MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI6T6 complete sequence

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020567	CTTA	2	8	1096	1103	25 %	50 %	0 %	25 %	472455814
2	NC_020567	AGTA	2	8	1584	1591	50 %	25 %	25 %	0 %	472455814
3	NC_020567	TAGA	2	8	1867	1874	50 %	25 %	25 %	0 %	472455814
4	NC_020567	CCAT	2	8	2321	2328	25 %	25 %	0 %	50 %	472455814
5	NC_020567	TTAA	2	8	4207	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	472455815
6	NC_020567	TTTA	2	8	4296	4303	25 %	75 %	0 %	0 %	472455815
7	NC_020567	AAGT	2	8	5163	5170	50 %	25 %	25 %	0 %	472455816
8	NC_020567	AAAG	2	8	5651	5658	75 %	0 %	25 %	0 %	472455816
9	NC_020567	CATT	2	8	5794	5801	25 %	50 %	0 %	25 %	472455816
10	NC_020567	TTAA	2	8	5833	5840	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
11	NC_020567	AATT	2	8	5873	5880	50 %	50 %	0 %	0 %	472455816
12	NC_020567	AAAG	2	8	6085	6092	75 %	0 %	25 %	0 %	472455816
13	NC_020567	ATTT	2	8	6127	6134	25 %	75 %	0 %	0 %	472455816
14	NC_020567	TGGA	2	8	6373	6380	25 %	25 %	50 %	0 %	472455816
15	NC_020567	TAGA	2	8	7529	7536	50 %	25 %	25 %	0 %	472455817
16	NC_020567	TAAA	2	8	7775	7782	75 %	25 %	0 %	0 %	472455817
17	NC_020567	ATAA	2	8	7913	7920	75 %	25 %	0 %	0 %	472455817
18	NC_020567	ATGA	2	8	8042	8049	50 %	25 %	25 %	0 %	472455818
19	NC_020567	TTAT	2	8	8533	8540	25 %	75 %	0 %	0 %	472455818
20	NC_020567	ATAA	2	8	10081	10088	75 %	25 %	0 %	0 %	472455819
21	NC_020567	GTTT	2	8	10384	10391	0 %	75 %	25 %	0 %	472455820
22	NC_020567	ATTA	2	8	10415	10422	50 %	50 %	0 %	0 %	472455820
23	NC_020567	AAAG	2	8	10722	10729	75 %	0 %	25 %	0 %	472455820
24	NC_020567	TAAT	2	8	10837	10844	50 %	50 %	0 %	0 %	472455820
25	NC_020567	TATG	2	8	11528	11535	25 %	50 %	25 %	0 %	472455820
26	NC_020567	AATT	2	8	12169	12176	50 %	50 %	0 %	0 %	472455821
27	NC_020567	CAAA	2	8	12938	12945	75 %	0 %	0 %	25 %	472455822
28	NC_020567	TCTT	2	8	13221	13228	0 %	75 %	0 %	25 %	472455822
29	NC_020567	TTTA	2	8	13302	13309	25 %	75 %	0 %	0 %	472455822
30	NC_020567	TCTT	2	8	13500	13507	0 %	75 %	0 %	25 %	472455822
31	NC_020567	CTTT	2	8	13537	13544	0 %	75 %	0 %	25 %	472455822
32	NC_020567	TAAT	2	8	13591	13598	50 %	50 %	0 %	0 %	472455822
33	NC_020567	GTTT	2	8	13651	13658	0 %	75 %	25 %	0 %	472455822
34	NC_020567	TATG	2	8	14260	14267	25 %	50 %	25 %	0 %	472455823
35	NC_020567	ATCC	2	8	14293	14300	25 %	25 %	0 %	50 %	472455823
36	NC_020567	TAGA	2	8	14313	14320	50 %	25 %	25 %	0 %	472455823
37	NC_020567	TATT	2	8	14471	14478	25 %	75 %	0 %	0 %	472455823
38	NC_020567	TTTG	2	8	15649	15656	0 %	75 %	25 %	0 %	472455824
39	NC_020567	TCTT	2	8	15739	15746	0 %	75 %	0 %	25 %	472455824
40	NC_020567	GATA	2	8	15860	15867	50 %	25 %	25 %	0 %	472455824
41	NC_020567	TCAT	2	8	15962	15969	25 %	50 %	0 %	25 %	472455824
42	NC_020567	AATA	2	8	16059	16066	75 %	25 %	0 %	0 %	472455824
43	NC_020567	AATT	2	8	16249	16256	50 %	50 %	0 %	0 %	472455824
44	NC_020567	AGAT	2	8	17041	17048	50 %	25 %	25 %	0 %	472455824
45	NC_020567	ATTA	2	8	20984	20991	50 %	50 %	0 %	0 %	472455825
46	NC_020567	TTAG	2	8	21459	21466	25 %	50 %	25 %	0 %	472455825
47	NC_020567	CAAC	2	8	21530	21537	50 %	0 %	0 %	50 %	472455825
48	NC_020567	AAGC	2	8	22031	22038	50 %	0 %	25 %	25 %	472455826
49	NC_020567	GCTA	2	8	22495	22502	25 %	25 %	25 %	25 %	472455826
50	NC_020567	TAAA	2	8	23653	23660	75 %	25 %	0 %	0 %	472455827
51	NC_020567	AAAT	2	8	23845	23852	75 %	25 %	0 %	0 %	472455827
52	NC_020567	AAGA	2	8	24646	24653	75 %	0 %	25 %	0 %	472455828
53	NC_020567	ACAT	2	8	25878	25885	50 %	25 %	0 %	25 %	472455829
54	NC_020567	AAGA	2	8	26112	26119	75 %	0 %	25 %	0 %	472455829
55	NC_020567	AGTA	2	8	26453	26460	50 %	25 %	25 %	0 %	472455830
56	NC_020567	CCGA	2	8	27264	27271	25 %	0 %	25 %	50 %	472455831
57	NC_020567	CGGA	2	8	27359	27366	25 %	0 %	50 %	25 %	472455831
58	NC_020567	ACGG	2	8	27654	27661	25 %	0 %	50 %	25 %	472455831
59	NC_020567	TCAC	2	8	27992	27999	25 %	25 %	0 %	50 %	472455832
60	NC_020567	CGAT	2	8	28167	28174	25 %	25 %	25 %	25 %	472455832
61	NC_020567	CGCT	2	8	28616	28623	0 %	25 %	25 %	50 %	472455832
62	NC_020567	TCAT	2	8	28766	28773	25 %	50 %	0 %	25 %	472455832
63	NC_020567	TGAC	2	8	28946	28953	25 %	25 %	25 %	25 %	472455832
64	NC_020567	GGCT	2	8	29249	29256	0 %	25 %	50 %	25 %	472455832
65	NC_020567	ATAG	2	8	30310	30317	50 %	25 %	25 %	0 %	472455833
66	NC_020567	CTTT	2	8	30877	30884	0 %	75 %	0 %	25 %	472455834
67	NC_020567	AACT	2	8	30905	30912	50 %	25 %	0 %	25 %	472455834
68	NC_020567	TAGG	2	8	31028	31035	25 %	25 %	50 %	0 %	472455834
69	NC_020567	ATTC	2	8	31070	31077	25 %	50 %	0 %	25 %	472455834
70	NC_020567	TACC	2	8	32171	32178	25 %	25 %	0 %	50 %	472455835
71	NC_020567	TTAC	2	8	32350	32357	25 %	50 %	0 %	25 %	472455835

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.