MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI6T6 complete sequence

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020567	AT	3	6	71	76	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020567	TA	3	6	578	583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020567	AC	3	6	3261	3266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020567	AT	3	6	3712	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020567	TA	3	6	3836	3841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020567	TA	3	6	6852	6857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020567	AT	3	6	7159	7164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020567	CT	3	6	7208	7213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020567	TA	5	10	7223	7232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020567	TA	3	6	7323	7328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020567	AC	3	6	7957	7962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020567	TC	3	6	8682	8687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020567	TA	3	6	8772	8777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020567	AT	3	6	8808	8813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020567	AG	3	6	9448	9453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020567	CT	3	6	9466	9471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020567	AT	5	10	9549	9558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020567	AT	3	6	11858	11863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020567	TA	3	6	12625	12630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020567	TA	3	6	12880	12885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020567	TA	3	6	13914	13919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020567	TA	3	6	14021	14026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020567	AT	4	8	14046	14053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020567	GA	3	6	15604	15609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020567	AT	3	6	17492	17497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020567	AT	3	6	17813	17818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020567	TA	4	8	18082	18089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020567	AG	3	6	18833	18838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020567	TA	3	6	19099	19104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020567	TG	3	6	19358	19363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020567	TA	3	6	19427	19432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020567	AG	3	6	19501	19506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020567	TA	3	6	19571	19576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020567	GA	3	6	19816	19821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020567	TA	3	6	19976	19981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020567	AT	3	6	20501	20506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020567	TA	3	6	23282	23287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020567	TA	3	6	23350	23355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020567	GA	3	6	23580	23585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020567	TA	3	6	24113	24118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020567	GA	3	6	24923	24928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020567	AT	3	6	24963	24968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020567	TA	3	6	25138	25143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020567	TC	3	6	25213	25218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020567	AG	3	6	25238	25243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020567	CT	3	6	29552	29557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020567	TC	3	6	31351	31356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020567	AT	3	6	31462	31467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.