023	8030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020567	ATGA	2	8	8042	8049	50 %	25 %	25 %	0 %	472455818
36	NC_020567	TTAT	2	8	8533	8540	25 %	75 %	0 %	0 %	472455818
37	NC_020567	ATTG	2	8	8658	8665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020567	TAAC	2	8	8955	8962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020567	AATA	2	8	9348	9355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020567	CATT	2	8	9430	9437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020567	AACG	2	8	9507	9514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020567	ATAA	2	8	10081	10088	75 %	25 %	0 %	0 %	472455819
43	NC_020567	GTTT	2	8	10384	10391	0 %	75 %	25 %	0 %	472455820
44	NC_020567	ATTA	2	8	10415	10422	50 %	50 %	0 %	0 %	472455820
45	NC_020567	AAAG	2	8	10722	10729	75 %	0 %	25 %	0 %	472455820
46	NC_020567	TAAT	2	8	10837	10844	50 %	50 %	0 %	0 %	472455820
47	NC_020567	TATG	2	8	11528	11535	25 %	50 %	25 %	0 %	472455820
48	NC_020567	AATT	2	8	12169	12176	50 %	50 %	0 %	0 %	472455821
49	NC_020567	AAAC	2	8	12665	12672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020567	TAAT	2	8	12918	12925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020567	CAAA	2	8	12938	12945	75 %	0 %	0 %	25 %	472455822
52	NC_020567	TCTT	2	8	13221	13228	0 %	75 %	0 %	25 %	472455822
53	NC_020567	TTTA	2	8	13302	13309	25 %	75 %	0 %	0 %	472455822
54	NC_020567	TCTT	2	8	13500	13507	0 %	75 %	0 %	25 %	472455822
55	NC_020567	CTTT	2	8	13537	13544	0 %	75 %	0 %	25 %	472455822
56	NC_020567	TAAT	2	8	13591	13598	50 %	50 %	0 %	0 %	472455822
57	NC_020567	GTTT	2	8	13651	13658	0 %	75 %	25 %	0 %	472455822
58	NC_020567	TATG	2	8	14260	14267	25 %	50 %	25 %	0 %	472455823
59	NC_020567	ATCC	2	8	14293	14300	25 %	25 %	0 %	50 %	472455823
60	NC_020567	TAGA	2	8	14313	14320	50 %	25 %	25 %	0 %	472455823
61	NC_020567	TATT	2	8	14471	14478	25 %	75 %	0 %	0 %	472455823
62	NC_020567	TTTG	2	8	15649	15656	0 %	75 %	25 %	0 %	472455824
63	NC_020567	TCTT	2	8	15739	15746	0 %	75 %	0 %	25 %	472455824
64	NC_020567	GATA	2	8	15860	15867	50 %	25 %	25 %	0 %	472455824
65	NC_020567	TCAT	2	8	15962	15969	25 %	50 %	0 %	25 %	472455824
66	NC_020567	AATA	2	8	16059	16066	75 %	25 %	0 %	0 %	472455824
67	NC_020567	AATT	2	8	16249	16256	50 %	50 %	0 %	0 %	472455824
68	NC_020567	AGAT	2	8	17041	17048	50 %	25 %	25 %	0 %	472455824
69	NC_020567	CCAA	2	8	17327	17334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020567	TTTA	2	8	17783	17790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020567	TAGA	2	8	17861	17868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020567	TATT	2	8	18125	18132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020567	GTAT	2	8	18548	18555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020567	TTAG	2	8	18707	18714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020567	TGAA	2	8	18851	18858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020567	TTAC	2	8	18973	18980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020567	TTTA	2	8	19113	19120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020567	CTAG	2	8	19906	19913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020567	TAAA	2	8	20277	20284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020567	ATAA	2	8	20319	20326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020567	AAAT	2	8	20495	20502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020567	CAAA	2	8	20517	20524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020567	TACA	2	8	20811	20818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020567	ATTA	2	8	20984	20991	50 %	50 %	0 %	0 %	472455825
85	NC_020567	TTAG	2	8	21459	21466	25 %	50 %	25 %	0 %	472455825
86	NC_020567	CAAC	2	8	21530	21537	50 %	0 %	0 %	50 %	472455825
87	NC_020567	TCGG	2	8	21678	21685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020567	AAGC	2	8	22031	22038	50 %	0 %	25 %	25 %	472455826
89	NC_020567	GCTA	2	8	22495	22502	25 %	25 %	25 %	25 %	472455826
90	NC_020567	GTGG	2	8	22728	22735	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020567	ATTT	2	8	22748	22755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020567	ATTT	2	8	22763	22770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020567	AGGT	2	8	23054	23061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020567	TGTA	2	8	23380	23387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020567	TAAA	2	8	23653	23660	75 %	25 %	0 %	0 %	472455827
96	NC_020567	AAAT	2	8	23845	23852	75 %	25 %	0 %	0 %	472455827
97	NC_020567	AAGA	2	8	24646	24653	75 %	0 %	25 %	0 %	472455828
98	NC_020567	TATT	2	8	25043	25050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020567	ACAT	2	8	25878	25885	50 %	25 %	0 %	25 %	472455829
100	NC_020567	AAGA	2	8	26112	26119	75 %	0 %	25 %	0 %	472455829
101	NC_020567	AGTA	2	8	26453	26460	50 %	25 %	25 %	0 %	472455830
102	NC_020567	TATT	2	8	26991	26998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020567	TAGA	2	8	27024	27031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020567	CCGA	2	8	27264	27271	25 %	0 %	25 %	50 %	472455831
105	NC_020567	CGGA	2	8	27359	27366	25 %	0 %	50 %	25 %	472455831
106	NC_020567	ACGG	2	8	27654	27661	25 %	0 %	50 %	25 %	472455831
107	NC_020567	TCAC	2	8	27992	27999	25 %	25 %	0 %	50 %	472455832
108	NC_020567	CGAT	2	8	28167	28174	25 %	25 %	25 %	25 %	472455832
109	NC_020567	CGCT	2	8	28616	28623	0 %	25 %	25 %	50 %	472455832
110	NC_020567	TCAT	2	8	28766	28773	25 %	50 %	0 %	25 %	472455832
111	NC_020567	TGAC	2	8	28946	28953	25 %	25 %	25 %	25 %	472455832
112	NC_020567	GGCT	2	8	29249	29256	0 %	25 %	50 %	25 %	472455832
113	NC_020567	CATC	2	8	29853	29860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020567	TACA	2	8	29906	29913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020567	ATAG	2	8	30310	30317	50 %	25 %	25 %	0 %	472455833
116	NC_020567	CTTT	2	8	30877	30884	0 %	75 %	0 %	25 %	472455834
117	NC_020567	AACT	2	8	30905	30912	50 %	25 %	0 %	25 %	472455834
118	NC_020567	TAGG	2	8	31028	31035	25 %	25 %	50 %	0 %	472455834
119	NC_020567	ATTC	2	8	31070	31077	25 %	50 %	0 %	25 %	472455834
120	NC_020567	ATTT	2	8	31175	31182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020567	TTAT	2	8	31694	31701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020567	TACC	2	8	32171	32178	25 %	25 %	0 %	50 %	472455835
123	NC_020567	TTAC	2	8	32350	32357	25 %	50 %	0 %	25 %	472455835

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.