MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020566	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020566	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020566	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020566	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020566	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020566	TTTCA	2	10	34313	34322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020566	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020566	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020566	ATGAG	2	10	37186	37195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020566	CAAAA	2	10	38214	38223	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020566	TTTGT	2	10	43592	43601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020566	TTTTG	2	10	45238	45247	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020566	AAGTA	2	10	56410	56419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020566	TTTTA	2	10	56774	56783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020566	CATTT	2	10	62393	62402	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020566	TTTTA	2	10	65253	65262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020566	GTGTT	2	10	71061	71070	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020566	ATTCA	2	10	73652	73661	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020566	GTAAT	2	10	95749	95758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020566	AGATG	2	10	102345	102354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020566	ATTTT	2	10	117897	117906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020566	TGATT	2	10	160234	160243	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020566	CAAAA	2	10	160487	160496	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020566	CAAAA	2	10	162598	162607	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020566	TAAAG	2	10	162947	162956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020566	TATCA	2	10	172975	172984	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020566	ATCAT	2	10	181107	181116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020566	CAACT	2	10	193239	193248	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020566	GCTTT	2	10	197751	197760	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020566	TGAAG	2	10	197953	197962	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020566	AAAAT	2	10	198024	198033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020566	TGATT	2	10	198097	198106	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020566	GAAAA	2	10	208745	208754	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020566	TAACA	2	10	209116	209125	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020566	AATAT	2	10	228311	228320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020566	TATTG	2	10	231515	231524	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020566	TATTT	2	10	234302	234311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020566	AATTG	2	10	240015	240024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020566	AACAT	2	10	242563	242572	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020566	GATAA	2	10	246500	246509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020566	ATAAC	2	10	251147	251156	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020566	TGAAT	2	10	251258	251267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020566	ATTAA	2	10	251399	251408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020566	AAAGT	2	10	255143	255152	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020566	AATTA	2	10	255256	255265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020566	TAAAA	2	10	256856	256865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020566	AAATT	2	10	258172	258181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020566	TAAAA	2	10	272314	272323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020566	CATTC	2	10	277361	277370	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_020566	GAAAA	2	10	280103	280112	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020566	ATAAA	2	10	280221	280230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020566	TCATA	2	10	288683	288692	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020566	ATTTA	2	10	302606	302615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020566	ACTCG	2	10	306467	306476	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_020566	AATTT	2	10	312878	312887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020566	AATTA	2	10	314259	314268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020566	TAAAT	2	10	333360	333369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020566	ATTTT	2	10	338917	338926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020566	ATAGA	2	10	345161	345170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020566	TGACA	2	10	345353	345362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020566	AAGAT	2	10	346412	346421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020566	GATAA	2	10	357658	357667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020566	TAAAA	2	10	369098	369107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020566	TTGTT	2	10	369403	369412	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020566	TATCA	3	15	372400	372414	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020566	GAATG	2	10	386662	386671	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020566	AGATA	2	10	393532	393541	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020566	AGAAT	2	10	393773	393782	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020566	TAAGG	2	10	393837	393846	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020566	ATTGT	2	10	395056	395065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020566	TAAAT	2	10	401295	401304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020566	AGATA	2	10	401398	401407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020566	ACAGT	2	10	405389	405398	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020566	CATAA	2	10	415873	415882	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020566	TAAAA	2	10	416097	416106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020566	AAAGT	2	10	429050	429059	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020566	AAATT	2	10	432229	432238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020566	GAAAA	2	10	442932	442941	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020566	ATAGC	2	10	443799	443808	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020566	TGAAA	2	10	443813	443822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020566	AATGC	2	10	443916	443925	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020566	TAAAG	2	10	444009	444018	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020566	CTCAC	2	10	445914	445923	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_020566	CAAAG	2	10	445939	445948	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020566	CTTAA	2	10	463565	463574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020566	TGGTG	2	10	481384	481393	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020566	CAACT	2	10	481955	481964	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_020566	TCGTG	2	10	483246	483255	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020566	TTAAT	2	10	483886	483895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020566	GATTG	2	10	485686	485695	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020566	GATTT	2	10	490614	490623	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020566	TCTGT	2	10	492791	492800	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020566	ATATA	2	10	493032	493041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020566	CAAAG	2	10	499580	499589	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020566	ATGGT	2	10	502014	502023	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020566	CATTA	2	10	502464	502473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020566	TTGAT	2	10	502741	502750	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020566	AAAAG	2	10	513957	513966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020566	AGACA	2	10	516723	516732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_020566	AAGTA	2	10	519158	519167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020566	TTAAA	2	10	521281	521290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020566	GATAA	2	10	521320	521329	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020566	GGTAA	2	10	526852	526861	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020566	TCGTG	2	10	527671	527680	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020566	GATTG	2	10	530022	530031	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020566	ATATA	2	10	536636	536645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020566	AAAAT	2	10	541411	541420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020566	TTTAT	2	10	541520	541529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020566	TTATG	2	10	544526	544535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020566	ATTTA	2	10	544671	544680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020566	ACAAT	2	10	546476	546485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_020566	AAATA	2	10	548965	548974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020566	TGAAT	2	10	550943	550952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020566	GTATA	2	10	551000	551009	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020566	TATAA	2	10	554717	554726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020566	GTTTA	2	10	570860	570869	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020566	TAAAG	2	10	575054	575063	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020566	GAAGC	2	10	576410	576419	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020566	ATATT	2	10	581191	581200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020566	TTAAC	2	10	584103	584112	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020566	AATTT	2	10	584188	584197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020566	ATAAA	2	10	592511	592520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020566	TAAAA	2	10	607976	607985	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020566	TTATA	2	10	608409	608418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020566	CACAT	2	10	608805	608814	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_020566	AGCAG	2	10	610605	610614	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020566	GTAAA	2	10	610814	610823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020566	ATGAT	2	10	617828	617837	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020566	TAATT	2	10	621315	621324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020566	TAAAT	2	10	630716	630725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020566	AAATT	2	10	632720	632729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020566	TAAAA	2	10	639615	639624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020566	CTATC	2	10	640417	640426	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_020566	ATTAA	2	10	641803	641812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020566	TTATT	2	10	641852	641861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020566	CAATA	2	10	641918	641927	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_020566	TTAAT	2	10	644544	644553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020566	AAATA	2	10	646809	646818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020566	ATTTT	2	10	646831	646840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020566	ATAAA	2	10	653523	653532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020566	TTTTA	2	10	657309	657318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020566	AAAGG	2	10	657630	657639	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020566	ATATA	2	10	660867	660876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020566	AAACT	2	10	664392	664401	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_020566	TTCAC	2	10	669605	669614	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_020566	TTTGT	2	10	673511	673520	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020566	AATGA	2	10	673584	673593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020566	GGTTG	2	10	680586	680595	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_020566	ATCAT	2	10	1097744	1097753	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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