MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020566	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020566	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020566	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020566	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020566	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020566	AAAAAT	2	12	37312	37323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020566	AATGAA	2	12	38548	38559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020566	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020566	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020566	ATTTAT	2	12	66057	66068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020566	AACAAA	2	12	79636	79647	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020566	AATATA	2	12	88937	88948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020566	TTAAAT	2	12	99929	99940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020566	TAACAA	2	12	101286	101297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020566	AATGTA	2	12	124825	124836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020566	CTGTAA	2	12	126646	126657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020566	CAGATT	2	12	129562	129573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020566	GTTTTT	2	12	137849	137860	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020566	TGTAAT	2	12	160180	160191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020566	TCCCAC	2	12	164392	164403	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_020566	TTTATA	2	12	186246	186257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020566	ATTAAT	2	12	186269	186280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020566	TTTTTA	2	12	207097	207108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020566	GATTTT	2	12	217250	217261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020566	ATATGA	2	12	237965	237976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020566	GGAATA	2	12	252744	252755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020566	TGGTAT	2	12	264324	264335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020566	ATATAG	2	12	273967	273978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020566	ATTTTC	2	12	279283	279294	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020566	ATAATT	2	12	280232	280243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020566	AACGAT	2	12	287602	287613	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020566	TAACTT	2	12	295977	295988	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020566	TAATTA	2	12	306700	306711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020566	ATATGA	2	12	345231	345242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020566	TTCATT	2	12	349686	349697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020566	TGCAAT	2	12	352818	352829	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020566	TTGTAA	2	12	354989	355000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020566	AAGTAC	2	12	369280	369291	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020566	GAAGAC	2	12	387370	387381	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020566	AATGTA	2	12	392990	393001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020566	AATTTG	2	12	393097	393108	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020566	TAAAGA	2	12	395085	395096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020566	ATGAAA	2	12	417284	417295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020566	TGAAAT	2	12	418006	418017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020566	TTTAAT	2	12	423010	423021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020566	TGTATA	2	12	432242	432253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020566	TTTTTA	2	12	446877	446888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020566	TTAACA	2	12	462711	462722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020566	ACGTTG	2	12	472674	472685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020566	AAAATA	2	12	473396	473407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020566	CAAGAA	2	12	480454	480465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020566	AAAATG	2	12	490181	490192	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020566	CAAGAT	2	12	490208	490219	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020566	AGTTGA	2	12	490447	490458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020566	TTATAA	2	12	492842	492853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020566	AAATTT	2	12	499601	499612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020566	TGAAAG	2	12	522982	522993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020566	CATTTA	2	12	552357	552368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020566	CAGTAG	2	12	554410	554421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020566	TTATAA	2	12	554772	554783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020566	GTTATA	2	12	555443	555454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020566	TTGTAC	2	12	563714	563725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020566	CTTAAA	2	12	563875	563886	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020566	ACATGT	2	12	573849	573860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020566	ATTGCG	2	12	604680	604691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020566	AATGAT	2	12	608598	608609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020566	TAGATG	2	12	608671	608682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020566	CATGAC	2	12	610621	610632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020566	TAAAAT	2	12	623991	624002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020566	TTATTT	2	12	630109	630120	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020566	GAAAAA	2	12	634434	634445	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020566	CATTAT	2	12	646187	646198	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020566	TACTTG	2	12	650588	650599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020566	CATCAA	2	12	658238	658249	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020566	TAATTT	2	12	662478	662489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020566	ATAAAA	2	12	663385	663396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020566	TGAATA	2	12	678954	678965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020566	ATTTAT	2	12	698303	698314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020566	AATTGA	2	12	698382	698393	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020566	TTAAAA	2	12	704963	704974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020566	GAAAAA	2	12	705153	705164	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020566	AAAGAT	2	12	705267	705278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020566	TAGTTA	2	12	709398	709409	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020566	TTTTTA	2	12	727605	727616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020566	ATATCA	2	12	734356	734367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020566	GAATTA	2	12	735650	735661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020566	TGAAAA	2	12	735848	735859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020566	TTAATT	2	12	790006	790017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020566	ACAAAA	2	12	804764	804775	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020566	AAACAA	2	12	817271	817282	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020566	TTTATT	2	12	822438	822449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020566	TAAAAA	2	12	824130	824141	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020566	TATCAA	2	12	832108	832119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020566	TTTTGA	2	12	835928	835939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020566	CTGTTT	2	12	836706	836717	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020566	TCATTT	2	12	841920	841931	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020566	TAAAAA	2	12	845008	845019	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020566	AGAAAA	2	12	849046	849057	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020566	AGTGAA	2	12	853486	853497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020566	ATAAAG	2	12	853869	853880	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020566	AAATTA	2	12	858643	858654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020566	AAGCAC	2	12	867376	867387	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020566	TAAAAT	2	12	876744	876755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020566	TGTAAT	2	12	881505	881516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020566	TTACAT	2	12	919498	919509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_020566	ATTTAG	2	12	932786	932797	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020566	ATTCAA	2	12	932951	932962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020566	TTTAAT	2	12	949271	949282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020566	TTGTTT	2	12	955360	955371	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020566	AAATTA	2	12	956405	956416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020566	ACAATA	2	12	966672	966683	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020566	AACGGA	2	12	981195	981206	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_020566	AAAAGC	2	12	985793	985804	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020566	CACTTG	2	12	995177	995188	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020566	CTAAAT	2	12	1000190	1000201	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020566	CATTTA	2	12	1009343	1009354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020566	ATCATA	2	12	1011238	1011249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020566	TCAAAA	2	12	1017746	1017757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020566	ATTGCA	2	12	1018875	1018886	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020566	TTTTCT	2	12	1031605	1031616	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_020566	TAGTAT	2	12	1060613	1060624	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020566	TTTATA	2	12	1067763	1067774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020566	ATTTTA	2	12	1074659	1074670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020566	TGGATA	2	12	1079604	1079615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020566	ATTTTT	2	12	1091713	1091724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020566	ATAATT	2	12	1092510	1092521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020566	TCATTA	2	12	1097723	1097734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_020566	TAATGA	2	12	1105809	1105820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020566	GATTGC	2	12	1117008	1117019	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020566	ATTTAT	2	12	1126376	1126387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020566	AAATTT	2	12	1131095	1131106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020566	GATTTT	2	12	1135184	1135195	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020566	AAGTAA	2	12	1152800	1152811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020566	TCGTTT	2	12	1155927	1155938	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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151	NC_020566	AAAATA	2	12	1341756	1341767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_020566	TTGATA	2	12	1387827	1387838	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_020566	TTTAAT	2	12	2159920	2159931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_020566	CAAATA	2	12	2162140	2162151	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_020566	TAAATG	2	12	2166194	2166205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_020566	AATTAA	2	12	2175571	2175582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_020566	ATCATT	2	12	2203328	2203339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_020566	AGTTAA	2	12	2206912	2206923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_020566	TTTATT	2	12	2221358	2221369	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_020566	AATATT	2	12	2227039	2227050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_020566	TTTACG	2	12	2331589	2331600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
284	NC_020566	AATATA	2	12	2345524	2345535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.